| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,027,073 | T→C | E315E (GAA→GAG) | dgcQ ← | putative diguanylate cyclase DgcQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,027,073 | 0 | T | C | 98.3% | 991.2 / 3.3 | 241 | E315E (GAA→GAG) | dgcQ | putative diguanylate cyclase DgcQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/3); new base C (102/134); total (103/138) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.37e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.52e-01 | |||||||||||
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
CTTAACGTATGGACACGCACCAGCACACCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGTTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAGGTCAAAAATCTCAGCTTACTGT > NC_000913/2026975‑2027170 | cTTAACGTATGGACACGCACCAGCACACCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTc > 1:2949493/1‑101 (MQ=255) ttAACGTATGGACACGCACCAGCACACCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTcc > 2:2949495/1‑101 (MQ=255) ttAACGTATGGACACGCACCAGCACACCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTcc < 2:2949089/101‑1 (MQ=255) tAACGTATGGACACGCACCAGCACACCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCa < 2:2949182/101‑1 (MQ=255) tAACGTATGGACACGCACCAGCACACCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCa > 1:2949496/1‑101 (MQ=255) aCGTATGGACACGCACCAGCACACCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCAtt < 2:2949172/101‑1 (MQ=255) gTATGGACACGCACCAGCACACCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGc > 1:2949499/1‑101 (MQ=255) gTATGGACACGCACCAGCACACCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCAAGCTCCATTGc < 2:2949221/101‑1 (MQ=255) ggACACGCACCAGCACACCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTgc < 2:2949206/101‑1 (MQ=255) acGCACCAGCACACCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCa < 1:2949038/101‑1 (MQ=255) acGCACCAGCACACCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCa > 1:2949504/1‑101 (MQ=255) cGCACCAGCACACCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAg < 1:2949111/101‑1 (MQ=255) gCACCAGCACACCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGc < 1:2949170/101‑1 (MQ=255) cAGCACACCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAgg < 2:2949051/101‑1 (MQ=255) cacaCCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCa > 1:2949510/1‑95 (MQ=255) cacaCCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCa < 2:2949276/101‑1 (MQ=255) cacaCCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCa > 2:2949509/1‑101 (MQ=255) acacCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAg < 2:2949128/101‑1 (MQ=255) cacCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGt < 1:2949084/101‑1 (MQ=255) acCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGtt < 1:2949238/101‑1 (MQ=255) acCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGtt > 1:2949513/1‑101 (MQ=255) ccGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTc < 1:2948948/101‑1 (MQ=255) ccGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTc < 1:2949196/101‑1 (MQ=255) ccGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTc < 2:2949141/101‑1 (MQ=255) cGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCa < 1:2949218/101‑1 (MQ=255) tCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACg > 2:2949515/1‑101 (MQ=255) cGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGa < 1:2949341/101‑1 (MQ=255) gAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAg > 1:2949519/1‑101 (MQ=255) gAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAg > 1:2949517/1‑101 (MQ=255) aaaTGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAgg < 1:2949019/101‑1 (MQ=255) aaaTGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAgg > 1:2949522/1‑101 (MQ=255) aTGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGAt > 2:2949524/1‑101 (MQ=255) aTGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGAt < 2:2949134/101‑1 (MQ=255) gTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCaa < 1:2949265/101‑1 (MQ=255) tCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCTATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGTTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCaaa > 1:2949528/1‑101 (MQ=255) tCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCaaa < 1:2948887/101‑1 (MQ=255) cAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCaaaaa > 2:2949532/1‑101 (MQ=255) aGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAat > 2:2949534/1‑101 (MQ=255) gACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAata < 1:2949201/101‑1 (MQ=255) cGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATAtt < 2:2949116/101‑1 (MQ=255) gTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTc > 1:2949537/1‑101 (MQ=255) ttCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGa < 2:2949279/85‑1 (MQ=255) tCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTccc > 1:2949539/1‑101 (MQ=255) cccAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCt > 2:2949544/1‑101 (MQ=255) cccAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCt < 2:2949208/101‑1 (MQ=255) cccAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCt > 2:2949541/1‑101 (MQ=255) ccAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTg < 2:2949271/101‑1 (MQ=255) ccAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTg > 1:2949545/1‑101 (MQ=255) ccAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTg < 1:2948985/101‑1 (MQ=255) aGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGtt < 2:2949299/101‑1 (MQ=255) cTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTgg < 2:2948881/101‑1 (MQ=255) cTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTgg < 2:2949155/101‑1 (MQ=255) cTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTgg > 1:2949548/1‑101 (MQ=255) cTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTgg > 2:2949549/1‑101 (MQ=255) aCATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGTTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATg < 2:2949252/101‑1 (MQ=255) aCATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCTCGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATg < 1:2949240/101‑1 (MQ=255) aCATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATg > 1:2949553/1‑101 (MQ=255) aCATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATg < 2:2949005/101‑1 (MQ=255) cATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGATCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATgg < 1:2949152/101‑1 (MQ=255) aTAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGt > 2:2949555/1‑101 (MQ=255) tAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTc > 1:2949558/1‑101 (MQ=255) aGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCa < 2:2949071/101‑1 (MQ=255) cGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAgg > 2:2949560/1‑101 (MQ=255) aCTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGAt < 1:2949231/101‑1 (MQ=255) aCTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGAt > 2:2949563/1‑101 (MQ=255) cTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGAtt < 2:2949501/101‑1 (MQ=255) cTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGAtt > 1:2949564/1‑101 (MQ=255) tGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTg > 2:2949567/1‑101 (MQ=255) tGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTg < 1:2949418/101‑1 (MQ=255) gTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTCCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAgg > 1:2949569/1‑96 (MQ=255) ccATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGaa < 1:2949162/101‑1 (MQ=255) aTACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAaga < 1:2949096/101‑1 (MQ=255) aTACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAaga < 2:2949244/101‑1 (MQ=255) tACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAagag < 1:2949131/101‑1 (MQ=255) tACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAagag < 2:2949388/101‑1 (MQ=255) tACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAagag < 1:2949321/101‑1 (MQ=255) aCGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAgg > 1:2949572/1‑101 (MQ=255) aCGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAgg < 1:2949375/101‑1 (MQ=255) gAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAGGTc > 2:2949575/1‑101 (MQ=255) gAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAGGTc < 1:2949062/101‑1 (MQ=255) gAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAGGTc < 1:2949147/101‑1 (MQ=255) gAATGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAGGTc > 1:2949574/1‑101 (MQ=255) aaTGCCGCCCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAGGTCa < 1:2949357/101‑1 (MQ=255) gccgccCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAGGTCaaaa < 1:2949159/101‑1 (MQ=255) gccgccCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAGGTCaaaa > 1:2949579/1‑101 (MQ=255) ccgccCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTc > 2:2949582/1‑80 (MQ=255) cgccCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAGGTc > 1:2949583/1‑95 (MQ=255) gccCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAGGTCAAAAAtc > 2:2949585/1‑101 (MQ=255) gccCCGCGTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAGGTCAAAAAtc < 2:2949188/101‑1 (MQ=255) cgcgTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAGGTCAAAAATCTCAg < 1:2949444/101‑1 (MQ=255) cgTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGTTTGGAAGAGGTCAAAAATCTCAGCt > 1:2949591/1‑101 (MQ=255) cgTGTCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAGGTCAAAAATCTCAGCt > 2:2949589/1‑101 (MQ=255) gtgtCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAGGTCAAAAATCTCAGCtt < 2:2949292/101‑1 (MQ=255) gtgtCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAGGTCAAAAATCTCAGCtt < 1:2949258/101‑1 (MQ=255) tgtCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAGGTCAAAAATCTCAGCTTa < 2:2949334/101‑1 (MQ=255) tgtCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAGGTCAAAAATCTCAGCTTa < 1:2949052/101‑1 (MQ=255) tCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAGGTCAAAAATCTCAGCTTACt < 1:2949330/101‑1 (MQ=255) tCATGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAGGTCAAAAATCTCAGCTTACt > 1:2949594/1‑101 (MQ=255) cATGTTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAGGTCAAAAATCTCAGCTTACTg < 1:2949295/101‑1 (MQ=255) aTGCTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAGGTCAAAAATCTCAGCTTACTGt > 2:2949595/1‑101 (MQ=255) | CTTAACGTATGGACACGCACCAGCACACCGTCGAAATGGTCCAGACGTTCCCAGCTAACATAGCGACTGTCCATACGAATGCCGCCCCGCGTGTCATGTTCCATTGCCTGCGCCAGCAAGGCCAGTTCACGAGGATCAAAAATATTCCCTGTTGGATGGTCAGGATTGGAAGAGGTCAAAAATCTCAGCTTACTGT > NC_000913/2026975‑2027170 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |