| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,268,487 | (T)7→8 | intergenic (+180/+322) | tyrB → / ← yjbS | tyrosine aminotransferase/uncharacterized protein YjbS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,268,480 | 1 | . | T | 95.9% | 1557.7 / 46.3 | 365 | intergenic (+173/+329) | tyrB/yjbS | tyrosine aminotransferase/uncharacterized protein YjbS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (8/7); new base T (179/171); total (187/178) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 403 total aligned reads displayed.
AGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑TTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCT > NC_000913/4268380‑4268575 | aGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTg > 1:6596570/1‑101 (MQ=255) tgatTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑ttt < 1:6596003/101‑1 (MQ=255) atTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑tttt‑t > 2:6596577/1‑101 (MQ=255) tttttttGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑tttt‑tt > 1:6596578/1‑101 (MQ=255) tttttGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑tttt‑tttt < 1:6595853/101‑2 (MQ=255) tttttGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑tttt‑tttt > 2:6596587/1‑100 (MQ=255) tttttGATGCCATCGTACTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑tttt‑tttt > 1:6596584/1‑100 (MQ=255) tttGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑TTTT‑TTTtgg > 2:6596593/1‑101 (MQ=255) tttGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑TTTT‑TTTtgg < 2:6596076/101‑1 (MQ=255) ttGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑TTTT‑TTTtggg > 1:6596597/1‑100 (MQ=255) gATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTg < 2:6595884/101‑1 (MQ=255) aTGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTgg > 2:6596601/1‑101 (MQ=255) tGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGa > 1:6596605/1‑101 (MQ=255) gCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAg > 2:6596607/1‑101 (MQ=255) ccATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGt < 1:6596039/101‑1 (MQ=255) ccATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGt < 2:6596134/101‑1 (MQ=255) aTCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTg > 1:6596615/1‑95 (MQ=255) aTCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGtaa < 2:6595914/101‑1 (MQ=255) aTCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGtaa > 2:6596614/1‑101 (MQ=255) gTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGtaataa < 2:6596224/101‑1 (MQ=255) ttCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTaataat > 1:6596620/1‑101 (MQ=255) tACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTc > 2:6596624/1‑101 (MQ=255) aCGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCt < 2:6595957/101‑1 (MQ=255) tGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGca > 2:6596632/1‑101 (MQ=255) tGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGca > 1:6596630/1‑101 (MQ=255) agagaTAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGcaca > 1:6596637/1‑101 (MQ=255) taataaACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTaa > 1:6596646/1‑101 (MQ=255) taataaACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTaa > 2:6596643/1‑101 (MQ=255) aataaACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAAc > 2:6596648/1‑101 (MQ=255) ataaACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAAcc > 1:6596655/1‑101 (MQ=255) taaACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCa > 2:6596658/1‑101 (MQ=255) taaACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCa < 2:6596146/101‑1 (MQ=255) aaaCGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCat > 1:6596661/1‑101 (MQ=255) aCGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCatta < 2:6595904/101‑1 (MQ=255) cGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCattat < 1:6596233/101‑1 (MQ=255) cGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAAATTCTGCACATCTAACCattat < 1:6595950/101‑1 (MQ=255) gttgttAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCt < 2:6596014/83‑1 (MQ=255) gttgttAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCattatt > 2:6596665/1‑101 (MQ=255) ttgttAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCAttatta < 1:6596058/101‑1 (MQ=255) ttgttAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCAttatta > 2:6596670/1‑101 (MQ=255) ttgttAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCAttatta < 1:6595888/101‑1 (MQ=255) ttAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAAt > 1:6596675/1‑101 (MQ=255) tAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAAtt > 2:6596677/1‑101 (MQ=255) aGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAAttt < 2:6596084/101‑1 (MQ=255) gTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTta < 2:6596457/101‑1 (MQ=255) ttCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTtaa < 2:6596290/101‑1 (MQ=255) ttCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTtaa > 2:6596684/1‑101 (MQ=255) tCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTtaat < 2:6596353/101‑1 (MQ=255) cTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTtaata < 1:6595979/101‑1 (MQ=255) ttttATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTtaataa > 1:6596687/1‑101 (MQ=255) tttATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTtaataat > 2:6596692/1‑101 (MQ=255) tttATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTtaataat < 2:6596406/101‑1 (MQ=255) tATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTtaataataa > 2:6596699/1‑101 (MQ=255) tATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTtaataataa > 1:6596697/1‑101 (MQ=255) ttGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGt < 1:6596089/101‑1 (MQ=255) tGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTa < 1:6596180/101‑1 (MQ=255) gTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTAt > 1:6596704/1‑101 (MQ=255) ttAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATc > 2:6596709/1‑101 (MQ=255) ttAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATc > 1:6596710/1‑101 (MQ=255) tAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCg > 2:6596714/1‑101 (MQ=255) aaGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCgg < 2:6595988/101‑1 (MQ=255) gCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGt > 2:6596721/1‑101 (MQ=255) gCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGt < 2:6596166/101‑1 (MQ=255) cTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGtt < 1:6596213/101‑1 (MQ=255) ttATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGttt > 1:6596722/1‑101 (MQ=255) tATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTg > 2:6596731/1‑101 (MQ=255) tATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTg < 2:6596179/101‑1 (MQ=255) tATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTg > 1:6596728/1‑101 (MQ=255) tCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGtt < 1:6596156/101‑1 (MQ=255) tCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGtt < 1:6596029/101‑1 (MQ=255) tCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGtt < 2:6595816/101‑1 (MQ=255) tCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGtt < 2:6596318/101‑1 (MQ=255) tCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGtt < 2:6596240/101‑1 (MQ=255) cccAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTa > 1:6596737/1‑101 (MQ=255) cccAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTa < 2:6596062/101‑1 (MQ=255) ccAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATc < 2:6596050/90‑1 (MQ=255) ccAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTAc < 1:6596123/101‑1 (MQ=255) ccAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTAc > 2:6596740/1‑101 (MQ=255) cAATTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTAc > 2:6596746/1‑100 (MQ=255) aaTTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGa > 1:6596748/1‑101 (MQ=255) aTTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGAt < 2:6595944/101‑1 (MQ=255) aTTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGAt < 1:6595726/101‑1 (MQ=255) ttATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATa < 2:6596100/101‑1 (MQ=255) ttATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATa > 1:6596754/1‑101 (MQ=255) aTCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGa > 1:6596758/1‑101 (MQ=255) tCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGaa < 2:6596118/101‑1 (MQ=255) tCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGaa < 2:6596006/101‑1 (MQ=255) tGGAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAata < 2:6596030/101‑1 (MQ=255) ggAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAatat > 2:6596762/1‑101 (MQ=255) ggAATTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAatat < 1:6596407/101‑1 (MQ=255) gAATTCCTTATCCTG‑TTTTGTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTATGATAGAATAtt < 1:6596142/101‑1 (MQ=255) aaTTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATAttt > 2:6596767/1‑101 (MQ=255) aaTTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATAttt > 1:6596765/1‑101 (MQ=255) aaTTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATAttt < 1:6596262/101‑1 (MQ=255) aTTCCTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTc < 2:6596108/101‑1 (MQ=255) ccTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCtat < 1:6596246/101‑1 (MQ=255) cTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCtata < 1:6596336/101‑1 (MQ=255) cTTATCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCtata > 1:6596774/1‑101 (MQ=255) aTCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATcc > 1:6596778/1‑101 (MQ=255) aTCCTGTTTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATcc > 2:6596779/1‑101 (MQ=255) | AGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACGTTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAATTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑TTTT‑TTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCT > NC_000913/4268380‑4268575 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |