Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,163,201 | T→C | V109A (GTG→GCG) | baeS → | sensory histidine kinase BaeS |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,163,201 | 0 | T | C | 99.8% | 2337.6 / NA | 552 | V109A (GTG→GCG) | baeS | sensory histidine kinase BaeS |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (283/268); minor base G (1/0); total (284/268) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 570 total aligned reads displayed.
CTTTGTCTTTCAGATCCTGCGTTCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGTGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGACCCATTCTGGTCAACGGTGCGGAAGTTGGC > NC_000913/2163103‑2163298 | tttGTCTTTCAGATCCTGCGTTCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGggcggt > 2:3287844/1‑101 (MQ=255) ttGTCTTTCAGATCCTGCGTTCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGtt > 1:3287851/1‑101 (MQ=255) gTCTTTCAGATCCTGCGTTCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGa < 2:3286795/101‑1 (MQ=255) tCTTTCAGATCCTGCGTTCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGAt > 2:3287860/1‑101 (MQ=255) cTTTCAGATCCTGCGTTCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATc > 1:3287861/1‑101 (MQ=255) tttCAGATCCTGCGTTCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCa < 2:3286613/101‑1 (MQ=255) tCAGATCCTGCGTTCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCaaa > 2:3287873/1‑101 (MQ=255) cAGATCCTGCGTTCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCaa < 1:3287868/99‑1 (MQ=255) aGATCCTGCGTTCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAaac < 1:3286538/101‑1 (MQ=255) gATCCTGCGTTCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAaaca > 2:3287882/1‑101 (MQ=255) gATCCTGCGTTCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAaaca > 1:3287881/1‑101 (MQ=255) tCCTGCGTTCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAaacaac > 1:3287892/1‑101 (MQ=255) ccTGCGTTCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAacaaca > 2:3287897/1‑101 (MQ=255) ccTGCGTTCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAacaaca < 1:3286747/101‑1 (MQ=255) cTGCGTTCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAAcaacaa < 2:3286432/101‑1 (MQ=255) tGCGTTCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACaaa > 2:3287905/1‑101 (MQ=255) gTTCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTg > 1:3287910/1‑101 (MQ=255) ttCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGc < 2:3287197/101‑1 (MQ=255) tCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACaaa > 2:3287922/1‑96 (MQ=255) tCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCt > 1:3287920/1‑101 (MQ=255) cATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCtg < 1:3286958/101‑1 (MQ=255) cATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCtg < 1:3286891/101‑1 (MQ=255) ttGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCtggtt < 1:3287101/101‑1 (MQ=255) ttGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCtggtt < 1:3286471/101‑1 (MQ=255) ttGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCtggtt > 1:3287931/1‑101 (MQ=255) tGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCtggttg < 2:3287039/101‑1 (MQ=255) tGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCtggttg < 2:3287092/101‑1 (MQ=255) gAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCtggttgg < 2:3286857/101‑1 (MQ=255) aaCACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCtggttggt > 2:3287938/1‑101 (MQ=255) acacGATAATTCGGAAGATAAACGCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTg > 2:3287946/1‑74 (MQ=255) cacGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTcc > 1:3287948/1‑101 (MQ=255) acGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCcg < 1:3287013/101‑1 (MQ=255) gATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCtggttg > 2:3287959/1‑94 (MQ=255) gATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCcgcg < 1:3286402/101‑1 (MQ=255) aTAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAgag > 1:3287963/1‑84 (MQ=255) tAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAg < 2:3286984/101‑1 (MQ=255) aaTTCGGAAGATAACCCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCtggt < 2:3286834/89‑1 (MQ=255) aaTTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAgc > 1:3287969/1‑101 (MQ=255) aaTTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAgc < 2:3286898/101‑1 (MQ=255) aTTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCcg > 2:3287974/1‑95 (MQ=255) cGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCtgg < 1:3286248/84‑1 (MQ=255) cGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCt > 2:3287983/1‑82 (MQ=255) cGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGa > 1:3287982/1‑95 (MQ=255) cGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCg < 1:3286711/101‑1 (MQ=255) ggAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGa < 2:3287407/101‑1 (MQ=255) aaGATAACCCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGAt < 2:3287341/100‑1 (MQ=255) aaGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCtgg > 2:3287992/1‑81 (MQ=255) aaGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGAtt < 2:3286964/101‑1 (MQ=255) aGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTc > 1:3287997/1‑101 (MQ=255) aTAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCa < 2:3287782/101‑1 (MQ=255) tAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCAc > 2:3288003/1‑101 (MQ=255) aaccccggcccggGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGa < 2:3287517/84‑1 (MQ=255) aaaCCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCAcc < 1:3286782/101‑1 (MQ=255) aaaCCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCAcc > 1:3288010/1‑101 (MQ=255) aCCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTg > 2:3288019/1‑101 (MQ=255) aCCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTg < 1:3287839/101‑1 (MQ=255) aCCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTg > 1:3288020/1‑101 (MQ=255) cccggcccggGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGa < 2:3286531/53‑1 (MQ=255) cccggcccggGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCcg < 2:3286739/81‑1 (MQ=255) ccggcccggGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCaa < 1:3288035/56‑1 (MQ=255) ccggcccggGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCg < 1:3287273/89‑1 (MQ=255) ccggcccggGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGAc < 2:3286770/101‑1 (MQ=255) ccggcccggGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGAc > 2:3288029/1‑101 (MQ=255) cggcccggGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACg < 1:3286987/101‑1 (MQ=255) ggcccggGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACgg > 2:3288040/1‑101 (MQ=255) gcccggGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGt < 1:3286925/101‑1 (MQ=255) cccggGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTa > 1:3288045/1‑101 (MQ=255) ccggGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTac > 2:3288053/1‑101 (MQ=255) cggGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTaca < 2:3287219/101‑1 (MQ=255) cggGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTaca < 1:3287118/101‑1 (MQ=255) cggGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTaca > 1:3288056/1‑101 (MQ=255) gggTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTacac < 1:3286076/101‑1 (MQ=255) ggTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACg > 2:3288062/1‑101 (MQ=255) tGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGa > 1:3288070/1‑101 (MQ=255) gCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGAt < 1:3287343/78‑1 (MQ=255) gCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGAc > 2:3288075/1‑101 (MQ=255) gCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGAc < 2:3286289/101‑1 (MQ=255) ccACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGAcc < 2:3287166/101‑1 (MQ=255) cACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTg > 2:3288083/1‑36 (MQ=255) aCCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTTGGCGGTTGAt > 1:3288086/1‑37 (MQ=255) gCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGACCCATTc > 2:3288091/1‑101 (MQ=255) cACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCTACCCATTCt < 1:3286636/101‑1 (MQ=255) cGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGACCCATTCTgg > 1:3288099/1‑101 (MQ=255) ggCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTg < 2:3286921/45‑1 (MQ=255) ggCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGACCCATTCTg < 1:3287077/99‑1 (MQ=255) gCTGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGACCCATTCTGGTc > 2:3288104/1‑101 (MQ=255) tGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGACCCATTCTGGTCaa > 1:3288109/1‑101 (MQ=255) tGGCGTACCCAGTTCTGGGCGGCTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTaca > 2:3288112/1‑81 (MQ=255) ggCGTACCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTc < 2:3286649/51‑1 (MQ=255) aCCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGACCCATTCTGGTCAACGGTGc < 2:3286875/101‑1 (MQ=255) aCCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGACCCATTCTGGTCAACGGTGc > 1:3288122/1‑101 (MQ=255) aCCCAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGACCCATTCTGGTCAACGGTGc < 2:3287051/101‑1 (MQ=255) cccAGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGACCCATTCTGGTCAACGGTGCg > 2:3288125/1‑101 (MQ=255) aGTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGACCCATTCTGGTCAACGGTGCGGaa < 1:3287172/101‑1 (MQ=255) gTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGACCCATTCTGGTCAACGGTGCGGAAg > 2:3288136/1‑101 (MQ=255) gTTCTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGACCCATTCTGGTCAACGGTGCGGAAg > 1:3288135/1‑101 (MQ=255) cTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGACCCATTCTGGTCAACGGTGCGGAAGTTg > 1:3288144/1‑101 (MQ=255) cTGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGACCCATTCTGGTCAACGGTGCGGAAGTTg < 2:3287258/101‑1 (MQ=255) tGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGACCCATTCTGGTCAACGGTGCGGAAGTTgg < 1:3286844/101‑1 (MQ=255) tGGGCGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGACCCATTCTGGTCAACGGTGCGGAAGTTgg < 1:3287023/101‑1 (MQ=255) | CTTTGTCTTTCAGATCCTGCGTTCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGTGGTTGATCAAAACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGACCCATTCTGGTCAACGGTGCGGAAGTTGGC > NC_000913/2163103‑2163298 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |