| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,602,017 | (C)7→8 | coding (200/2019 nt) | hyfB → | hydrogenase 4 component B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,602,010 | 1 | . | C | 77.6% | 837.9 / 256.5 | 263 | coding (193/2019 nt) | hyfB | hydrogenase 4 component B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (32/27); new base C (95/109); total (127/136) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.05e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.34e-01 | |||||||||||
Only 100 of 281 total aligned reads displayed.
TATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTA > NC_000913/2601910‑2602110 | tATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTg > 2:4237145/1‑101 (MQ=255) aaGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑cccc > 2:4237149/1‑101 (MQ=255) tttCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑cccccc‑cc < 1:4236823/101‑2 (MQ=255) tttCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑cccccc‑cc > 1:4237153/1‑100 (MQ=255) tCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCC‑Cctt > 1:4237156/1‑101 (MQ=255) ccGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCC‑Ccttt < 2:4237004/101‑1 (MQ=255) ccGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCC‑Ccttt > 2:4237157/1‑101 (MQ=255) cGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCACtttt < 1:4236722/101‑1 (MQ=255) cGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCC‑Cctttt < 2:4236619/101‑2 (MQ=255) cGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCC‑Cctttt < 2:4236548/101‑2 (MQ=255) gCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGa < 2:4236693/101‑1 (MQ=255) gCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGa < 1:4236631/101‑1 (MQ=255) cATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGaa > 1:4237162/1‑101 (MQ=255) cATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCC‑Cctttt > 2:4237163/1‑97 (MQ=255) aTCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAAt < 2:4236803/101‑1 (MQ=255) aTCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAAt < 2:4236487/101‑1 (MQ=255) cacaTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAAttt > 2:4237167/1‑101 (MQ=255) cacaTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAAttt < 2:4236579/101‑1 (MQ=255) caTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGc < 1:4236468/101‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGcc > 1:4237170/1‑101 (MQ=255) tCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCg < 2:4236982/101‑1 (MQ=255) gCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGAt > 2:4237174/1‑101 (MQ=255) gCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGAt < 1:4236742/101‑1 (MQ=255) gCTGGTGGGCGGCGCGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGAt < 1:4236454/101‑1 (MQ=255) tggtggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGAttt < 1:4236994/101‑1 (MQ=255) gtggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTaa < 2:4236747/101‑1 (MQ=255) gtggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTaa > 2:4237177/1‑101 (MQ=255) gggCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAAcc < 1:4236765/101‑1 (MQ=255) gggCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAAccc > 1:4237179/1‑101 (MQ=255) ggcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGc < 1:4236750/101‑1 (MQ=255) ggcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGc > 2:4237182/1‑101 (MQ=255) ggcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGc > 2:4237184/1‑101 (MQ=255) ggcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGc < 2:4236884/101‑1 (MQ=255) gcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCg > 1:4237186/1‑101 (MQ=255) cgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGa > 1:4237189/1‑101 (MQ=255) cgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGa < 1:4236572/101‑1 (MQ=255) gTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGaa > 2:4237192/1‑101 (MQ=255) tGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAAt < 1:4236894/101‑1 (MQ=255) gATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATg > 1:4237195/1‑101 (MQ=255) gATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATg < 1:4236675/101‑1 (MQ=255) gATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATg < 2:4236974/101‑1 (MQ=255) gATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATgg < 1:4236868/101‑1 (MQ=255) ttGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGa < 2:4236859/101‑1 (MQ=255) ggCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATa > 2:4237199/1‑101 (MQ=255) catcatCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGc > 1:4237200/1‑101 (MQ=255) atcatcAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCct < 2:4236725/101‑1 (MQ=255) tcatcaGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCct < 1:4236700/101‑1 (MQ=255) atcaGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCctct > 1:4237203/1‑101 (MQ=255) caGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCg > 1:4237206/1‑101 (MQ=255) cGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCa > 2:4237211/1‑101 (MQ=255) ggAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCAt < 1:4236796/101‑1 (MQ=255) gAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCAtt > 1:4237215/1‑101 (MQ=255) gAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCAttt < 2:4237069/101‑1 (MQ=255) gAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCAttt > 2:4237214/1‑101 (MQ=255) aaTTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCAttt < 2:4236658/101‑1 (MQ=255) aaTTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCAttt < 1:4236846/101‑1 (MQ=255) aaTTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCAttt < 2:4236880/101‑1 (MQ=255) ttACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATg < 2:4236888/101‑1 (MQ=255) tACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATg < 1:4237070/101‑1 (MQ=255) tACGCAATTACATGCTGGTGT‑ACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTTAATTTGcc > 2:4237218/1‑61 (MQ=255) aCGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATgg > 1:4237219/1‑101 (MQ=255) gCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTg > 1:4237224/1‑101 (MQ=255) cAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGc > 2:4237226/1‑101 (MQ=255) cAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGc < 1:4236654/101‑1 (MQ=255) cAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCt < 1:4236808/101‑1 (MQ=255) aaTTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCt < 1:4236708/101‑1 (MQ=255) aaTTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTg > 1:4237229/1‑101 (MQ=255) ttACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTgg < 2:4236766/101‑1 (MQ=255) tACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGt < 2:4236840/101‑1 (MQ=255) tACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGt < 2:4236948/101‑1 (MQ=255) aCATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCg > 2:4237233/1‑67 (MQ=255) cATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTa > 1:4237235/1‑101 (MQ=255) tGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTAtc > 1:4237239/1‑101 (MQ=255) cTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCC‑Cctttt > 2:4237240/1‑38 (MQ=255) ggTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCt < 1:4236932/101‑1 (MQ=255) gtgtAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCtt > 1:4237245/1‑101 (MQ=255) tgtAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTg < 2:4236730/101‑1 (MQ=255) tgtAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTg > 2:4237246/1‑101 (MQ=255) tgtAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGc < 2:4236819/101‑1 (MQ=255) tAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCt < 1:4236957/101‑1 (MQ=255) tAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtg > 1:4237248/1‑101 (MQ=255) aCTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtgg < 1:4236773/101‑1 (MQ=255) aCTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggt > 1:4237251/1‑101 (MQ=255) cTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtg > 2:4237255/1‑101 (MQ=255) tttAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGcc > 1:4237262/1‑38 (MQ=255) tttAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATgg > 2:4237261/1‑57 (MQ=255) tttAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtg > 2:4237258/1‑101 (MQ=255) tttAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtg < 1:4236826/101‑1 (MQ=255) tAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggt > 1:4237265/1‑101 (MQ=255) aGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCtt > 1:4237270/1‑91 (MQ=255) aGTCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtg < 1:4237167/101‑1 (MQ=255) tCGCCCGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTggtggtggt > 2:4237272/1‑101 (MQ=255) tCGCCCGTTTTG‑CCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtgg > 1:4237274/1‑99 (MQ=255) cccGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCctc < 2:4236911/57‑1 (MQ=255) cGTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGtt < 2:4236791/101‑1 (MQ=255) cGTTTTG‑CCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtc > 1:4237277/1‑101 (MQ=255) gTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAAccc > 2:4237279/1‑37 (MQ=37) gTTTTGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtc < 2:4236929/101‑1 (MQ=255) ttttGCCCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtct < 2:4236849/101‑1 (MQ=255) ttG‑CCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtctctc > 1:4237286/1‑101 (MQ=255) | TATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCC‑CTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTA > NC_000913/2601910‑2602110 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |