| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4542682 = | 48 (0.730) | 5 (0.080) | 5/310 | NT | 8.3% | intergenic (+49/‑433) | fimE/fimA | regulator for fimA/type 1 fimbriae major subunit |
| ? | NC_000913 | 4542996 = | 65 (1.050) | intergenic (+363/‑119) | fimE/fimA | regulator for fimA/type 1 fimbriae major subunit | |||||
AGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGG‑CATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTCATTCTTCTCTCCAAAAACCACCTCATGCAATATAAACATCTATAAATAAAGATAACAATAGAATA > NC_000913/4542414‑4542927 | atctgGAACCTTAACCCATACTCATCCTCATATGTTAAGG‑TATGCTTTCAGTTATGAAGTGGCGGAGCGTGGGTCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGTAAAAAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTG < 1:500243‑M1/269‑1 (MQ=255) aaacccgacatcaactgcgcaagcggcgttaacaacttcccctttaaagtgaacggtcccaccattaaccgtcgtggcagcggccagagccgctgtagaactgagggacagagccgacagaacaacgattgccagagttttaattttcatgctgctttcctttcaaaaaactatttctaaatcgacatgggcagtcgttctgtacactttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTg > 2:163809‑M1/270‑272 (MQ=255) cctgcatcaactgcgccagcggcgttaacaccttcccctttaaagtgaacggtcccaccattaaccgtcgtggcagcggccagagacgctgtagaactgagggacagagccgacagaacaactattgccagagttttaattttcatgctgctttcctttcaaaaaactatttctaaatcgacatgggcagtcgttctgtacactttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacattt > 1:995252‑M1/266‑267 (MQ=255) aacccgacacgcagactTATTCTGATA‑GTTGAGGTCATGCTGGCGTTTATGAATTGGCAGGTCGTGGTGCAGATACTCGTTGAATACAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCC < 2:717570‑M1/263‑1 (MQ=255) gcatcaactgcgcaagcggcgttaacaacttcccctttaaagtgaacggtcccaccattaaccgtcgtggcagcggccagagccgctgtagaactgagggacagagccgacagaacaacgattgccagagttttaattttcatgctgctttcctttcaaaaaactatttctaaatcgacatgggcagtcgttctgtacactttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTGaggcaat < 1:26460‑M1/10‑4 (MQ=255) cGTATCGCAGACTAATCCTCATATGTTAAGA‑CATGCTTGCGGTTATGAAGTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATATCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGAAAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGGGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACt < 1:665980/272‑1 (MQ=255) cGTAACGCTGACTCATCCTCATTTGTTAATG‑CATGCTTGCGGTTTTGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCAATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAtttt < 2:324661‑M1/272‑5 (MQ=255) cGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGG‑CATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAttttgactc > 1:564464‑M1/1‑263 (MQ=255) tCATCCTCTGTTGTTAAGG‑CATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTAGGTGATCTAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCata < 1:436368/272‑1 (MQ=255) cATCCTCATATGTTAAGG‑CATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCAATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAAAAAATAAATACAAAAAAATTGGGGCCAttt > 1:324662‑M1/1‑255 (MQ=255) tCATATGTTAAGG‑CATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATT > 1:195353‑M1/1‑243 (MQ=255) cATATGTTAAGG‑CATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTG < 2:195353‑M1/243‑1 (MQ=255) ttttgtttttttttgtggttttgaatTGGCGGGGCGGGGTGAGGTTATTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAttttgactcatagaggaaagcatcgcgg < 2:564463‑M1/260‑29 (MQ=255) ttGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGAGGC > 1:128449‑M1/1‑230 (MQ=255) gCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGC > 1:732281‑M1/1‑228 (MQ=255) cGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCC < 2:732280‑M1/228‑1 (MQ=255) gAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTAttttt > 1:1072612/1‑247 (MQ=255) aGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTAtttttt < 2:1072611/247‑1 (MQ=255) cGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAACCGACAAAAAGAATCTaaa > 2:995531/1‑271 (MQ=255) ttAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAAAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGt > 1:1046706/1‑272 (MQ=255) tagaactgagggacagagccgacagaacaacgattgccagagttttaattttcatgctgctttcctttcaaaaaactatttctaaatcgacatgggcagtcgttctgtacactttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTTTTTGATATGt < 1:534427‑M1/98‑1 (MQ=255) gacagagccgacagaacaacgattgccagagttttaattttcatgctgctttcctttcaaaaaactatttctaaatcgacatgggcagtcgttctgtacactttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTggg < 1:7833‑M1/5‑1 (MQ=255) gacagagccgacagaacaacgattgccagagttttaattttcatgctgctttcctttcaaaaaactatttctaaatcgacatgggcagtcgttctgtacactttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTGGGGc < 2:323313‑M1/7‑1 (MQ=255) acagagccgacagaacaacgattgccagagttttaattttcatgctgctttcctttcaaaaaactatttctaaatcgacatgggcagtcgttctgtacactttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTgggg > 2:7833‑M1/163‑168 (MQ=255) acagagccgacagaacaacgattgccagagttttaattttcatgctgctttcctttcaaaaaactatttctaaatcgacatgggcagtcgttctgtacactttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTGGGGcc > 1:323314‑M1/163‑170 (MQ=255) aTCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGAAATGTAA‑ATTATTTCTAt > 2:113315/1‑272 (MQ=255) aTCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAAAGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCAACTAACAGTTTGATAATTAA‑AATAATTCAAt > 2:471189/1‑272 (MQ=255) ccATATTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTAAAAAAAAAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAAttt < 1:471190/272‑1 (MQ=255) aTACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTca < 1:113315/272‑1 (MQ=255) gtgCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCa > 1:260561/1‑272 (MQ=255) gTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTAAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCAACTAACTGTTTGAAAAGTAACATTA‑TTCCATTTTAAAATAATTTtacaaaaccaa > 2:529684/1‑265 (MQ=255) ttATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTcc < 2:260561/272‑1 (MQ=255) tataCCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAttttgactcatagaggaaagcatcgcggacaaactttttcagtttatttgttggcttaatattctattgttatctttatttatagatgtttatattgcatg > 1:789450‑M1/1‑144 (MQ=255) ataCCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTGAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAttttgactcatagaggaaagcatcgcggacaaactttttcagtttatttgttggcttaatattctattgttatctttatttatagatgtttatattgcatga < 2:789449‑M1/245‑103 (MQ=255) aCCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTcc > 2:847637/1‑268 (MQ=255) aCCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGAAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTcc < 1:847638/268‑1 (MQ=255) gTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGa > 2:770721/1‑218 (MQ=255) tAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGat < 1:770722/218‑1 (MQ=255) tatgttatttttGCCGGATTATGGGAAATAAATAATTTCATAAACAAAAAATTAAAAAGAGAAGATGTTTGATTTAATTTATTAATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAAAACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTGACGTATTTTTTCCCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTa < 1:810674/264‑1 (MQ=255) gTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAttttgactcatagaggaaagcatcgcggacaaactttttcagtttatttgttggcttaatattctattgttatctttatttatagatgtttatattgcatgaggtggtttttggagagaagaatgaggaagatgcgt > 1:67297‑M1/1‑122 (MQ=255) gTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGatat > 2:728232/1‑209 (MQ=255) gTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGa > 1:693863/1‑206 (MQ=255) gTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATAACCTCAGCTATATGTAAAGCTAACGttac > 1:475918/1‑270 (MQ=255) gTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGG > 2:659691‑M1/1‑118 (MQ=255) gTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATT > 1:469749‑M1/1‑115 (MQ=255) ttttGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAttttgactcatagaggaaagcatcgcggacaaactttttcagtttatttgttggcttaatattctattgttatctttatttatagatgtttatattgcatgaggtggtttttggagagaagaatgaggaagatgcgtc < 2:67297‑M1/259‑139 (MQ=255) ttttGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGat < 2:693862/206‑1 (MQ=255) ttttGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATg < 1:728233/209‑1 (MQ=255) ttttGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGG < 1:659692‑M1/118‑1 (MQ=255) ttttGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTG < 2:469748‑M1/115‑1 (MQ=255) tATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACg < 1:641895/272‑1 (MQ=255) aagaaaTAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACGCATCtt > 1:902764/1‑271 (MQ=255) aaCGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAttttgactcatagaggaaagcatcgcggacaaactttttcagtttatttgttggcttaatattctattgttatctttatt > 2:598163‑M1/1‑87 (MQ=255) aaCGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTATTTTCACATCACCTc > 2:131552/1‑213 (MQ=255) aaCGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACAACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTAACATCACCTCCGCTATATGTAACGCTACCGTTTCTGTAGCTAGACGCATCTTCCTAATTATTATATCCa > 1:956741/1‑272 (MQ=255) aCGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAttttgactcatagaggaaagcatcgcggacaaactttttcagtttatttgttggcttaatattctattgttatctttattt < 1:598164‑M1/167‑82 (MQ=255) aCGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTATTTTCACATCACCTcc < 1:131552/213‑1 (MQ=255) aaaaaaATAAGAAGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTAAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGCAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTCATTCTTCTCTCCAAAAACCACCTc < 1:1058887/272‑1 (MQ=255) attaaaaagagTTGTTATTTAACTTA‑TGTTACATAAATTTAAAAAAAAAAGAAAATACAACAAAAACTAGTCCAAACTGTCCGTATAAGTAATATGGTACTTATATTTTCTGATGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAATAATCGATCTGTTTTTTATGAAA‑AATATTTCTATTGTAAATTAATATCACATCACCTCCAATCTATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACTAATCTTCCTCATTCGTCTCTCCAAAAACCACCTCAt < 2:956740/266‑1 (MQ=255) actttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCACAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCt < 2:929652‑M1/166‑1 (MQ=255) ctttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCACAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTc > 1:929653‑M1/64‑230 (MQ=255) tttAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTaaaaaa > 1:738176/1‑116 (MQ=255) tttAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGAc > 1:406942/1‑218 (MQ=255) ttAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAAc < 2:738175/116‑1 (MQ=255) ttAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACg < 2:406941/218‑1 (MQ=255) tAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTAttttt > 1:134057/1‑89 (MQ=255) aaCTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTAtttttt < 2:134057/89‑1 (MQ=255) tATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAATACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTACCGTTTCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTAATTCTTCTCTCCAAAAACCACCTCATGCAATATAAACATCTAtaaataaa < 1:570962/272‑1 (MQ=255) tATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACTTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTATCGTTTCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTCATTCTTCTCTCCAAAAACCACCTCATGCAATATAAACATCTAtaaataaa < 1:1124668/272‑1 (MQ=255) tATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTatat > 1:705724/1‑184 (MQ=255) tATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTatat < 2:705723/184‑1 (MQ=255) tttata‑ataAAGTTAAAAAATAAAAAAAATACAAAACAATTGTGCACAAACTGTCCATTTCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTTTGTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTGCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTCATTCTTCTCTCCAAAAACCACCTCATGCAATATAAACATCTAtaaataaa < 1:1030780/267‑1 (MQ=255) ata‑ataAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTc > 2:506890/1‑161 (MQ=255) ta‑ataaAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCCCGACGCATCTTCCCCATTCTTCCCCCCAAAAACCCCCCCATGAAAAAAAAACAACTAaaaaaaaaaaaaaa > 2:570961/1‑266 (MQ=255) ta‑ataaAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATGGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTca < 1:506891/161‑1 (MQ=255) aacactgcacagtttccccccaaaagtggaaacatTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTCATTCTTCTCTCCAAAAACCACCTCATGCAATATAAACATCTATAAATAAAGATAAc > 2:745384‑M1/36‑272 (MQ=255) aaaGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACGCATATTCCTCATTCTTCCCTCCAAAAACCACCCCAATCAAAATAAAAAACTAaaaaaaaaaaaaaaaaaa > 2:1030779/1‑262 (MQ=255) aGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTc > 2:322383/1‑164 (MQ=255) gTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTcc < 1:322384/164‑1 (MQ=255) tAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTCATTCTTCTCTCCAAAAACCACCTCATGCAATATAAACATCTATAAATAAAGAaaaaaaaaaaaaa > 2:923220/1‑265 (MQ=255) gttttcccccaaaagatgaaacatTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTCATTCTTCTCTCCAAAAACCACCTCATGCAATATAAACATCTATAAATAAAGATaa < 1:745385‑M1/236‑1 (MQ=255) aCAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTAttt > 2:146248/1‑111 (MQ=255) cAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTc < 1:146248/111‑1 (MQ=255) aaTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAg > 1:906077/1‑151 (MQ=255) aTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGc < 2:906076/151‑1 (MQ=255) | AGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGG‑CATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATA‑ATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAA‑ATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTCATTCTTCTCTCCAAAAACCACCTCATGCAATATAAACATCTATAAATAAAGATAACAATAGAATA > NC_000913/4542414‑4542927 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |