| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 391,703 | (G)6→5 | pseudogene (1453/1458 nt) | yaiT → | putative autotransporter YaiT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 391,698 | 0 | G | . | 99.5% | 1080.5 / ‑1.8 | 209 | pseudogene (1448/1458 nt) | yaiT | putative autotransporter YaiT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base . (107/101); minor base A (1/0); total (108/101) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
AACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGT > NC_000913/391598‑391794 | aacGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACtgggtg > 1:586346/1‑101 (MQ=255) ggTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTgggg < 1:585891/101‑1 (MQ=255) gTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTggggg > 1:586349/1‑101 (MQ=255) ttcttcGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTgggggc < 2:586228/101‑2 (MQ=255) tcttcGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTgggggct < 1:585834/101‑3 (MQ=255) tcttcGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTgggggct > 2:586353/1‑99 (MQ=255) cttcGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTgggggctg < 2:586127/101‑4 (MQ=255) cttcGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTgggggctg < 2:585867/101‑4 (MQ=255) ttcGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTgggggctga > 2:586358/1‑97 (MQ=255) tcGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCtgat > 1:586359/1‑101 (MQ=255) tcGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCtgat < 1:585924/101‑1 (MQ=255) tGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACtgggtg > 1:586364/1‑88 (MQ=255) tGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCtgattgat < 1:585595/101‑1 (MQ=255) tGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCtgattgat > 2:586363/1‑101 (MQ=255) tGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTACTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCtgattgat < 2:585904/101‑1 (MQ=255) aCATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCt > 1:586368/1‑101 (MQ=255) aTTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTAc < 2:585878/101‑1 (MQ=255) ggTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCa < 2:585841/101‑1 (MQ=255) gTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCAc < 2:585827/101‑1 (MQ=255) gTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCAc > 1:586372/1‑101 (MQ=255) tGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACg > 2:586374/1‑101 (MQ=255) aaGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTa > 2:586376/1‑101 (MQ=255) aGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTaa > 2:586378/1‑101 (MQ=255) gATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAat < 1:586088/101‑1 (MQ=255) aTGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAata < 1:585954/101‑1 (MQ=255) aTGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAata > 1:586380/1‑101 (MQ=255) tGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAatat < 2:585959/101‑1 (MQ=255) tGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAatat < 2:585699/101‑1 (MQ=255) ggCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATg > 1:586383/1‑101 (MQ=255) gCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATgg < 2:586026/101‑1 (MQ=255) cTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACtgggtggg < 1:585957/71‑1 (MQ=255) cTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGa > 2:586386/1‑101 (MQ=255) aCGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGaca > 2:586389/1‑101 (MQ=255) cGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGacac < 1:586028/101‑1 (MQ=255) gTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGAcaca < 1:585718/101‑1 (MQ=255) gTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGAcaca < 2:585932/101‑1 (MQ=255) gTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGAcaca > 1:586391/1‑101 (MQ=255) tGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAgg < 2:585923/101‑1 (MQ=255) gATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGc < 1:585792/101‑1 (MQ=255) gATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGc < 2:586032/101‑1 (MQ=255) gATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGc > 2:586392/1‑101 (MQ=255) tACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCt > 1:586395/1‑101 (MQ=255) aCCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTa < 1:585983/101‑1 (MQ=255) aCCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTa < 2:586055/101‑1 (MQ=255) ccGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTaa > 1:586399/1‑101 (MQ=255) cGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAg > 2:586402/1‑101 (MQ=255) gATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGc > 1:586403/1‑101 (MQ=255) gATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGc < 1:585944/101‑1 (MQ=255) atcatcTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCg > 2:586405/1‑101 (MQ=255) atcTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAgg > 2:586407/1‑101 (MQ=255) tGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTAGCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTc > 1:586409/1‑101 (MQ=255) tGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAgg > 1:586412/1‑98 (MQ=255) tGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTc < 2:585997/101‑1 (MQ=255) gACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCt < 1:585479/101‑1 (MQ=255) aCTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCtt < 1:586014/101‑1 (MQ=255) tATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGt < 2:585967/101‑1 (MQ=255) aTTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGtt > 1:586416/1‑101 (MQ=255) ttAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGttt > 2:586417/1‑101 (MQ=255) ttAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGttt < 1:586067/101‑1 (MQ=255) tAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGGCTAAGCGAGGTTCTTGtttt < 2:586063/101‑1 (MQ=255) tAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGtttt > 2:586419/1‑101 (MQ=255) aCTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCa > 1:586421/1‑101 (MQ=255) aCTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCa > 1:586423/1‑101 (MQ=255) aCTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCa < 1:586201/101‑1 (MQ=255) aCTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCa > 2:586428/1‑101 (MQ=255) aCTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCa > 1:586426/1‑101 (MQ=255) cTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCaa < 1:585883/101‑1 (MQ=255) cTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCaa > 1:586430/1‑101 (MQ=255) cTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCaa < 1:586072/101‑1 (MQ=255) tCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCaaa > 1:586432/1‑101 (MQ=255) ccTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAAt < 2:585915/101‑1 (MQ=255) ccTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAAt < 2:586009/101‑1 (MQ=255) cTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAAtt < 2:586259/101‑1 (MQ=255) tACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTg < 2:586075/101‑1 (MQ=255) cAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGtt < 2:586044/101‑1 (MQ=255) cAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGtt > 1:586435/1‑101 (MQ=255) aGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTaa > 1:586437/1‑75 (MQ=255) gTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTcc < 2:585951/101‑1 (MQ=255) tACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCg > 1:586440/1‑101 (MQ=255) cTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTc > 2:586445/1‑97 (MQ=255) cTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGa > 1:586444/1‑101 (MQ=255) gTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACt < 2:586168/101‑1 (MQ=255) tGCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGa > 1:586447/1‑101 (MQ=255) gCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAg > 2:586450/1‑101 (MQ=255) gCGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAg < 2:586001/101‑1 (MQ=255) cGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAAtt > 1:586451/1‑87 (MQ=255) cGTTGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAgg < 2:586121/101‑1 (MQ=255) ttGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGgcc < 2:585658/101‑1 (MQ=255) tGACCGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGgccg > 1:586454/1‑101 (MQ=255) ccGAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCca > 2:586457/1‑101 (MQ=255) gAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCcaca > 1:586460/1‑101 (MQ=255) gAATCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCcaca < 1:585992/101‑1 (MQ=255) aaTCTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCacac > 2:586461/1‑101 (MQ=255) cTACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCaa > 1:586464/1‑101 (MQ=255) tACTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTATTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAAc > 2:586465/1‑101 (MQ=255) aCTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACt > 2:586470/1‑101 (MQ=255) aCTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACt < 2:586094/101‑1 (MQ=255) aCTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACt > 1:586469/1‑101 (MQ=255) aCTGGGT‑GGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACt < 1:585912/101‑1 (MQ=255) tgggt‑gggGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGa > 1:586474/1‑83 (MQ=255) | AACGGTTCTTCGCTGAACATTGGTGAAGATGGCTACGTTGATACCGATCATCTGACTATTAACTCCTACAGTACTGTTGCGTTGACCGAATCTACTGGGTGGGGGGCTGATTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGT > NC_000913/391598‑391794 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |