| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,379,266 | (C)7→8 | coding (732/1128 nt) | zapE ← | cell division factor ZapE with ATPase activity |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,379,259 | 1 | . | C | 95.7% | 826.3 / 26.8 | 208 | coding (739/1128 nt) | zapE | cell division factor ZapE with ATPase activity |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/9); new base C (113/86); total (113/95) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.97e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.29e-01 | |||||||||||
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
ACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTACGCA > NC_000913/3379159‑3379354 | gCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑‑cc < 2:5167023/101‑1 (MQ=255) cacaGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑‑ccc > 2:5167408/1‑101 (MQ=255) acaGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGtt‑t > 1:5167410/1‑97 (MQ=255) acaGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑‑cccc < 1:5166977/101‑1 (MQ=255) aGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑‑cccccc < 2:5166961/101‑1 (MQ=255) gCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑‑ccccccc > 2:5167413/1‑101 (MQ=255) cGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑‑cccccccc > 1:5167415/1‑100 (MQ=255) cGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑‑cccccccc < 1:5166782/101‑2 (MQ=255) tagtaAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑‑ccccccccgc > 2:5167418/1‑98 (MQ=255) agtaAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑‑ccccccccgcc < 1:5166767/101‑5 (MQ=255) agtaAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑‑ccccccccgcc < 1:5167057/101‑5 (MQ=255) gtaAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑‑ccccccccgcca > 1:5167420/1‑96 (MQ=255) aaaaGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAgc < 1:5167047/101‑1 (MQ=255) aaaGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAgcg > 1:5167422/1‑101 (MQ=255) aaaGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAgcg < 2:5166903/101‑1 (MQ=255) agagACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGcc < 1:5166928/101‑1 (MQ=255) agagACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGcc < 2:5166741/101‑1 (MQ=255) agagACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGcc > 2:5167425/1‑101 (MQ=255) agaCCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAgc > 1:5167429/1‑96 (MQ=255) agaCCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCaa > 2:5167428/1‑101 (MQ=255) cGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCAt < 2:5166850/101‑1 (MQ=255) cGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCAt > 1:5167434/1‑101 (MQ=255) cGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑‑cccccccc > 2:5167435/1‑85 (MQ=255) gCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATa < 1:5167182/101‑1 (MQ=255) gCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATa < 1:5166886/101‑1 (MQ=255) gCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATa > 2:5167439/1‑101 (MQ=255) cAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGt > 2:5167442/1‑101 (MQ=255) cAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGt < 1:5166941/101‑1 (MQ=255) aGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGtt > 2:5167447/1‑101 (MQ=255) aGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGtt < 1:5166916/101‑1 (MQ=255) aGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGtt > 1:5167444/1‑101 (MQ=255) aGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGtt > 1:5167446/1‑101 (MQ=255) gCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAgc < 1:5166982/87‑1 (MQ=255) gTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTAt > 2:5167452/1‑101 (MQ=255) gTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑‑ccccccc > 1:5167453/1‑78 (MQ=255) tCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTAt < 2:5167095/100‑1 (MQ=255) cTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATcc < 2:5166848/101‑1 (MQ=255) tGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGttt > 1:5167458/1‑96 (MQ=255) tGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCa > 2:5167456/1‑101 (MQ=255) ggTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCAt < 2:5167048/101‑1 (MQ=255) ttCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCAttt < 2:5166825/101‑1 (MQ=255) ttCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCAttt < 1:5166736/101‑1 (MQ=255) ttCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCAttt < 2:5167195/101‑1 (MQ=255) tctcGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTg > 1:5167463/1‑101 (MQ=255) ctcGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTgc < 1:5166949/101‑1 (MQ=255) ctcGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTgc < 1:5166624/101‑1 (MQ=255) tcGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTgcg > 2:5167464/1‑101 (MQ=255) cGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTgcgc > 2:5167466/1‑101 (MQ=255) gACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGcc > 1:5167468/1‑101 (MQ=255) 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(MQ=255) aaTGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTTCC‑‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGaa < 2:5167145/101‑1 (MQ=255) aaTGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGaa > 1:5167486/1‑101 (MQ=255) aTGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAg < 2:5167245/101‑1 (MQ=255) tGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGt > 1:5167489/1‑101 (MQ=255) tGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGt < 1:5167148/101‑1 (MQ=255) ggCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTgcg < 2:5166970/80‑1 (MQ=255) ccGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGc < 2:5167056/101‑1 (MQ=255) cGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAg > 1:5167491/1‑51 (MQ=255) 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2:5167520/1‑101 (MQ=255) aaCGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATgcg > 1:5167523/1‑101 (MQ=255) aCGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTg > 1:5167526/1‑59 (MQ=255) gTCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCt < 1:5166889/101‑1 (MQ=255) tCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCtg > 2:5167527/1‑101 (MQ=255) tCGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCtg < 1:5166992/101‑1 (MQ=255) cGGTGAATTTTCTCGTTCC‑‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCtga < 2:5167122/101‑1 (MQ=255) cGGTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCtga < 1:5167237/101‑1 (MQ=255) gTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTgg > 2:5167532/1‑77 (MQ=255) gTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCtgagt < 1:5167091/101‑1 (MQ=255) gTGAATTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCtgagt < 1:5167078/101‑1 (MQ=255) tGAATTTTCTCGTT‑TCCCCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCtgagt > 2:5167534/1‑101 (MQ=255) aaTTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCtgagtgag > 1:5167536/1‑101 (MQ=255) aaTTTTCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCtgagtgag < 1:5167031/101‑1 (MQ=255) tttCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAgtgt > 1:5167539/1‑101 (MQ=255) ttCTCGTTCC‑‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTa < 2:5167275/101‑1 (MQ=255) ttCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTa > 2:5167540/1‑101 (MQ=255) ttCTCGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTa < 1:5167105/101‑1 (MQ=255) tctcGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGc < 2:5167087/70‑1 (MQ=255) ctcGTT‑TC‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCca < 2:5167001/77‑1 (MQ=255) | ACGCACAGCGTAGTAAAAGAGACCGCCAGCGTCTGGTTCTCGACGCCCATTGTTGCTAATGGCCGATGGTTGATTTCTAACGTCGGTGAATTTTCTCGTT‑T‑‑CCCCCCCGCCAGCGCCAACCATAGTTTATCCATTTGCGCCCGGGTTTCATCGTGAAGTGGCGAAAGCCACAGATGCGCCTGAGTGAGTGTACGCA > NC_000913/3379159‑3379354 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |