| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,021,640 | +C | coding (137/366 nt) | fliO → | flagellar biosynthesis protein FliO |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,021,636 | 1 | . | C | 98.6% | 860.6 / 3.2 | 210 | coding (133/366 nt) | fliO | flagellar biosynthesis protein FliO |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/1); new base C (97/110); total (99/111) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.03e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
GCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑G‑‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGC > NC_000913/2021536‑2021735 | cGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑G‑‑cc > 2:3068429/1‑101 (MQ=255) ggTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑G‑‑ccc < 1:3068161/101‑1 (MQ=255) ggTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑G‑‑c < 1:3068080/99‑1 (MQ=255) ggTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGAGATTT‑‑G‑‑ccc > 1:3068432/1‑101 (MQ=255) gTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑G‑‑cccc > 2:3068435/1‑101 (MQ=255) gTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑G‑‑cccc > 1:3068436/1‑101 (MQ=255) gTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑G‑‑cccc < 2:3067918/101‑1 (MQ=255) tCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑G‑‑cccccta < 2:3067781/101‑4 (MQ=255) tCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑G‑‑cccccta < 1:3068063/101‑4 (MQ=255) tCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑G‑‑cccccct < 1:3067962/101‑4 (MQ=255) ctgctgCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑G‑‑ccccctaa > 2:3068439/1‑97 (MQ=255) tgctgcGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑G‑‑ccccctaaa > 1:3068442/1‑96 (MQ=255) gcgcCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCa > 2:3068448/1‑101 (MQ=255) cgcCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCa > 2:3068450/1‑101 (MQ=255) gcCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACt < 2:3067857/101‑1 (MQ=255) ccACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACt < 1:3068012/101‑1 (MQ=255) ccACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTg < 2:3067990/101‑1 (MQ=255) ccACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTg < 1:3067969/101‑1 (MQ=255) cACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTg > 1:3068452/1‑101 (MQ=255) cACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTgg < 2:3068140/101‑1 (MQ=255) ctgctgCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGc < 2:3068123/101‑1 (MQ=255) tgctgcAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCg > 1:3068456/1‑101 (MQ=255) gctgcAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGtt > 2:3068457/1‑101 (MQ=255) ctgcAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGtt > 2:3068459/1‑101 (MQ=255) ctgcAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTa < 2:3068050/101‑1 (MQ=255) tgcAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTa < 2:3068204/101‑1 (MQ=255) tgcAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTa < 2:3068045/101‑1 (MQ=255) gcAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTaa < 1:3067920/101‑1 (MQ=255) cAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACg > 2:3068462/1‑101 (MQ=255) aGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACg > 1:3068464/1‑101 (MQ=255) gTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGt < 2:3068115/101‑1 (MQ=255) tGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCt > 1:3068468/1‑101 (MQ=255) gAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCt < 2:3068073/101‑1 (MQ=255) aGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTg > 2:3068471/1‑101 (MQ=255) aGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGa > 1:3068470/1‑101 (MQ=255) cggcgCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGaa < 2:3068402/101‑1 (MQ=255) cggcgCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGaa > 1:3068474/1‑101 (MQ=255) cggcgCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGaa > 2:3068475/1‑101 (MQ=255) gcgcACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGa < 1:3068133/98‑1 (MQ=255) gcgcACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAAt < 2:3067996/101‑1 (MQ=255) cgcACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAAtt < 2:3068090/101‑1 (MQ=255) aCTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAg > 1:3068480/1‑101 (MQ=255) cTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAgc > 2:3068481/1‑101 (MQ=255) tCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAgcgc < 1:3067724/101‑1 (MQ=255) aTCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGcc > 2:3068484/1‑101 (MQ=255) tCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCa < 2:3068310/101‑1 (MQ=255) cGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAg < 2:3068066/101‑1 (MQ=255) cGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCAc > 1:3068486/1‑70 (MQ=255) gCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTg < 1:3068212/101‑1 (MQ=255) gCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTg < 1:3068053/101‑1 (MQ=255) attattGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCtt > 1:3068489/1‑101 (MQ=255) ttattGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCtt > 1:3068495/1‑101 (MQ=255) ttattGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCtt < 1:3068046/101‑1 (MQ=255) ttattGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTc > 1:3068492/1‑101 (MQ=255) ttattGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTc > 2:3068490/1‑101 (MQ=255) tattGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTc < 2:3068216/101‑1 (MQ=255) tattGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTc < 1:3067982/101‑1 (MQ=255) ttGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCAc < 1:3067766/101‑1 (MQ=255) gCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTgg < 2:3068173/101‑1 (MQ=255) cccTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTgg < 2:3068096/101‑1 (MQ=255) cccTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTg > 1:3068498/1‑99 (MQ=255) ccTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGgc < 1:3067932/101‑1 (MQ=255) cTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGgc > 1:3068501/1‑101 (MQ=255) cTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGgcg < 1:3068030/101‑1 (MQ=255) aTCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGgcgcg > 1:3068504/1‑101 (MQ=255) ccTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGAGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGt > 2:3068505/1‑101 (MQ=255) cTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAgc > 1:3068509/1‑77 (MQ=255) cTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAgagc > 2:3068508/1‑78 (MQ=255) cTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTg < 1:3068172/101‑1 (MQ=255) tCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTg < 2:3067899/101‑1 (MQ=255) cGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGaa < 2:3068187/101‑1 (MQ=255) gctgctGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGaa > 2:3068514/1‑101 (MQ=255) gctgctGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGaaa < 2:3068105/101‑1 (MQ=255) tgctgcCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAg < 1:3068120/101‑1 (MQ=255) tgctgcCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAg > 2:3068516/1‑101 (MQ=255) tgctgcCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAgg < 2:3068002/101‑1 (MQ=255) gctgcCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAggg < 2:3068144/101‑1 (MQ=255) 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ctggTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTgtggtg < 1:3067843/101‑1 (MQ=255) ctggTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTgtggtg > 1:3068525/1‑101 (MQ=255) tggTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTggtggt < 1:3068037/101‑1 (MQ=255) gTAAAACGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTc > 2:3068528/1‑101 (MQ=255) tAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGa < 2:3067875/101‑1 (MQ=255) tAAAACGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGa > 1:3068530/1‑101 (MQ=255) aaaaCGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGa < 1:3068282/101‑1 (MQ=255) aaaaCGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGAGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGa > 1:3068534/1‑101 (MQ=255) aaaaCGGTTGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGAt > 2:3068532/1‑101 (MQ=255) aCGGTTGGGATTT‑‑GCCCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGAtgt > 2:3068537/1‑101 (MQ=255) gTTGGGATTTGCG‑‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGAtgtgca < 1:3068365/101‑3 (MQ=255) ttGGGATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAg < 2:3068011/101‑1 (MQ=255) gggATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGAt > 1:3068541/1‑101 (MQ=255) gggATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGAt > 2:3068540/1‑101 (MQ=255) gATTT‑‑GC‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTtg > 1:3068544/1‑79 (MQ=255) | GCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTT‑‑G‑‑CCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGC > NC_000913/2021536‑2021735 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |