| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,873,031 | IS1 (–) +9 bp | coding (991‑999/1491 nt) | dgcJ → | putative diguanylate cyclase DgcJ |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 291401 | NA (NA) | 285 (0.940) | 147/194 | 0.2 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1873031 = | 0 (0.000) | coding (991/1491 nt) | dgcJ | putative diguanylate cyclase DgcJ | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1873039 | 0 (0.000) | 275 (0.910) | 145/194 | 0.3 | 100% | coding (999/1491 nt) | dgcJ | putative diguanylate cyclase DgcJ |
| ? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
TTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1872941‑1873039‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > NC_000913/1978503‑1978602 TATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGT < 1:2687846/101‑1 TATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGT < 1:2687637/101‑1 ATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTA < 2:2687730/101‑1 ATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTA < 2:2687937/101‑1 CCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAAT < 2:2687757/101‑1 CCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAAT < 2:2687655/101‑1 CCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAAT < 2:2687821/101‑1 CATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATG > 2:1537766/1‑101 TTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGAC > 2:2687996/1‑101 TGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACT < 2:2687603/101‑1 TGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACT > 2:1538131/1‑101 GATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTC > 2:1537746/1‑101 ATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCC > 2:1537855/1‑101 TATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCA < 1:2687781/101‑1 ATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAA > 1:2687999/1‑101 TTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAAC > 2:2688001/1‑101 TTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAAC > 1:1538116/1‑101 TTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTA < 1:2687765/101‑1 TTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTAT > 1:1537805/1‑101 ACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTG < 1:2687903/101‑1 TTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGAT > 1:2688005/1‑101 TTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTG < 1:2687810/99‑1 TTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGCTAATGACTCCAACTTATTGAT < 1:2687746/101‑1 TTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATA > 1:2688008/1‑101 TTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATT > 2:2688007/1‑97 TATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG < 1:2687944/101‑1 TATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG < 1:2687815/101‑1 TATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG < 1:2687716/101‑1 TCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG > 2:1537782/1‑101 CGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT < 2:2687795/101‑1 GTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT < 2:2687452/101‑1 GTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT > 1:2688014/1‑101 TCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA < 1:2687598/101‑1 CTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT > 2:2688015/1‑101 TTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT > 1:1537728/1‑100 TCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 2:2688019/1‑101 GTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG < 2:2687791/98‑1 TGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCA > 1:2688023/1‑101 TGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCA < 1:2687687/101‑1 TGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCA < 1:2687738/101‑1 GGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG < 1:2687879/101‑1 GGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG < 2:2687715/101‑1 GGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT < 1:2687762/92‑1 GAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 2:2687694/101‑1 GAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 2:2687612/97‑1 AAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT < 1:2687926/101‑1 AAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA > 1:2688026/1‑101 AAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAA < 2:2687843/101‑1 AGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT > 2:1537806/1‑101 AGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT < 1:2687532/101‑1 AGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT > 2:2688029/1‑101 GCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG < 2:2687782/101‑1 GCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG < 2:2687857/101‑1 GTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC > 1:2688030/1‑101 TTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCC < 2:2687891/101‑1 TTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA > 1:411129/1‑101 TTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA < 2:1538261/101‑1 TCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC < 1:1538258/101‑1 CTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATG < 1:2687798/53‑1 TGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTT < 1:1538254/101‑1 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TGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATG > 1:411118/1‑101 GACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGC > 2:411115/1‑101 CGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAG < 1:1538218/101‑1 GGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGTCTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT < 1:1538276/78‑1 GCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCT < 2:1538214/101‑1 GTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCC < 2:1538210/101‑1 AATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACC < 2:1538203/101‑1 TTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT < 1:1538191/101‑1 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TTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1872941‑1873039‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > NC_000913/1978503‑1978602 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |