| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,588,033 | C→T | R278H (CGC→CAC) | yjiA ← | P‑loop guanosine triphosphatase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,588,033 | 0 | C | T | 99.6% | 975.8 / NA | 246 | R278H (CGC→CAC) | yjiA | P‑loop guanosine triphosphatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (124/120); total (126/120) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
CCCGAATCTCTTCCTCCGGCAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGCGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCAGTTTATCCGCCGACTCCAGCAGCAGGTT > NC_000913/4587935‑4588130 | cccGAATCTCTTCCTCCGGCAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGgtgc > 1:7160174/1‑101 (MQ=255) ccGAATCTCTTCCTCCGGCAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGgtgc < 1:7159692/100‑1 (MQ=255) ccGAATCTCTTCCTCCGGCAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCt > 1:7160176/1‑101 (MQ=255) cGAATCTCTTCCTCCGGCAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTg > 2:7160177/1‑101 (MQ=255) cGAATCTCTTCCTCCGGCAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGGCGGCGCTGTAGAGGTGCTg < 2:7159799/101‑1 (MQ=255) gAATCTCTTCCTCCGGCAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTgg < 2:7159827/101‑1 (MQ=255) aaTCTCTTCCTCCGGCAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGa < 1:7160009/101‑1 (MQ=255) aaTCTCTTCCTCCGGCAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGa < 2:7159809/101‑1 (MQ=255) ctctTCCTCCGGCAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGc < 2:7159694/101‑1 (MQ=255) tctTCCTCCGGCAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGTGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGcc > 1:7160182/1‑101 (MQ=255) ctTCCTCCGGCAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGccc > 2:7160183/1‑101 (MQ=255) ttCCTCCGGCAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCATGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCt < 2:7160072/101‑1 (MQ=255) ttCCTCCGGCAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCt > 1:7160185/1‑101 (MQ=255) ttCCTCCGGCAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCt > 2:7160186/1‑101 (MQ=255) cctccGGCAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTgg > 1:7160190/1‑101 (MQ=255) cctccGGCAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTgg < 2:7159791/101‑1 (MQ=255) tccGGCAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGaa > 1:7160195/1‑101 (MQ=255) tccGGCAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGaa > 1:7160192/1‑101 (MQ=255) ccGGCAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGaa < 2:7159723/100‑1 (MQ=255) gCAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAAcagc < 2:7160139/101‑1 (MQ=255) cAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAAcagca < 1:7159948/101‑1 (MQ=255) cAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAAcagca > 1:7160200/1‑101 (MQ=255) cAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAAcagca < 2:7159843/101‑1 (MQ=255) tGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCg > 2:7160202/1‑101 (MQ=255) tGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCg < 1:7159719/101‑1 (MQ=255) ggATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCgg > 2:7160206/1‑101 (MQ=255) aTCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGtt > 2:7160209/1‑101 (MQ=255) ccGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAgg > 1:7160211/1‑101 (MQ=255) cGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGt > 2:7160212/1‑101 (MQ=255) gATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGtt < 2:7159656/101‑1 (MQ=255) gATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGtt > 1:7160214/1‑101 (MQ=255) aTAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTc < 2:7159742/101‑1 (MQ=255) aTAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTc < 1:7159811/101‑1 (MQ=255) aaaCACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGc > 1:7160219/1‑101 (MQ=255) aaaCACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGc > 2:7160220/1‑101 (MQ=255) acacCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCg > 2:7160222/1‑101 (MQ=255) acacCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCg < 1:7159883/101‑1 (MQ=255) cacCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCg > 1:7160226/1‑100 (MQ=255) acCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTc > 2:7160227/1‑101 (MQ=255) acCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTc < 2:7159864/101‑1 (MQ=255) ccATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCa < 1:7159733/101‑1 (MQ=255) cATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTc < 2:7159841/99‑1 (MQ=255) cATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCaa < 1:7159533/101‑1 (MQ=255) cATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCaa < 1:7159876/101‑1 (MQ=255) aTCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAAt > 1:7160231/1‑101 (MQ=255) aTCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAAt > 2:7160232/1‑101 (MQ=255) gTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCca > 1:7160234/1‑101 (MQ=255) cTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAg < 2:7159900/101‑1 (MQ=255) cTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAg < 2:7160013/101‑1 (MQ=255) tATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGc > 2:7160239/1‑101 (MQ=255) tATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGc < 1:7160050/101‑1 (MQ=255) aTGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCa > 2:7160243/1‑101 (MQ=255) aTGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCa < 2:7159710/101‑1 (MQ=255) aTGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCa > 1:7160242/1‑101 (MQ=255) gCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATc > 2:7160246/1‑101 (MQ=255) cGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAAGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATcc > 1:7160248/1‑101 (MQ=255) gTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCt < 2:7159944/101‑1 (MQ=255) gTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCt < 1:7159776/101‑1 (MQ=255) tttttCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCtt > 2:7160251/1‑101 (MQ=255) tttttCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCtt < 1:7159853/101‑1 (MQ=255) ttttCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCttt > 1:7160254/1‑101 (MQ=255) ttttCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCttt < 1:7159840/101‑1 (MQ=255) tttCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGt > 1:7160256/1‑69 (MQ=255) ttCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGt < 2:7160008/101‑1 (MQ=255) tCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACg < 2:7159960/101‑1 (MQ=255) tCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACg < 2:7159773/101‑1 (MQ=255) cGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGt > 2:7160260/1‑101 (MQ=255) gCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTa < 2:7159932/101‑1 (MQ=255) gCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTa > 2:7160262/1‑101 (MQ=255) cccACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGc > 1:7160265/1‑101 (MQ=255) ccACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCa > 2:7160266/1‑101 (MQ=255) aCGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCAGt < 2:7160081/101‑1 (MQ=255) cGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCAGtt > 1:7160268/1‑101 (MQ=255) ggCCTGTCCCAGTCGGTGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAg < 1:7159872/95‑1 (MQ=255) ggCCTGTCCCAGTCGGGGCTGTAGAGGTGCTGGGCGCCCTGGaa > 2:7160275/1‑44 (MQ=37) ggCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCAGttt > 2:7160271/1‑101 (MQ=255) gCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCAGTTTa > 1:7160276/1‑101 (MQ=255) cTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCAGTTTATc > 1:7160279/1‑101 (MQ=255) 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gTCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCAGTTTATCCGCCGACt < 2:7159856/101‑1 (MQ=255) tCGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCAGTTTATCCGCCGACTc > 1:7160292/1‑101 (MQ=255) cGGCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCAGTTTATCCGCCGACTcc < 2:7159889/101‑1 (MQ=255) ggCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCAGTTTATCCGCCGACTCca < 2:7159924/101‑1 (MQ=255) ggCGCTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCAGTTTATCCGCCGACTCca > 2:7160293/1‑101 (MQ=255) gcgcTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCAGTTTATCCGCCGACTCcag < 1:7160020/101‑1 (MQ=255) cgcTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCAGTTTATCCGCCGACTCcagc > 2:7160297/1‑101 (MQ=255) cTGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCAGTTTATCCGCCGACTCcagcag > 2:7160299/1‑101 (MQ=255) tGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCAGTTTATCCGCCGACTCcagcagc > 1:7160300/1‑101 (MQ=255) tGTAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCAGTTTATCCGCCGACTCcagcaga < 1:7159771/101‑2 (MQ=255) tAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCAGTTTATCCGCCGACTCcagcagcag < 1:7159930/101‑1 (MQ=255) tAGAGGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCAGTTTATCCGCCGACTCcagcagcag < 2:7159994/101‑1 (MQ=255) gagGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCAGTTTATCCGCCGACTCCAGCAGCAGGt < 1:7160100/101‑1 (MQ=255) gagGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCAGTTTATCCGCCGACTCCAGCAGCAGGt > 1:7160305/1‑101 (MQ=255) agGTGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCAGTTTATCCGCCGACTCCAGCAGCAGGtt < 1:7159858/101‑1 (MQ=255) | CCCGAATCTCTTCCTCCGGCAGCTGGATCCCGATAAACACCATCGTGCTATGCGGTTTTTCATCGCCCCACGGCCTGTCCCAGTCGGCGCTGTAGAGGCGCTGGACGCCCTGGAACAGCAGGCGGTTAGGTTCGCCGTCAATCCACAGCATCCCTTTGTAACGTAGCAGTTTATCCGCCGACTCCAGCAGCAGGTT > NC_000913/4587935‑4588130 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |