| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,338,141 | (C)5→6 | coding (321/552 nt) | mlaD ← | intermembrane phospholipid transport system, substrate binding protein MlaD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,338,136 | 1 | . | C | 99.6% | 1048.2 / ‑5.0 | 249 | E109G (GAA→GGA) | mlaD | intermembrane phospholipid transport system, substrate binding protein MlaD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); major base C (107/141); minor base A (1/0); total (108/141) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.34e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
CACCATCGCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTT‑CCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAG > NC_000913/3338036‑3338231 | cACCATCGCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGtt < 1:4891065/101‑1 (MQ=255)cACCATCGCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGtt < 2:4890864/101‑1 (MQ=255) cATCGCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTT‑ccc < 2:4891100/101‑1 (MQ=255) aTCGCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTT‑cccc < 1:4891333/101‑1 (MQ=255) aTCGCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTT‑cccc > 1:4891627/1‑101 (MQ=255) cGCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTT‑cccccc > 1:4891630/1‑100 (MQ=255) gCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTT‑cccccca > 2:4891632/1‑99 (MQ=255) cAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTT‑ccccccag < 2:4891036/101‑4 (MQ=255) gACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTT‑ccccccagca > 2:4891636/1‑96 (MQ=255) gACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTT‑ccccccagca > 2:4891639/1‑96 (MQ=255) aCTTATTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCcagcag < 2:4890999/101‑1 (MQ=255) aCTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCcagcag < 2:4891262/101‑1 (MQ=255) aCTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCcagcag < 1:4891172/101‑1 (MQ=255) aCTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCcagcag > 1:4891640/1‑101 (MQ=255) cTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAgg < 1:4891505/101‑1 (MQ=255) tAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGcc > 1:4891644/1‑101 (MQ=255) aGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGAAGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCg > 2:4891647/1‑101 (MQ=255) tgtCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGa > 1:4891649/1‑101 (MQ=255) tCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAg < 1:4891087/101‑1 (MQ=255) ccTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGt > 1:4891652/1‑101 (MQ=255) aaTTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGa > 2:4891656/1‑101 (MQ=255) aaTTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGa < 1:4891204/101‑1 (MQ=255) aTTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGaa < 2:4891252/101‑1 (MQ=255) ttGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAAt < 2:4891083/101‑1 (MQ=255) gTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCgg > 2:4891660/1‑89 (MQ=255) aTCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTc > 1:4891664/1‑101 (MQ=255) tCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCa < 2:4891090/101‑1 (MQ=255) gCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGc < 2:4891113/101‑1 (MQ=255) aTCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGaa > 1:4891668/1‑101 (MQ=255) aTCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGaa > 2:4891667/1‑101 (MQ=255) tCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAAc > 2:4891671/1‑101 (MQ=255) cTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTg < 2:4891295/101‑1 (MQ=255) tCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGt < 2:4891240/101‑1 (MQ=255) cAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTa > 1:4891674/1‑101 (MQ=255) aGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTAt < 1:4890972/101‑1 (MQ=255) gATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCt < 2:4891281/101‑1 (MQ=255) gATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCt < 1:4891155/101‑1 (MQ=255) aTAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTg < 1:4891314/101‑1 (MQ=255) aTAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTg < 2:4891276/101‑1 (MQ=255) tAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTgg < 2:4891492/101‑1 (MQ=255) aGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGa < 1:4891223/101‑1 (MQ=255) cAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAAt < 2:4891177/101‑1 (MQ=255) cAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTACCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAAt > 1:4891678/1‑101 (MQ=255) aGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAAtg > 2:4891680/1‑101 (MQ=255) gTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAAtgt > 1:4891683/1‑101 (MQ=255) ccAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCg > 1:4891688/1‑79 (MQ=255) cAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTta > 1:4891690/1‑101 (MQ=255) cAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTta < 1:4891146/101‑1 (MQ=255) aGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTtat > 2:4891692/1‑101 (MQ=255) aGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTtat < 1:4891621/101‑1 (MQ=255) aGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTtat > 2:4891695/1‑101 (MQ=255) gTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTtata > 1:4891697/1‑101 (MQ=255) gTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTtata < 2:4891145/101‑1 (MQ=255) ttCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATaa > 1:4891700/1‑101 (MQ=255) cGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACgt > 2:4891703/1‑101 (MQ=255) gggTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACgtt < 1:4891260/101‑1 (MQ=255) ggTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACgttg < 1:4891289/101‑1 (MQ=255) ggTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACgttg > 2:4891708/1‑101 (MQ=255) gTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACgttgt < 1:4891336/101‑1 (MQ=255) gTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACgttgt > 1:4891709/1‑101 (MQ=255) cTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTc < 2:4891415/101‑1 (MQ=255) ttCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAAc < 1:4891447/93‑1 (MQ=255) ttCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCa < 1:4891414/101‑1 (MQ=255) tCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCaa < 1:4891400/101‑1 (MQ=255) tCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCaa > 1:4891712/1‑101 (MQ=255) cAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAAt > 2:4891714/1‑101 (MQ=255) cAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAAt > 1:4891717/1‑101 (MQ=255) aaaaCCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAAtt > 1:4891719/1‑101 (MQ=255) aaCCGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTc < 2:4891190/101‑1 (MQ=255) ccGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCa < 2:4891360/101‑1 (MQ=255) ccGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCa > 1:4891724/1‑101 (MQ=255) ccGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCa < 2:4891224/101‑1 (MQ=255) ccGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCa < 1:4891365/101‑1 (MQ=255) cGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCGGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAg < 1:4891008/101‑1 (MQ=255) cGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAg < 1:4891249/101‑1 (MQ=255) cGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAg < 1:4891378/101‑1 (MQ=255) cGACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAg < 1:4891467/101‑1 (MQ=255) gACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGc < 1:4891234/101‑1 (MQ=255) gACGTTTAATGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGCATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGc > 2:4891725/1‑101 (MQ=255) 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aaTGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTAcgc > 2:4891738/1‑101 (MQ=255) aaTGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTAcgc < 2:4891304/101‑1 (MQ=255) aTGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTAcgcg > 1:4891741/1‑101 (MQ=255) aTGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTAcgcg < 2:4891339/101‑1 (MQ=255) aTGCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTAcgcg < 2:4891344/101‑1 (MQ=255) gCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTAcgcgcg > 1:4891744/1‑101 (MQ=255) gCCAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTAcgcgcg < 2:4891388/101‑1 (MQ=255) ccAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCgg < 2:4891214/101‑1 (MQ=255) cAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGc > 1:4891747/1‑101 (MQ=255) cAGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGc < 1:4891273/101‑1 (MQ=255) aGATATTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCa > 2:4891749/1‑101 (MQ=255) atatTGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGa < 2:4891312/101‑1 (MQ=255) ttGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAg < 2:4891540/101‑1 (MQ=255) ttGTTCCCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAg < 2:4891350/101‑1 (MQ=255) | CACCATCGCAGACTTAGTGTCCTGAATTGTATCGCCATCCTTCAGGATAGCAGTCCCCAGTTCCGGGTCTTCAAAACCGACGTTTAATGCCAGATATTGTT‑CCCCCAGCAGGCCGGAAGTACGAATGCTCAGCGAACTGGTATCTGGAATGTGGTTATAACGTTGTTCAATTTCCAGCGTTACGCGCGGCAGATAG > NC_000913/3338036‑3338231 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |