| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,375,962 | C→T | 6.0% | A365V (GCC→GTC) | dcuD → | putative transporter DcuD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,375,962 | 0 | C | T | 6.0% | 216.6 / 4.3 | 67 | A365V (GCC→GTC) | dcuD | putative transporter DcuD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/32); new base T (2/2); total (32/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.22e-01 | |||||||||||
TTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTAGCGCGCGCGGTTTCGCCGATTACTGCGGTGGTGGTCGTTACGTCAGGAATTGCAGGCGTTTCGCCTTTTGCGGTGGTGAAGCGGACA > NC_000913/3375700‑3376173 | ttACTGAGGTTTACTGTGACGATGTTTGTGTAGTTCTTCCGCAAGAATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGAt < 1:944028/272‑1 (MQ=255) gAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCAtt < 1:112539/272‑1 (MQ=255) gAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGTCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAg > 1:630780/1‑271 (MQ=255) gAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCg > 1:801121/1‑234 (MQ=255) gAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGACGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCTCAg > 1:892867/1‑271 (MQ=255) aaaCAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGt < 2:801120/234‑1 (MQ=255) gtgCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCAtt > 1:3578/1‑195 (MQ=255) tgCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATtg < 2:3578/195‑1 (MQ=255) gTTTTTGTACGGCATGGGTACGCAGTTTGCGAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGATCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGtt < 1:1044606/271‑1 (MQ=255) tGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCaa > 2:1091050/1‑198 (MQ=255) gACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAAt < 1:1091051/198‑1 (MQ=255) tggtccaaaCGTGGTAACGGGTGTGGTGGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGGTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGGGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGTCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTg < 2:630779/265‑1 (MQ=255) gTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTGGCGGGTGATATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGTTTGGCACTGTCGTTGCGGTTATCGGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCTATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTg < 1:183657/272‑1 (MQ=255) ggTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATc > 1:586021/1‑208 (MQ=255) gTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCTGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATTGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCg < 1:4170/208‑1 (MQ=255) gtggtCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATTTACCAGCGGGTGTTATTATTATTCCGGTACATTTTTCCacgagcccaaccagcgg > 2:52091/1‑256 (MQ=255) tggtCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTTTGATGGGCTCTGGCAATGTGACGGTTATGTCTTTTGACAGTCTTATTCCGACTCTCGCAGCCGGACTACATATACCCCGGGTTTGAATGCTATTGCCAATGCAGTTTGCGACGCACCTGGCCCGCGCgggt > 2:402988/1‑270 (MQ=255) tggtCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGGCACGACGCTAGCGTGCGCGGtt > 1:303275/1‑272 (MQ=255) gtCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCAt > 1:519952/1‑172 (MQ=255) gtCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAg > 2:996038/1‑199 (MQ=255) gtCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGc > 2:389010/1‑200 (MQ=255) gtCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCAtttt > 1:1027344/1‑246 (MQ=255) tCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCAtt < 2:519951/172‑1 (MQ=255) tCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGcc < 1:389011/200‑1 (MQ=255) tCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGc < 1:996039/199‑1 (MQ=255) agggTGAAATATTTGCGAAAGGGTTAACGACGGTGGGCAGTGGTGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTGTGGCGGTGGTCATTGCCATTTGTGACATTGTGATGGGCTATGGCAATGCGGCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCTGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTAGCGCGCGCGGTTTCGcc < 1:402989/270‑1 (MQ=255) ggTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCAt > 2:227923/1‑166 (MQ=255) gTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCAtt < 1:227923/166‑1 (MQ=255) aaaTATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCAt > 1:414549/1‑162 (MQ=255) aaTATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCAtt < 2:414548/162‑1 (MQ=255) tGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTAGCGCGCGCGGTTTCGCCGATTACTGCggtg < 1:417571/271‑1 (MQ=255) ggCCCTGTCGTGGGGGTTTTTGGGGGGGCGGGGCGTTCT‑GGTCTGGGGGGTTTTGGCGTGATGATTATTATTGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCTCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTAGCGCGCGCGGTTTCGCCGATTACTGCGGTGGTGGTCGTTACGTCAGGAAtt < 2:892866/270‑1 (MQ=255) ggCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATtg > 1:152556/1‑100 (MQ=255) ggCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCgg > 2:502519/1‑181 (MQ=255) gCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATtgt < 2:152556/100‑1 (MQ=255) gCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGt < 1:502520/181‑1 (MQ=255) cGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGGTTTTGTCATTTTCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACCTGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCCGTGCATTTTGCCACGACGCTAGCGCGCGCGGTTTCGCCGATTTCTTCGGTGGTGGTCGTTACGTCAGGGATTGCAGGGGttt > 1:572048/1‑272 (MQ=255) aTGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCAtttt > 2:190855/1‑197 (MQ=255) aTGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTAGCGCGCGCGGTTTCGCCGATTACTGCGGTTGTGGGCGTTACGTCAGGGAATGccagcggtttg > 2:308036/1‑262 (MQ=255) tGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTg < 1:190855/197‑1 (MQ=255) 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ggggggCGGATCTTTCT‑GTTGTGGGGGGTATTGGTGTGTTGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCTTTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATGTGCCATTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTGTGCCACGACGCTAGCGCGCGCGGTTTCGCCGATTACTGCGGTGGTGGTCGTTACGTCAGGAATTGCAGGCGTTTCGCCTTTTGCggt < 1:174817/271‑1 (MQ=255) ggAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTAGCGCGCGCGGTTTCGCCGATTACTGCGGTGGTGGACGTTACGTCAGGAATTGCAGGGGTTTCGCATTTTGCGGTTGTGAAGc > 1:927845/1‑272 (MQ=255) ggAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGATGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCAAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTAGCGCGCGCGGTTTCGCCGATTACTGCGGTTGTGGTCGTTACGTCAGGAATTGCAGGCGTTTAGCATTTTTCGGTGGTGAAg > 1:650906/1‑271 (MQ=255) 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(MQ=255) attattATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGc > 2:270795/1‑98 (MQ=255) attattATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTa > 2:401950/1‑111 (MQ=255) attattATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTAcc > 2:813419/1‑113 (MQ=255) attattATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCgg > 2:231655/1‑118 (MQ=255) attattATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGt > 2:520312/1‑119 (MQ=255) ttattaTGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGcc < 1:270796/98‑1 (MQ=255) ttattaTGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTAc < 1:401951/111‑1 (MQ=255) ttattaTGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCa < 1:813420/113‑1 (MQ=255) ttattaTGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGtt < 1:520313/119‑1 (MQ=255) ttattaTGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGt < 1:231655/118‑1 (MQ=255) cgcTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTAGCGCGCGCGGTTTCGCCGAtt > 2:908358/1‑167 (MQ=255) gcTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTAGCGCGCGCGGTTTCGCCGATTa < 1:908359/167‑1 (MQ=255) cATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCg > 2:388543/1‑71 (MQ=255) aTTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGc < 1:388544/71‑1 (MQ=255) | TTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATTCT‑GGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATCGCAGCCGGACTACATGTACCAGCGGTTGTAATGATTATGCCGATGCATTTTGCCACGACGCTAGCGCGCGCGGTTTCGCCGATTACTGCGGTGGTGGTCGTTACGTCAGGAATTGCAGGCGTTTCGCCTTTTGCGGTGGTGAAGCGGACA > NC_000913/3375700‑3376173 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |