New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 514867 = | 130 (5.400) | 111 (4.810) | 65/370 | NT | 49.2% | coding (907/918 nt) | qmcA | PHB domain‑containing protein |
? | NC_000913 | = 554450 | 105 (4.550) | intergenic (‑13/‑161) | ppiB/cysS | peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase B/cysteine‑‑tRNA ligase |
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
GCCATTGCCAGCGTACCACGGGTATTTTTCAGGCCGTTGTTGGCTTCGTTTTTGATCGGTTCTTTGGTGGCTTTTTGTTTCATGCCCGGTTCAAAACCG‑CCGCCCTGAATCATAAAGCCGTTGATAACACGGTGGAAAATGGTGTTGTTGTAAAAACCTTCGCGGCAGTAGTCCAGGAA‑GTTTTTAACTGTTTCAGGTGCTTTATCGTCAAAAGTTTTGATGACAATATCGCCGTGATTGGTGTGGAAAGTAACCATTTTTGCATCCTGTTCCGTTTGATTGGTGCTTCAACCCAGTTCGGGTCATATATAGGGTGGTGTTATAGCATAACCGCACGATCGGATCATCACGCAATGTATGCTGATTCGCGCGGGAAATATGGGTATTATACGCAACTCAATTACCCACACATGTCTAAACGGAATCTTCGATGCTAAAAATCTTCAATACTCTGACACGCCAAAAAGAGGAATTTAAGCCTATTCACGCCGGGGAAGTCGGCATGTACGTGTGTGGAATCACCGTTTACGAT > NC_000913/554181‑554712 | gCCATTGCCAGCGTACCACGGGTATTTTTCAGGCCGTTGTTGGCTTCGTTTTTGATCGGTTCTTTGGTGGCTTTTTTTTTTATTCCCGGTTTAAAACCG‑CCGCCCTGAATCATAAAGCCGTTGATAACACGGTGGAAAATGGTGTTTTTGTAAAAACCTTCGCGGCAGTAGTCCAGGAA‑GTTTTTAACTGTTTCAGGTTCTTTATCGTCCAAAGTTTTTATTACAATATCGCCGTGATTGGGGTGGGAAGTAACCATTTTTTCATCCTGTtccg < 1:166965‑M2/274‑5 (MQ=255) 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ttttttATGCCGTTGTTGTCTTCGTTTTTGATCGGTTCTTTGGTGGCTTTTTGTGTCATGCCCTGTTCAAAACCG‑CCTACCTGAATCATAAAGCCGTTGATAATACGGTGGAAAATGGTGTTGTTGTAAAAACCGTCGCGGCAGTAGTCCAGGAA‑GTTTTTAACTGTTTCAGGTGCTTTATCGTCAAAAGTTTTGATGACAATATCGCCGGTATTGGTGTGGAAAGTAACCATTTTTGCATCCTGTTCCGTTTGATTGGTGCTTCAACCCAGtt < 1:243926/274‑1 (MQ=255) ttttCAGGCCGTTGTTGGCTTCGTTTTTGATCGGTTCTTTGGTGGCTTTTTGTTTCATGCCCGGTTCAAAACCG‑CCGCCCTGAATCATAAAGCCGTTGATAACACGGTGGAAAATGGTGTTGTTGTAAAAACCTTCGCGGCAGTAGTCCAGGAA‑GTTTTTAACTGTTTCAGGTGCTTTATCGTCAAAAGTTTTGATGACAATATCGCCGTGATTGGTGTGGAAAGTAACCATTTTTGCATCCTGTTCCGTTTGATTGGTGCt < 1:31107/262‑1 (MQ=255) tttCAGGCCGTTGTTGGCTTCGTTTTTGATCGGTTCTTTGGTGGCTTTTTGTTTCATGCCCGGTTCAAAACCG‑CCGCCCTGAATCATAAAGCCGTTGATAACACGGTGGAAAATGGTGTTGTTGTAAAAACCTTCGCGGCAGTAGTCCAGGAA‑GTTTTTAACTGTTTCAGGTGCTTTATCGTCAAAAGTTTTGATGACAATATCGCCGTGATTGGTGTGGAAAGTAACCATTTTTGCATCCTGTTCCGTTTGATTGGTGCTTCAACCCAGtt < 1:155024/272‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |