New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1870229 | 0 (0.000) | 354 (1.100) | 164/194 | 0.0 | 100% | coding (1275/1284 nt) | yeaH | DUF444 domain‑containing protein YeaH |
? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
Only 100 of 354 total aligned reads displayed.
GCAATCTACTTTCGACAACTTTGCGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1870130‑1870229 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > NC_000913/1978503‑1978602 TCTACTTTCGACAACTTTGCGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAA < 1:3048651/101‑1 CTACTTTCGACAACTTTGCGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAAT > 1:3048963/1‑101 CTACTTTCGACAACTTTGCGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAAT > 1:1714742/1‑101 CTACTTTCGACAACTTTGCGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAAT < 1:3048262/101‑1 CTACTTTCGACAACTTTGCGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAAT < 1:3048638/101‑1 TACTTTCGACAACTTTGCGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATG < 2:3048723/101‑1 CTTTCGACAACTTTGCGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGAC < 2:3048709/101‑1 CTTTCGACAACTTTGCGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGAC < 1:3048614/101‑1 CTTTCGACAACTTTGCGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTCAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGAC > 2:3048964/1‑101 TTCGACAACTTTGCGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTC > 2:1715062/1‑101 TCGACAACTTTGCGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCC < 1:3048717/101‑1 CGACAACTTTGCGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCA < 1:3048800/101‑1 GACAACTTTGCGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAA < 2:3048549/101‑1 GACAACTTTGCGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAA < 2:3048664/101‑1 ACAACTTTGCGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAAC > 1:3048970/1‑101 ACAACTTTGCGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAAC > 2:3048969/1‑101 ACAACTTTGCGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGA < 2:3048749/94‑1 ACTTTGCGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTA > 1:3048974/1‑101 TTTGCGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATT > 1:1715072/1‑101 CGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATA < 1:3048745/101‑1 CGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATA > 1:3048980/1‑101 GATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG < 1:3048809/101‑1 GATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG < 1:3048865/101‑1 ATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT > 2:3048984/1‑101 ATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT < 1:3048680/101‑1 CAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTT > 1:3048989/1‑101 AGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT < 1:3048774/101‑1 GCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT < 2:3048849/101‑1 CACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA > 1:1714963/1‑101 CACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA > 2:3048990/1‑101 ACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT > 2:1714907/1‑101 CATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG < 1:3048480/101‑1 ATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 1:3048995/1‑101 ATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 2:1714942/1‑101 TCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 2:3048697/101‑1 CCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTC < 2:3048768/101‑1 CGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCA < 2:3048567/101‑1 GCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG < 1:3048600/101‑1 GCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG < 2:3048757/101‑1 CGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:3048736/101‑1 GACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT > 2:1715020/1‑101 GACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT > 1:3049001/1‑101 GACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT > 2:3049000/1‑101 ACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA < 1:3048574/101‑1 ACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA > 1:1714993/1‑101 ACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT > 1:1715059/1‑100 CAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT > 2:3049005/1‑101 AGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG < 2:3048793/101‑1 AGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG > 1:3049008/1‑101 GGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGC > 1:1714903/1‑101 ATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCC > 2:3049012/1‑101 GATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA < 2:33317/101‑1 GATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA < 1:33318/101‑1 ATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAT < 1:33314/101‑1 TATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG > 1:33307/1‑101 ATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA > 2:33300/1‑101 ATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA < 2:33304/101‑1 TTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC < 1:33299/101‑1 ATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTT > 2:33294/1‑101 TCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTG < 2:33287/101‑1 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GCAATCTACTTTCGACAACTTTGCGATGCAGCACATCCGCGACCAGGATGATATTTATCCGGTGTTCCGTGAACTGTTTCATAAACAAAATGCAACAGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1870130‑1870229 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > NC_000913/1978503‑1978602 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |