| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,296,381 | +GC | intergenic (+587/+55) | gltP → / ← yjcO | glutamate/aspartate : H(+) symporter GltP/Sel1 repeat‑containing protein YjcO |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,296,380 | 1 | . | C | 100.0% | 385.6 / NA | 98 | intergenic (+586/+56) | gltP/yjcO | glutamate/aspartate : H(+) symporter GltP/Sel1 repeat‑containing protein YjcO |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base C (45/53); total (45/53) | |||||||||||
| * | NC_000913 | 4,296,380 | 2 | . | G | 100.0% | 390.4 / NA | 98 | intergenic (+586/+56) | gltP/yjcO | glutamate/aspartate : H(+) symporter GltP/Sel1 repeat‑containing protein YjcO |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base G (45/53); total (45/53) | |||||||||||
CCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTA‑‑CCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCC > NC_000913/4296341‑4296471 || ccTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTaa < 2:6356641/101‑1 (MQ=2)ccTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTaa > 2:6356935/1‑101 (MQ=2) cTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAAc > 1:6356936/1‑101 (MQ=0) tGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAAcc > 2:6356938/1‑101 (MQ=255) tGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAAcc < 1:6356614/101‑1 (MQ=255) tGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAAcc < 1:6356593/101‑1 (MQ=255) tGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAAcc < 1:6356549/101‑1 (MQ=255) gATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCg < 1:6356568/101‑1 (MQ=255) gATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCg > 1:6356941/1‑101 (MQ=255) gATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCg > 1:6356940/1‑101 (MQ=255) gATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCg < 1:6356609/101‑1 (MQ=255) gATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCg > 2:6356939/1‑101 (MQ=255) aTTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGt > 1:6356944/1‑101 (MQ=255) aTTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGt > 1:6356943/1‑101 (MQ=255) aTTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGt < 1:6356585/101‑1 (MQ=255) aTTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGt < 1:6356318/101‑1 (MQ=255) aTTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGt < 1:6356515/101‑1 (MQ=255) tttAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGtt > 2:6356946/1‑101 (MQ=255) tttAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGtt < 2:6356323/101‑1 (MQ=255) tttAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGtt > 2:6356945/1‑101 (MQ=255) ttAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTg > 2:6356948/1‑101 (MQ=255) ttAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTg < 1:6356578/101‑1 (MQ=255) tAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTgg < 1:6356554/101‑1 (MQ=255) tAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTgg < 1:6356583/101‑1 (MQ=255) tAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTgg < 2:6356675/101‑1 (MQ=255) aGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGt > 2:6356951/1‑101 (MQ=255) aGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGt > 2:6356950/1‑101 (MQ=255) aGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTCGt < 1:6356610/101‑1 (MQ=11) cGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTa < 1:6356329/101‑1 (MQ=255) cGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTa < 1:6356435/101‑1 (MQ=255) gTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTaa > 1:6356956/1‑101 (MQ=255) gTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTaa > 2:6356953/1‑101 (MQ=255) gTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTaa < 1:6356594/101‑1 (MQ=255) gTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTaa > 2:6356952/1‑101 (MQ=255) gTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTaa > 2:6356954/1‑101 (MQ=255) gTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTaa > 2:6356955/1‑101 (MQ=255) tGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAt > 2:6356957/1‑101 (MQ=255) tGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAt < 1:6356482/101‑1 (MQ=255) gATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAtt < 2:6356328/101‑1 (MQ=255) gATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAtt < 1:6355848/101‑1 (MQ=255) gATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAtt < 1:6356545/101‑1 (MQ=255) 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1:6356643/87‑1 (MQ=11) ttGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTc < 2:6356357/101‑1 (MQ=255) tGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCa < 1:6356563/101‑1 (MQ=255) tGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCa > 2:6356965/1‑101 (MQ=255) tGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCa < 1:6356320/101‑1 (MQ=255) gTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCaa < 1:6356203/101‑1 (MQ=255) tAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCaaa > 2:6356969/1‑101 (MQ=255) tAGGTCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCaaa > 2:6356968/1‑101 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |