| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,651,029 | IS2 (+) +5 bp | 91.4% | intergenic (+367/‑258) | arsC → / → yhiS | arsenate reductase/putative uncharacterized protein YhiS |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3187426 | NA (NA) | 42 (1.350) | 31/414 | NT | 91.1% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3651029 = | 4 (0.130) | intergenic (+367/‑262) | arsC/yhiS | arsenate reductase/putative uncharacterized protein YhiS | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3651033 | 4 (0.130) | 43 (1.380) | 35/414 | NT | 91.3% | intergenic (+371/‑258) | arsC/yhiS | arsenate reductase/putative uncharacterized protein YhiS |
| ? | NC_000913 | 4498181 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
TGACAGGCGTAGCGCATCAGGCGATTTTGCTATTTACACAGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTAAATAATTATAAGATACCTTAACCCATTTTATTATTACACATCTAAAACATCACAAAAAAAATCACTTCACACACTATCAGAGAACATAATAACTTTTTAAAATGAGCGCATTTTGATAGTTGTTAACGATTTCCTTTACGATACTATCACTACCCTTTTTTTACACACAAATATTACCGGGTGGAGATAAAAGGGAAATCAAAGGTAATTATATCAGGAAGATATAACGCATTACATTTATTGTGTGTAGAAGAAAATCCATTCCTGTTCTAATTATCCAATTTAAACATCTTAGCATAAAACAAATGATGAATAAGGAATTTTATG > NC_000913/3650790‑3651293 | tGACAGGCGTAGCGCATCAGGCGATTTTGCTATTTACACAGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTAAATAATTATAAGATACCTTAACCCATTTTATTATTACACATCTAAAACATCACAAAAAAAATCACTTtagactggccccctcaatacccaacaaa > 1:138072‑M1/1‑244 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |