Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 511,405 | A→G | intergenic (‑26/‑236) | copA ← / → glsA | Cu(+) exporting P‑type ATPase/glutaminase 1 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 511,405 | 0 | A | G | 99.7% | 1181.0 / NA | 283 | intergenic (‑26/‑236) | copA/glsA | Cu(+) exporting P‑type ATPase/glutaminase 1 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (117/165); minor base T (0/1); total (117/166) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 293 total aligned reads displayed.
GACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTAAAAAATCGGCTCG > NC_000913/511307‑511502 | gACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCt < 1:798269/101‑1 (MQ=255) aCTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTg > 1:798728/1‑101 (MQ=255) aCTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTg < 2:798181/101‑1 (MQ=255) ctttctttCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTgg < 2:798232/101‑1 (MQ=255) ctttctttCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTgg < 1:798127/101‑1 (MQ=255) ctttctttCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTgg < 2:798227/101‑1 (MQ=255) tttctttcACGCTTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTtggctggc < 2:798341/101‑1 (MQ=255) tttctttcACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTtggctggc > 2:798730/1‑101 (MQ=255) ttctttcACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTggctggct > 1:798732/1‑101 (MQ=255) tctttcACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGgctggctg > 1:798734/1‑101 (MQ=255) tttcACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCtgtg > 2:798737/1‑101 (MQ=255) cACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATa > 2:798742/1‑101 (MQ=255) gcgTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACCCTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAg < 2:798076/101‑1 (MQ=255) gcgTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAg < 2:798166/101‑1 (MQ=255) gTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGt > 2:798748/1‑101 (MQ=255) gTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGt < 2:798149/101‑1 (MQ=255) tttAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGtt < 1:798063/101‑1 (MQ=255) ttAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTa < 1:798458/101‑1 (MQ=255) tAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTaa < 1:798163/101‑1 (MQ=255) aaCGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTaaa > 1:798750/1‑101 (MQ=255) cGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAAcc > 1:798754/1‑101 (MQ=255) cGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAAcc < 1:798352/101‑1 (MQ=255) gCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCt > 1:798757/1‑101 (MQ=255) aGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTc > 2:798759/1‑101 (MQ=255) tGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCa < 2:798350/101‑1 (MQ=255) tGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCa > 2:798762/1‑101 (MQ=255) tGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCa < 1:798545/101‑1 (MQ=255) aCCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGc < 2:798612/101‑1 (MQ=255) ccGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCa > 1:798768/1‑101 (MQ=255) cGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCaa > 2:798771/1‑101 (MQ=255) gCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAg > 2:798773/1‑101 (MQ=255) gCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAg < 2:798384/101‑1 (MQ=255) gCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAg > 1:798774/1‑101 (MQ=255) gCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAg < 1:798289/101‑1 (MQ=255) cAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAgg < 2:798476/101‑1 (MQ=255) cAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAgg < 2:798188/101‑1 (MQ=255) ggACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAg > 1:798779/1‑98 (MQ=255) cAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAg > 2:798780/1‑101 (MQ=255) cGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCaa > 2:798784/1‑101 (MQ=255) gTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTaaaatt > 1:798787/1‑77 (MQ=255) gTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAg < 1:798338/101‑1 (MQ=255) tCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGa < 2:798400/101‑1 (MQ=255) ccAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGaa < 2:798298/101‑1 (MQ=255) ccAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGaa < 2:798411/101‑1 (MQ=255) ccAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGaa > 2:798790/1‑101 (MQ=255) aGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAAt > 2:798794/1‑101 (MQ=255) gggTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAAtt < 2:798292/101‑1 (MQ=255) ggTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATta < 1:798443/101‑1 (MQ=255) gTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCGGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATtaa > 1:798797/1‑101 (MQ=255) gTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATtaa < 1:798393/101‑1 (MQ=255) gTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATtaa > 2:798798/1‑101 (MQ=255) cAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAg < 2:797948/92‑1 (MQ=255) ggTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATaaa < 1:798176/101‑1 (MQ=255) ggTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATaaa < 1:798302/101‑1 (MQ=255) ggTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATaaa < 1:798255/101‑1 (MQ=255) ggTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATaaa < 2:798265/101‑1 (MQ=255) gTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGaa < 1:798144/91‑1 (MQ=255) gTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAAc < 1:798765/101‑1 (MQ=255) cGATAGTTTGTGACATAAAACTCTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCa < 2:798452/101‑1 (MQ=255) gATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATtaataa < 1:798309/96‑1 (MQ=255) gATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAg > 2:798803/1‑101 (MQ=255) aTAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAgg > 1:798805/1‑101 (MQ=255) tAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGc > 1:798808/1‑101 (MQ=255) gTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCgg < 2:798368/101‑1 (MQ=255) gTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCgg > 2:798812/1‑101 (MQ=255) tttGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCggg < 2:798509/101‑1 (MQ=255) ttGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGt < 2:798235/101‑1 (MQ=255) ttGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGt > 1:798814/1‑101 (MQ=255) gtgACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGc > 2:798819/1‑95 (MQ=255) gtgACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTaa > 2:798816/1‑101 (MQ=255) tgACATAAAACTCTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTaaa < 1:798407/101‑1 (MQ=255) tgACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTaaa > 2:798822/1‑101 (MQ=255) cATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGt < 1:798741/101‑1 (MQ=255) tAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTcc < 2:798314/101‑1 (MQ=255) tAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTcc > 1:798825/1‑101 (MQ=255) aaCACTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTa < 2:798329/101‑1 (MQ=255) acacTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTaa < 1:798318/101‑1 (MQ=255) cacTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGaaa < 1:798510/70‑1 (MQ=255) cacTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTaaa > 1:798828/1‑101 (MQ=255) cacTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTaaa < 1:798373/101‑1 (MQ=255) acTCCTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGGAAAAGTCCGTaaa > 1:798831/1‑100 (MQ=255) ccTTTAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTcc < 1:798344/92‑1 (MQ=255) tttAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTaa > 2:798833/1‑101 (MQ=255) ttAAGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTaaa > 2:798837/1‑101 (MQ=255) aaGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTaaaaa > 1:798839/1‑101 (MQ=255) aaGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTaaaaa < 1:798419/101‑1 (MQ=255) aGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTaaaaaa < 2:798435/101‑1 (MQ=255) aGACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTaaaaaa < 1:798382/101‑1 (MQ=255) gACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTAAAAAAt < 1:798403/101‑1 (MQ=255) gACAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTAAAAAAt < 2:798120/101‑1 (MQ=255) cAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTaaaaaa > 2:798843/1‑98 (MQ=255) cAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTAAAAAATCg < 2:798677/101‑1 (MQ=255) cAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTAAAAAATCg < 2:798422/101‑1 (MQ=255) cAGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAACTCCGTAAAGATTAAAAAATCg < 1:798426/101‑1 (MQ=255) aGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTAAAAAATCgg < 2:798461/101‑1 (MQ=255) aGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTAAAAAATCgg < 2:798574/101‑1 (MQ=255) aGTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTAAAAAATCgg > 1:798846/1‑101 (MQ=255) gTTTTGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTAAAAAATCGGc > 1:798849/1‑101 (MQ=255) ttttGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTAAAAAATCGGCt < 1:798217/101‑1 (MQ=255) tttGGCTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTAAAAAATCGGCTc < 1:797982/101‑1 (MQ=255) | GACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTCCAGGGTCAGGTCGATAGTTTGTGACATAAAACACTCCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCAAGAAATTAATAAACCAGGCGGGTAAAAGTCCGTAAAGATTAAAAAATCGGCTCG > NC_000913/511307‑511502 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |