Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,594,256 | (C)8→7 | pseudogene (3831/5422 nt) | yneO ← | AIDA‑I family autotransporter YneO |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,594,249 | 0 | C | . | 98.6% | 1123.6 / 5.6 | 219 | pseudogene (3838/5422 nt) | yneO | AIDA‑I family autotransporter YneO |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/2); new base . (128/88); total (129/90) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.70e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.85e-01 |
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
TCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTCCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGC > NC_000913/1594149‑1594344 | tCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTc > 1:2429882/1‑101 (MQ=255) cACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTcc > 2:2429886/1‑101 (MQ=255) cACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTcc < 2:2429434/101‑1 (MQ=255) cACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTcc > 1:2429885/1‑101 (MQ=255) ccTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTcccc < 1:2429431/101‑1 (MQ=255) tGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTcccccc > 2:2429889/1‑101 (MQ=255) tGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTcccccc < 2:2429453/101‑1 (MQ=255) gtgACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGata > 1:2429892/1‑101 (MQ=255) gACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTccccccca > 2:2429896/1‑93 (MQ=255) gACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATc < 1:2429540/101‑1 (MQ=255) gACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATc > 1:2429895/1‑101 (MQ=255) aCATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGatat < 1:2429629/99‑1 (MQ=255) cATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCcg < 2:2429529/101‑1 (MQ=255) cATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCcg > 2:2429899/1‑101 (MQ=255) aTTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTc > 1:2429903/1‑84 (MQ=255) aTTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCcgt > 1:2429901/1‑101 (MQ=255) tttCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCcgtc < 1:2429332/101‑1 (MQ=255) tttCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCcgtc < 2:2429495/101‑1 (MQ=255) tCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCcgtcgt > 2:2429907/1‑101 (MQ=255) tCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCcgtcgt < 1:2429575/101‑1 (MQ=255) cccGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTa < 2:2429563/101‑1 (MQ=255) cccGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTa > 1:2429908/1‑101 (MQ=255) cGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTAcc > 1:2429911/1‑101 (MQ=255) gACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTAccc > 2:2429915/1‑101 (MQ=255) gACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTAccc > 1:2429913/1‑101 (MQ=255) cATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTg < 2:2429521/101‑1 (MQ=255) acacCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATAc < 1:2429487/101‑1 (MQ=255) cacCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATAcg > 2:2429920/1‑101 (MQ=255) ccGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATAcgcc < 2:2429415/101‑1 (MQ=255) ccGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATAcgcc < 2:2429557/101‑1 (MQ=255) ccGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATAcgcc > 2:2429922/1‑101 (MQ=255) cGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATAcgccg < 2:2429473/101‑1 (MQ=255) cGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATAcgccg < 1:2429503/101‑1 (MQ=255) cTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCcgcg < 2:2429344/101‑1 (MQ=255) cTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCcgcg > 2:2429927/1‑101 (MQ=255) cTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCcgcg > 1:2429924/1‑101 (MQ=255) cTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCcgcg < 2:2429596/101‑1 (MQ=255) tGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCgg > 1:2429928/1‑101 (MQ=255) gTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGa > 1:2429932/1‑101 (MQ=255) ttATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTCCCCTGATACGCCGCGGaa < 1:2429213/101‑1 (MQ=255) ttATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTAcc > 1:2429938/1‑85 (MQ=255) ttATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGaa < 1:2429511/101‑1 (MQ=255) ttATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGaa < 1:2429709/101‑1 (MQ=255) ttATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGaa > 2:2429935/1‑101 (MQ=255) ttATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGaa > 1:2429934/1‑101 (MQ=255) aTGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATc < 1:2429764/101‑1 (MQ=255) aTGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATc > 1:2429942/1‑101 (MQ=255) tGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCg > 1:2429944/1‑101 (MQ=255) gATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCgtt > 1:2429947/1‑101 (MQ=255) tatTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCgttgt > 1:2429949/1‑101 (MQ=255) atTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCgttgtt > 1:2429951/1‑101 (MQ=255) ttAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTa < 1:2429652/101‑1 (MQ=255) ttAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTa < 1:2429558/101‑1 (MQ=255) ttAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTa < 2:2429468/101‑1 (MQ=255) ttAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTa < 2:2429721/101‑1 (MQ=255) tAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTaa > 2:2429954/1‑101 (MQ=255) tAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTaa > 1:2429955/1‑101 (MQ=255) aaTGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCgtt > 2:2429957/1‑95 (MQ=255) tgtgTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAaga > 1:2429961/1‑100 (MQ=255) gtgtTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGt > 2:2429962/1‑101 (MQ=255) ttGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAg < 1:2429757/101‑1 (MQ=255) gACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGa > 1:2429965/1‑101 (MQ=255) aCTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGAt < 2:2429610/101‑1 (MQ=255) aCTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGAt < 2:2429670/101‑1 (MQ=255) 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tatTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTAc < 1:2429533/101‑1 (MQ=255) ttAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTAccc > 1:2429983/1‑101 (MQ=255) aaTGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAg > 1:2429985/1‑101 (MQ=255) aTGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGt < 1:2429691/101‑1 (MQ=255) tGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGtt > 2:2429986/1‑101 (MQ=255) gCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGtttt < 2:2429715/101‑1 (MQ=255) cAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTg > 1:2429989/1‑101 (MQ=255) agagTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGt < 1:2429641/101‑1 (MQ=255) agagTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGt > 2:2429992/1‑101 (MQ=255) gagTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTc > 1:2429995/1‑101 (MQ=255) agTCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTca > 2:2429996/1‑101 (MQ=255) tCGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTcaca < 2:2429500/101‑1 (MQ=255) cGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACAt > 1:2430000/1‑101 (MQ=255) cGGAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACAt < 1:2429590/101‑1 (MQ=255) ggAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATc < 2:2429534/101‑1 (MQ=255) ggAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATc > 2:2430003/1‑101 (MQ=255) gAACCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACAt > 1:2430004/1‑99 (MQ=255) aCCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCacc > 1:2430006/1‑101 (MQ=255) aCCGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCacc < 2:2429631/101‑1 (MQ=255) ccGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccg < 2:2429643/101‑1 (MQ=255) cGAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgc > 2:2430008/1‑101 (MQ=255) gAAAGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgct > 2:2430010/1‑101 (MQ=255) aaaGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgcta > 1:2430013/1‑101 (MQ=255) aaaGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgcta < 1:2429636/101‑1 (MQ=255) aaaGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgcta > 2:2430015/1‑101 (MQ=255) aaGCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgctac > 2:2430018/1‑101 (MQ=255) gCAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgctaccg > 1:2430020/1‑101 (MQ=255) cAATTT‑CCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgctaccgc > 1:2430024/1‑101 (MQ=255) | TCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTCCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGC > NC_000913/1594149‑1594344 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |