| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,190,298 | +C | coding (613/2481 nt) | yehB ← | putative fimbrial usher protein YehB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,190,294 | 1 | . | C | 98.2% | 1150.0 / 10.6 | 279 | coding (617/2481 nt) | yehB | putative fimbrial usher protein YehB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/4); new base C (136/138); total (137/142) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.39e-01 | |||||||||||
Only 100 of 309 total aligned reads displayed.
AGAATCAAAAATATCGCTTGATGTGTACATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑A‑CCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTAAAACGTACATATGTACTC > NC_000913/2190194‑2190389 | aGAATCAAAAATATCGCTTGATGTGTACATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCcac‑a < 2:3327071/101‑1 (MQ=255)aGAATCAAAAATATCGCTTGATGTGTACATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCcac‑a > 2:3327331/1‑101 (MQ=255) aTCAAAAATATCGCTTGATGTGTACATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑A‑ccc > 2:3327337/1‑101 (MQ=255) cAAAAATATCGCTTGATGTGTACATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑A‑ccccc > 1:3327339/1‑100 (MQ=255) cAAAAATATCGCTTGATGTGTACATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑A‑ccccc < 2:3326970/101‑2 (MQ=255) aaaaaTATCGCTTGATGTGTACATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑A‑ccccct < 2:3326609/101‑3 (MQ=255) aaaaaTATCGCTTGATGTGTACATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑A‑ccccct > 2:3327342/1‑99 (MQ=255) aaaaTATCGCTTGATGTGTACATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑A‑ccccctg < 1:3326791/101‑4 (MQ=255) aaaaTATCGCTTGATGTGTACATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑A‑ccccctg < 1:3327003/101‑4 (MQ=255) atatCGCTTGATGTGTACATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGAt > 1:3327346/1‑101 (MQ=255) cGCTTGATGTGTACATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGtt > 1:3327350/1‑101 (MQ=255) gCTTGATGTGTACATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTa > 1:3327354/1‑101 (MQ=255) cTTGATGTGTACATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTAt > 2:3327356/1‑101 (MQ=255) tGATGTGTACATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTAttt > 2:3327360/1‑101 (MQ=255) gATGTGTACATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTg > 1:3327362/1‑101 (MQ=255) tgtgTACATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGtt > 2:3327365/1‑101 (MQ=255) tgtgTACATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGtt < 1:3327032/101‑1 (MQ=255) gtACATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTa > 1:3327370/1‑101 (MQ=255) aCATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACt > 1:3327374/1‑101 (MQ=255) aCATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACt > 2:3327373/1‑101 (MQ=255) cATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTg < 2:3327036/101‑1 (MQ=255) atatCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGa < 1:3326884/101‑1 (MQ=255) atatCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGa > 1:3327377/1‑101 (MQ=255) tatCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGaa < 2:3327085/101‑1 (MQ=255) tatCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGaa < 1:3326763/101‑1 (MQ=255) atCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGaaa > 1:3327380/1‑101 (MQ=255) cACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACt > 1:3327383/1‑101 (MQ=255) cACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACt < 2:3326991/101‑1 (MQ=255) aCCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTg > 1:3327388/1‑101 (MQ=255) cACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCa > 2:3327390/1‑101 (MQ=255) aCGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCAt > 1:3327392/1‑101 (MQ=255) aCGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCAt < 1:3326842/101‑1 (MQ=255) cgcgAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATc < 1:3326905/101‑1 (MQ=255) gcgAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCa > 2:3327396/1‑101 (MQ=255) cgAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAg > 2:3327399/1‑101 (MQ=255) gAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGa > 1:3327403/1‑101 (MQ=255) aaGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGaa > 2:3327406/1‑101 (MQ=255) aaGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGaa < 1:3326774/101‑1 (MQ=255) aGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAAt < 2:3326957/101‑1 (MQ=255) aGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAAt > 1:3327407/1‑101 (MQ=255) cGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGc < 1:3326856/101‑1 (MQ=255) gTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGTGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACt < 2:3327050/87‑1 (MQ=255) gCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGt > 1:3327413/1‑101 (MQ=255) gCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGt > 2:3327414/1‑101 (MQ=255) gCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGt < 1:3327100/101‑1 (MQ=255) ccGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCACGC‑CCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGtt < 2:3326867/101‑1 (MQ=255) ccGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGtt < 1:3326935/101‑1 (MQ=255) ccGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGtt < 2:3326768/101‑1 (MQ=255) cGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGa > 2:3327417/1‑92 (MQ=255) cGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTg < 2:3326917/101‑1 (MQ=255) agaAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGcc > 1:3327422/1‑101 (MQ=255) aaGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCAc > 2:3327424/1‑101 (MQ=255) aaGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCAc < 2:3327158/101‑1 (MQ=255) aGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCAcc < 1:3326976/101‑1 (MQ=255) aGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCAc < 2:3326934/100‑1 (MQ=255) gTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCAccc < 1:3326628/101‑1 (MQ=255) ttGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCAcccc > 2:3327428/1‑101 (MQ=255) gggCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAg > 1:3327431/1‑101 (MQ=255) gggCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAg < 2:3326949/101‑1 (MQ=255) gggCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAg < 1:3327023/101‑1 (MQ=255) ggCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGt < 2:3326846/101‑1 (MQ=255) cAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTaa > 2:3327433/1‑101 (MQ=255) aaaTCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTaaa > 2:3327437/1‑101 (MQ=255) tCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAAttt > 2:3327440/1‑101 (MQ=255) ccACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTa < 1:3327052/101‑1 (MQ=255) cACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTaa < 1:3326872/101‑1 (MQ=255) cACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTaa < 1:3327207/101‑1 (MQ=255) cACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTaa < 2:3326910/101‑1 (MQ=255) cACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTaa > 1:3327442/1‑101 (MQ=255) aCGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAAc < 1:3326719/101‑1 (MQ=255) cGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAAcc < 2:3326804/101‑1 (MQ=255) ttCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCg < 2:3326878/101‑1 (MQ=255) ttCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCg < 1:3327039/101‑1 (MQ=255) ttCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCg > 1:3327446/1‑101 (MQ=255) cAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTg < 1:3327160/101‑1 (MQ=255) aGATACAGGGTATTGCTTTTCCACGC‑CCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGt < 2:3327127/101‑1 (MQ=255) aGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGt < 1:3326810/101‑1 (MQ=255) gATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGtt > 1:3327450/1‑101 (MQ=255) tACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTaa < 2:3327009/101‑1 (MQ=255) tACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTaa > 2:3327451/1‑101 (MQ=255) aCAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTaaa < 1:3327331/101‑1 (MQ=255) aCAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTaaa < 1:3327182/101‑1 (MQ=255) cAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTaaaa < 1:3326966/101‑1 (MQ=255) cAGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTaaaa > 1:3327456/1‑101 (MQ=255) aGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTAAAAc > 2:3327460/1‑101 (MQ=255) aGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTAAAAc > 1:3327459/1‑101 (MQ=255) aGGGTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTAAAAc < 1:3326984/101‑1 (MQ=255) ggTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTAAAACGt > 1:3327464/1‑101 (MQ=255) ggTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTAAAACGt < 1:3326944/101‑1 (MQ=255) gTATTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTAAAACGTa < 1:3327086/101‑1 (MQ=255) aTTGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTAAAACGTACa > 1:3327468/1‑101 (MQ=255) tGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTAAAACGTACata < 2:3327187/101‑1 (MQ=255) tGCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTAAAACGTACata > 2:3327470/1‑101 (MQ=255) gCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTAAAACGTACatat > 1:3327473/1‑101 (MQ=255) gCTTTTCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTAAAACGTACatat < 1:3327007/101‑1 (MQ=255) tttCCAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTAAAACGTACATATGTa > 2:3327475/1‑101 (MQ=255) ccAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTAAAACGTACATATGTActc < 2:3327107/101‑1 (MQ=255) ccAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTAAAACGTACATATGTActc < 2:3327065/101‑1 (MQ=255) ccAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTAAAACGTACATATGTActc > 1:3327481/1‑101 (MQ=255) ccAC‑ACCCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCGGTTAAAACGTACATATGTActc < 1:3326992/101‑1 (MQ=255) | AGAATCAAAAATATCGCTTGATGTGTACATATCACCCACGCGAAGCGTGCCGAGAAGTTGGGCAAATCCACGTTCCAGATACAGGGTATTGCTTTTCCAC‑A‑CCCCTGGATTGTTATTTGTTTTACTGAAACTGGCATCAGAATGCAGTTGCCACCCCAGTAAATTTAACCCGCTGTTAAAACGTACATATGTACTC > NC_000913/2190194‑2190389 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |