| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,450,243 | A→G | E94E (GAA→GAG) | ytfQ → | galactofuranose ABC transporter periplasmic binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,450,243 | 0 | A | G | 80.5% | 812.8 / 191.0 | 323 | E94E (GAA→GAG) | ytfQ | galactofuranose ABC transporter periplasmic binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (25/38); new base G (102/158); total (127/196) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 328 total aligned reads displayed.
GTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACT > NC_000913/4450143‑4450342 | aGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCg < 1:6890257/101‑1 (MQ=255) aGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCg > 1:6890924/1‑101 (MQ=255) gCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCgg > 2:6890927/1‑101 (MQ=255) gCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCgg < 2:6890519/101‑1 (MQ=255) gCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCgg > 1:6890928/1‑101 (MQ=255) aaaaGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCgg < 2:6890362/99‑1 (MQ=255) aaaaGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTa < 1:6890338/101‑1 (MQ=255) aaaaGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTa > 1:6890934/1‑101 (MQ=255) aaaGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTAt > 2:6890935/1‑101 (MQ=255) aaGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTAtt > 1:6890941/1‑101 (MQ=255) cAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTaaa > 1:6890944/1‑101 (MQ=255) cAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTaaa < 1:6890303/101‑1 (MQ=255) aGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTaaaa > 2:6890945/1‑101 (MQ=255) ggAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAag < 2:6890524/101‑1 (MQ=255) aaaaCCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAagag > 2:6890950/1‑101 (MQ=255) aaaCCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAgg < 1:6890500/101‑1 (MQ=255) aaaCCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAgg > 1:6890954/1‑101 (MQ=255) aaCCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGc > 2:6890956/1‑101 (MQ=255) aCCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCg < 1:6890471/101‑1 (MQ=255) ccAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGa < 1:6890667/101‑1 (MQ=255) ccAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGa < 2:6890539/101‑1 (MQ=255) cAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGaa > 1:6890960/1‑101 (MQ=255) gATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAg < 2:6890486/101‑1 (MQ=255) ttAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAATGAt < 1:6890424/101‑1 (MQ=255) tAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATg > 2:6890966/1‑101 (MQ=255) tAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATg > 1:6890967/1‑101 (MQ=255) tAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATg < 1:6890481/101‑1 (MQ=255) aGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCg < 2:6890244/101‑1 (MQ=255) aGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCg < 1:6890532/101‑1 (MQ=255) aGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCg < 1:6890453/101‑1 (MQ=255) gCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGa < 2:6890467/101‑1 (MQ=255) gCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGa < 1:6890598/101‑1 (MQ=255) cGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaa > 2:6890971/1‑101 (MQ=255) cGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaa < 1:6890319/101‑1 (MQ=255) gTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAAt < 2:6890334/101‑1 (MQ=255) gTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAAt > 1:6890973/1‑101 (MQ=255) tACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGaaa < 1:6890442/89‑1 (MQ=255) tACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATc < 1:6890463/101‑1 (MQ=255) aCGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAAt > 1:6890980/1‑99 (MQ=255) aCGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATcc > 2:6890979/1‑101 (MQ=255) cGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATccc < 1:6890274/101‑1 (MQ=255) tCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGt < 1:6890541/101‑1 (MQ=255) tCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGt > 2:6890985/1‑101 (MQ=255) ccTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGgaa > 2:6890989/1‑83 (MQ=255) cTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTAt > 1:6890992/1‑101 (MQ=255) ttCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTAtt < 1:6890920/101‑1 (MQ=255) tCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTc < 1:6890796/101‑1 (MQ=255) cGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCt < 2:6890591/101‑1 (MQ=255) gTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCtt < 1:6890513/101‑1 (MQ=255) gTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCtt < 1:6890374/101‑1 (MQ=255) gTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCtt > 1:6890997/1‑101 (MQ=255) gTTGCACAAGGGGCGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCtt > 2:6890994/1‑101 (MQ=255) ttGCACAAGGGGTGAATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTg < 2:6890397/101‑1 (MQ=255) gCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCt > 2:6891002/1‑101 (MQ=255) cacaAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTc < 1:6890697/101‑1 (MQ=255) cacaAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTc < 1:6890411/101‑1 (MQ=255) cacaAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTc < 1:6890635/101‑1 (MQ=255) acaAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCg > 1:6891004/1‑101 (MQ=255) aaGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGAt < 1:6890644/101‑1 (MQ=255) aaGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGAt < 1:6890570/101‑1 (MQ=255) aaGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGAt > 2:6891008/1‑101 (MQ=255) aaGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGAt < 2:6890812/101‑1 (MQ=255) aGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATc < 2:6890446/101‑1 (MQ=255) gggTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGt > 2:6891012/1‑101 (MQ=255) ggTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGtt < 2:6890600/101‑1 (MQ=255) gTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTc < 2:6890556/101‑1 (MQ=255) gTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTc < 2:6890856/101‑1 (MQ=255) tGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTcc > 1:6891016/1‑101 (MQ=255) tGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTcc < 1:6890390/101‑1 (MQ=255) ggATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCa < 1:6890587/101‑1 (MQ=255) 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aTCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGAtgt < 2:6890703/101‑1 (MQ=255) cTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGa > 1:6891027/1‑101 (MQ=255) tCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGAc < 2:6890714/101‑1 (MQ=255) tCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAAt < 2:6890575/101‑1 (MQ=255) tCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAAt > 2:6891032/1‑101 (MQ=255) tCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAAt < 1:6890579/101‑1 (MQ=255) cGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGAt < 1:6890492/47‑1 (MQ=255) gtCGCGACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCta < 2:6890638/101‑1 (MQ=255) gtCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCta < 1:6890595/101‑1 (MQ=255) gccgcgACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATg < 2:6890405/41‑1 (MQ=38) cgcgACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCtata > 1:6891036/1‑101 (MQ=255) cgACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATg < 1:6890763/101‑1 (MQ=255) gACAGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGa > 1:6891039/1‑101 (MQ=255) cAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGAACGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGacc < 1:6890617/101‑1 (MQ=255) aGGTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGacca > 2:6891041/1‑101 (MQ=255) ggTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGaccac < 2:6890628/101‑1 (MQ=255) gTTGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGac < 1:6890159/97‑1 (MQ=255) ttGGGAGCCGGTATTTAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCg > 2:6891045/1‑101 (MQ=255) tGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGt < 2:6890372/101‑1 (MQ=255) tGGGAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGt > 1:6891046/1‑101 (MQ=255) gggAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTc < 2:6890382/101‑1 (MQ=255) ggAGCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGACAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCa < 1:6890227/101‑1 (MQ=255) aaCCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACt > 1:6891053/1‑101 (MQ=255) | GTCAGCAAAAGCAGGAAAACCAGATTAAAGCGGTACGTTCCTTCGTTGCACAAGGGGTGGATGCGATCTTTATCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAATCCCGGTATTCTTGCTCGATCGTTCCATTGATGTGAAAGACAAATCTCTCTATATGACCACCGTCACT > NC_000913/4450143‑4450342 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |