Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 275,607 | G→A | 6.8% | V95M (GTG→ATG) | mmuP → | S‑methyl‑L‑methionine transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 275,607 | 0 | G | A | 6.8% | 193.5 / 4.4 | 59 | V95M (GTG→ATG) | mmuP | S‑methyl‑L‑methionine transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (27/28); new base A (2/2); total (29/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.82e-01 |
CTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACA‑GGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTC > NC_000913/275352‑275801 | cTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTg < 1:192958/272‑1 (MQ=255) tGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTTCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCCGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGGGGGTTTCCGGTTTTTGCCGCGCGCCATCTTGGGTCGGGCAACGGGGTGTACGGTgggggggtggtgtgg > 2:581831/1‑259 (MQ=255) taagcgactaaTGAAAACGCGTCTCCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTGCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGGGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTAc < 1:581832/259‑1 (MQ=255) aaTGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTg > 1:931388/1‑270 (MQ=255) cACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTgg > 1:490670/1‑271 (MQ=255) cACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCGATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTa > 1:320219/1‑245 (MQ=255) caggtaTTAGGCTTTCTTTGGTCGGGGTGTTTGGCACAGGATTTTTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGt < 2:165643/267‑1 (MQ=255) ttGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGTTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACTTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTAacgcctg > 1:165643/1‑270 (MQ=255) ttcAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCt < 1:628919/194‑1 (MQ=255) cgtgTACATCATTGCCACCACTGGAGCGGCGGGAGCGCTGCTGGCCTATCTGTTTGGTGCGCTGGGGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACA‑GGTGCCg < 1:349328/268‑1 (MQ=255) aCATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCCATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCCGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGGGCGTTACCGCCCGTTGGTTCTGGATTCAGTCATGGTTTTCACACGGTGCgggatgg > 2:996047/1‑268 (MQ=255) catcatGTCCACCCCTGGAGGGGCGGGAACGCTGCGGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACA‑GGTGCCGGTATg < 1:996048/270‑1 (MQ=255) catTTCCACCGCTGGGGCGGCGGGATCGCTTGTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACA‑GGTGCCGGTATGGGTCt < 1:239755/272‑1 (MQ=255) catTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACA‑GGTGCCGGTATGGGTCt < 1:316517/272‑1 (MQ=255) catTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACA‑GGTGCCGGTATGGGTCt < 1:999393/272‑1 (MQ=255) ccacTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACCGGCTGACCTGGCCCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGGTTCTACA‑GGGGCCGGTATGGGTCTGGTGCgtg > 1:478744/1‑272 (MQ=255) cTGTTTGGTGCGTGGTTGGTCTGGTTGGTTTGGCCGTGTCTGGGCGGGCGGTCGGTCGCGATGCCGGGGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCTGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCATGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACA‑GGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGt < 2:163331/272‑1 (MQ=255) gATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGc > 2:988629/1‑129 (MQ=255) gATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTAccgccg > 2:1109559/1‑182 (MQ=255) gATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCt > 2:931243/1‑184 (MQ=255) aTTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGcc < 1:988630/129‑1 (MQ=255) aTTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACcgccgc < 1:1109560/182‑1 (MQ=255) aTTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTg < 1:931244/184‑1 (MQ=255) gTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCt > 1:1060887/1‑168 (MQ=255) gTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTCCTGGTTTCCACA‑GGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTTGTTTGAATTTTAtcac > 1:985341/1‑269 (MQ=255) tGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCg < 1:1055786/119‑1 (MQ=255) tGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCtt < 2:1060886/168‑1 (MQ=255) cTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGATTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGTCCCGTGGCGCTGGGTGCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTTGTTTTcacat > 1:896754/1‑203 (MQ=255) tggtggTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCTGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCATGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACA‑GGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCTGGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATg > 1:163331/1‑258 (MQ=255) tggtggTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGAGGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACA‑gg < 1:360667/204‑1 (MQ=255) tgtCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTAccgccg > 1:862478/1‑148 (MQ=255) gtCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACcgccgc < 2:862477/148‑1 (MQ=255) tGGGCGGGCTGTCGGTCGCGTTGCCGGAGACCGGAGCTTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACA‑GGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTtc < 1:868961/272‑1 (MQ=255) tGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACC‑GGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTTTCTCCACGCGCTTTTTTGCCTAAGGGGAGtttctgttt > 2:828726/1‑265 (MQ=255) gggCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTa > 1:277889/1‑99 (MQ=255) gggCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTAc > 1:438656/1‑100 (MQ=255) gggCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTg > 1:677473/1‑153 (MQ=255) ggCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTAc < 2:277888/99‑1 (MQ=255) ggCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACt < 2:438655/100‑1 (MQ=255) ggCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGt < 2:677472/153‑1 (MQ=255) tGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACA‑GGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGGGATTATCTTTGGTTTGAATGTTCTCTCCATCCGCTTTTTTTCCGCAGGGGGGTTCTGGtttccgttgggt > 2:868960/1‑262 (MQ=255) 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tttATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACA‑GGTGCCGGTATg < 1:141286/142‑1 (MQ=255) ccGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACA‑g > 2:35916/1‑125 (MQ=255) cgcgcgCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACA‑gg < 1:35916/125‑1 (MQ=255) gcTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCATGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACA‑GGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGa > 2:842395/1‑199 (MQ=255) cTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCATGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACA‑GGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGaa < 1:842396/199‑1 (MQ=255) tATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACA‑GGTGCCGGTATGGGTCTGGTg > 2:401803/1‑137 (MQ=255) aTCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACA‑GGTGCCGGTATGGGTCTGGTGc < 1:401804/137‑1 (MQ=255) cTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGc > 2:630241/1‑87 (MQ=255) tACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCa < 1:630242/87‑1 (MQ=255) aCCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTAccgccg > 2:758630/1‑70 (MQ=255) aCCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACA‑g > 1:52528/1‑102 (MQ=255) ccGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACcgccgc < 1:758631/70‑1 (MQ=255) ccGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACA‑gg < 2:52528/102‑1 (MQ=255) | CTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGGTTATGCAGTGTCTGGGCGAGCTGTCGGTCGCGATGCCGGAGACCGGAGCGTTTCACGTTTATGCCGCGCGCTATCTT‑GGTCCGGCTACCGGGTATACCGTGGCCTGGCTTTACTGGCTGACCTGGACCGTGGCGCTGGGTTCGAGCTTTACCGCCGCTGGATTCTGTATGCAGTACTGGTTTCCACA‑GGTGCCGGTATGGGTCTGGTGCGTGGTGTTCTGCGCGATTATTTTTGGTCTGAATGTTATCTCCACGCGCTTTTTTGCCGAAGGGGAGTTCTGGTTCTCGCTGGTC > NC_000913/275352‑275801 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |