| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,873,031 | IS1 (–) +9 bp | coding (991‑999/1491 nt) | dgcJ → | putative diguanylate cyclase DgcJ |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 291401 | NA (NA) | 317 (1.050) | 153/196 | 0.2 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1873031 = | 0 (0.000) | coding (991/1491 nt) | dgcJ | putative diguanylate cyclase DgcJ | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1873039 | 0 (0.000) | 320 (1.060) | 155/196 | 0.1 | 100% | coding (999/1491 nt) | dgcJ | putative diguanylate cyclase DgcJ |
| ? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 320 total aligned reads displayed.
GTTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1872940‑1873039‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > NC_000913/1978503‑1978602 GTTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACG > 1:1617548/1‑101GTTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACG > 2:2845203/1‑101GTTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACG < 2:2844737/101‑1 TTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGG > 2:1617970/1‑101 TATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGT < 2:2844921/101‑1 TATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGT > 1:2845206/1‑101 TATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGT > 2:1617582/1‑101 TATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGT > 1:1617736/1‑101 TATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGT > 1:1617686/1‑101 TATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGT < 2:2844905/101‑1 TCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAA < 2:2845109/101‑1 CCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAAT > 2:2845209/1‑101 CCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAAT > 1:1617599/1‑101 TGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACT < 2:2844613/101‑1 GATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTC > 1:2845213/1‑101 GATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTC < 2:2845052/101‑1 GATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTC > 2:1617563/1‑101 ATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCC < 1:2844985/101‑1 ATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCC > 1:2845217/1‑101 ATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTC < 2:2844810/100‑1 TATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCA > 2:2845218/1‑101 TATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCA > 1:1617707/1‑101 TTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAAC < 2:2844879/101‑1 CTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTT < 1:2844871/101‑1 TTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTAT > 1:2845221/1‑101 TTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTAT < 1:2845024/101‑1 TACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATT > 1:2845225/1‑101 ACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTG > 1:1617583/1‑101 ACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTG < 1:2844796/101‑1 CTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGA > 2:2845228/1‑101 TTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGAT > 2:1617640/1‑101 TTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATA < 1:2845038/101‑1 TATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG > 2:2845234/1‑101 ATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT < 2:2845011/101‑1 TCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG < 1:2844958/101‑1 ACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTT > 2:2845237/1‑101 CGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT < 1:2844973/101‑1 GTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT > 2:1618130/1‑101 TCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA < 1:2844898/101‑1 CTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT < 1:2845021/101‑1 TCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 2:2844979/101‑1 CGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 1:2844999/101‑1 GTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTC > 1:2845241/1‑101 TGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCA > 2:2845242/1‑101 TGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCA > 1:1617626/1‑101 AAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT > 1:2845246/1‑101 AAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT < 1:2845105/101‑1 AAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA < 1:2845063/101‑1 AGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT < 2:2844963/101‑1 AGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT > 1:2845250/1‑101 GCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG < 1:2844719/101‑1 GCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG > 2:2845252/1‑101 TTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCC > 2:1617606/1‑101 CTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA < 1:1618185/101‑1 TGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCATATAATGCCCGAT < 1:2845009/101‑1 TGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAAATTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAT < 2:1618179/101‑1 TTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA > 2:437099/1‑101 TTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA > 1:437096/1‑101 TGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTT < 1:1618160/101‑1 TGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTT < 2:1618162/101‑1 GGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTT < 2:1618155/101‑1 ATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGT > 2:437092/1‑101 ATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGT < 1:1618151/101‑1 TTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCA > 2:437088/1‑101 TTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCA < 1:1618144/101‑1 TTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAT > 1:437087/1‑101 TTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAT < 1:1618139/101‑1 GACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGC > 1:437084/1‑101 GACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGC < 2:1618135/101‑1 CGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTTATGCAG < 1:1618125/101‑1 CGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAG > 2:5491502/1‑101 GCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCT < 2:1618118/101‑1 CGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTC > 2:1617648/1‑101 GTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCC > 2:1617544/1‑101 AATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTGTGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACC < 2:1618104/101‑1 ATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCG < 1:1618102/101‑1 GCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTT < 1:1618087/101‑1 CTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTG > 1:5491553/1‑101 CTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTG < 2:1618082/101‑1 TGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA > 2:5491454/1‑101 GAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAG > 2:1617705/1‑101 GAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAG < 1:1618080/101‑1 GAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAG > 1:5491181/1‑101 ATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAA < 1:1618077/101‑1 ATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAA > 1:5491334/1‑101 ATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACG > 2:5491596/1‑101 ATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACG > 1:5491409/1‑101 GTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACA < 1:1618066/101‑1 GTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAAC > 2:5491433/1‑97 GCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGC < 1:1618057/101‑1 CGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCG < 1:1618049/101‑1 GGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGA > 1:5491443/1‑101 GATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGAC < 1:1618043/101‑1 GATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGAC < 2:1618044/101‑1 TGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTT > 2:5491138/1‑101 CACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCC > 1:5491726/1‑101 ACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCG > 2:5491212/1‑101 CGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT < 1:5491961/101‑1 CGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT < 2:1618033/101‑1 CGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGA > 2:5491293/1‑88 GTTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1872940‑1873039‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > NC_000913/1978503‑1978602 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |