Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,767,507 | (C)7→8 | intergenic (+152/‑203) | rnlB → / → yfjP | CP4‑57 prophage; antitoxin RnlB/CP4‑57 prophage; putative GTP‑binding protein YfjP |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,767,500 | 1 | . | C | 95.1% | 892.2 / 30.3 | 224 | intergenic (+145/‑210) | rnlB/yfjP | CP4‑57 prophage; antitoxin RnlB/CP4‑57 prophage; putative GTP‑binding protein YfjP |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/9); new base C (96/117); total (98/126) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.18e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
CATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTCTG > NC_000913/2767400‑2767595 | cATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAtt‑t > 2:4025079/1‑101 (MQ=255) aTGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAtt‑t < 1:4024785/101‑1 (MQ=255) aTGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑c < 2:4024497/101‑1 (MQ=255) aTGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑c < 2:4024741/101‑1 (MQ=255) ttAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑ccccccc < 1:4024639/101‑1 (MQ=255) tAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑cccccccc < 1:4024895/101‑2 (MQ=255) aaCTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑cccccccct < 2:4024714/101‑3 (MQ=255) aCTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑cccccccct < 1:4024604/101‑3 (MQ=255) aCTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑cccccccct < 1:4024879/101‑3 (MQ=255) gTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTaaa < 1:4024359/101‑1 (MQ=255) tCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTaaa < 1:4024934/101‑1 (MQ=255) ccAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACt < 2:4024779/101‑1 (MQ=255) ccAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACt < 2:4024834/101‑1 (MQ=255) cAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACtt < 1:4024842/101‑1 (MQ=255) aaTATGATCAAATAGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTtc < 2:4024675/101‑1 (MQ=255) gATCAAATAGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAAAACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCaat > 2:4025110/1‑101 (MQ=255) aTCAAATAGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑CCCCCCCcttta > 1:4025113/1‑87 (MQ=255) cAAATAGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCaataat < 1:4024661/101‑1 (MQ=255) aaaTAGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATg < 1:4024561/101‑1 (MQ=255) aaaTAGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑c > 2:4025119/1‑75 (MQ=255) aaTAGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGt > 1:4025122/1‑101 (MQ=255) aTAGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTc < 2:4024970/101‑1 (MQ=255) tAGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCa < 2:4024104/101‑1 (MQ=255) tAGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCa < 2:4024801/101‑1 (MQ=255) aGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑cac > 1:4025126/1‑71 (MQ=255) aTTAACCCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCa > 2:4025129/1‑101 (MQ=255) ttAA‑CCCCACCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTc > 1:4025131/1‑96 (MQ=255) aa‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAAttt < 1:4024824/101‑1 (MQ=255) cccc‑cccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAAt < 1:4024797/97‑1 (MQ=255) cccc‑cccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTc < 1:4024601/101‑1 (MQ=255) ccc‑cccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCt < 2:4024609/101‑1 (MQ=255) cc‑cccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTg > 2:4025141/1‑101 (MQ=255) cc‑cccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTg > 1:4025138/1‑101 (MQ=255) cc‑cccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTg > 1:4025140/1‑101 (MQ=255) c‑cccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTgg < 1:4024710/101‑1 (MQ=255) c‑cccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTgg < 2:4024913/101‑1 (MQ=255) ccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGaa < 2:4024726/101‑1 (MQ=255) ccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGaa < 2:4024811/101‑1 (MQ=255) cTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGaaa > 2:4025143/1‑101 (MQ=255) cTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGaaa > 2:4025146/1‑101 (MQ=255) cacaACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATc > 1:4025148/1‑101 (MQ=255) acaACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATcc < 2:4024854/101‑1 (MQ=255) caACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCt < 1:4024479/101‑1 (MQ=255) caACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCt < 2:4024788/101‑1 (MQ=255) aaCGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTa > 2:4025152/1‑101 (MQ=255) aaCGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTa > 1:4025154/1‑101 (MQ=255) aCGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTat > 2:4025156/1‑101 (MQ=255) cGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatg < 1:4024804/101‑1 (MQ=255) tCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatgat < 1:4024702/101‑1 (MQ=255) tCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatgat > 1:4025159/1‑101 (MQ=255) ccTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatgatg > 2:4025160/1‑101 (MQ=255) tGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGcc > 2:4025163/1‑101 (MQ=255) tGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGcc > 2:4025165/1‑101 (MQ=255) gCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCt > 2:4025169/1‑101 (MQ=255) gCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCt < 2:4024765/101‑1 (MQ=255) cATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCtt > 2:4025171/1‑101 (MQ=255) aTAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCATCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCttt > 2:4025175/1‑101 (MQ=255) aTAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCttt > 1:4025174/1‑101 (MQ=255) tAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTc < 2:4024925/101‑1 (MQ=255) aGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTcc > 1:4025180/1‑101 (MQ=255) aGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTcc > 2:4025179/1‑101 (MQ=255) aGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTcc > 2:4025182/1‑101 (MQ=255) ggAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCg < 1:4024682/101‑1 (MQ=255) gAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTCC‑‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCgg < 1:4025049/101‑1 (MQ=255) aaCACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGt < 1:4024906/101‑1 (MQ=255) aaCACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGt < 1:4024773/101‑1 (MQ=255) acacGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTa < 1:4024806/101‑1 (MQ=255) acacGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTa > 1:4025186/1‑101 (MQ=255) acGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTaaa > 1:4025188/1‑101 (MQ=255) cGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAAt < 2:4024886/101‑1 (MQ=255) cGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑cccccccc < 1:4024757/39‑2 (MQ=255) gTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATg < 2:4024873/101‑1 (MQ=255) gTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATg > 2:4025190/1‑101 (MQ=255) ttttCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TCCCCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATg < 2:4024945/101‑1 (MQ=255) ttttCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATgg < 2:4024868/101‑1 (MQ=255) ttttCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATgg < 1:4024849/101‑1 (MQ=255) tttCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGt < 2:4024466/101‑1 (MQ=255) tttCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGt < 2:4025054/101‑1 (MQ=255) ttCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TCCCCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGt > 2:4025193/1‑101 (MQ=255) cccTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCtg < 2:4024820/101‑1 (MQ=255) tgtgCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGa < 1:4024830/101‑1 (MQ=255) gtgCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAg > 1:4025197/1‑101 (MQ=255) tgCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGt < 1:4024923/101‑1 (MQ=255) gCACCCACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGtt > 2:4025198/1‑101 (MQ=255) cccACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCaata < 1:4024648/39‑1 (MQ=38) cccACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatga < 1:4024874/68‑1 (MQ=255) cccACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAg > 1:4025200/1‑101 (MQ=255) ccACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGa > 2:4025203/1‑101 (MQ=255) cACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGaa > 2:4025206/1‑101 (MQ=255) cACGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGaa > 1:4025208/1‑101 (MQ=255) aCGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTc < 1:4024737/51‑1 (MQ=39) aCGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGaaa < 1:4024768/101‑1 (MQ=255) aCGACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGaaa < 2:4024897/101‑1 (MQ=255) gACTAAATTCC‑‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGa < 1:4024863/101‑1 (MQ=255) gACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGaa > 2:4025214/1‑98 (MQ=255) gACTAAATT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGa > 1:4025210/1‑101 (MQ=255) aaaTT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTCt > 2:4025217/1‑101 (MQ=255) aaaTT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTCt > 2:4025219/1‑101 (MQ=255) aaaTT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTCt < 1:4024749/101‑1 (MQ=255) aaTT‑TC‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTCTg < 1:4025101/101‑1 (MQ=255) | CATGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAA‑CCCC‑CCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑CCCCCCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTCTG > NC_000913/2767400‑2767595 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |