Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 26,293 | C→T | A6V (GCC→GTC) | ispH → | 1‑hydroxy‑2‑methyl‑2‑(E)‑butenyl 4‑diphosphate reductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 26,293 | 0 | C | T | 99.7% | 1240.2 / NA | 292 | A6V (GCC→GTC) | ispH | 1‑hydroxy‑2‑methyl‑2‑(E)‑butenyl 4‑diphosphate reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (145/146); total (146/146) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
GATTTCAACCATCCGCTGGCCGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGCCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCAC > NC_000913/26195‑26387 | gATTTCAACCATCCGCTGGCCGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCa > 1:44579/1‑101 (MQ=255) gATTTCAACCATCCGCTGGCCGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCa < 1:44101/101‑1 (MQ=255) gATTTCAACCATCCGCTGGCCGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCa > 2:44580/1‑101 (MQ=255) gATTTCAACCATCCGCTGGCCGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCa < 1:44203/101‑1 (MQ=255) aTTTCAACCATCCGCTGGCCGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCaa > 2:44582/1‑101 (MQ=255) tCAACCATCCGCTGGCCGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAAccc > 2:44585/1‑101 (MQ=255) aaCCATCCGCTGGCCGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCcgc > 2:44588/1‑101 (MQ=255) cATCCGCTGGCCGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTg < 1:44054/101‑1 (MQ=255) aTCCGCTGGCCGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTgg < 2:44246/101‑1 (MQ=255) aTCCGCTGGCCGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTgg > 1:44596/1‑101 (MQ=255) aTCCGCTGGCCGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTgg > 1:44593/1‑101 (MQ=255) ccGCTGGCCGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGtt < 1:44068/101‑1 (MQ=255) cGCTGGCCGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGGGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGttt > 2:44598/1‑101 (MQ=255) cGCTGGCCGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGttt < 2:44137/101‑1 (MQ=255) gCTGGCCGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGtttt > 1:44601/1‑101 (MQ=255) cTGGCCGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGttttt > 2:44604/1‑101 (MQ=255) cTGGCCGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGttttt < 1:44005/101‑1 (MQ=255) cTGGCCGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGttttt < 2:44283/101‑1 (MQ=255) tGGCCGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTtg > 1:44608/1‑101 (MQ=255) tGGCCGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGAGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTtg > 2:44609/1‑101 (MQ=255) ccGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGc < 1:44197/101‑1 (MQ=255) cGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGcc > 2:44613/1‑101 (MQ=255) gCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCggg > 1:44616/1‑101 (MQ=255) gCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCggg < 2:44102/101‑1 (MQ=255) aGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGt > 2:44620/1‑101 (MQ=255) aGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGt > 1:44621/1‑101 (MQ=255) gACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGc < 2:43925/94‑1 (MQ=255) gACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTa < 1:44156/101‑1 (MQ=255) gACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTa < 2:44263/101‑1 (MQ=255) aCCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAg < 2:44146/101‑1 (MQ=255) ccGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGa > 2:44625/1‑101 (MQ=255) cGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGAc < 1:44210/101‑1 (MQ=255) gTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGAcc > 1:44629/1‑101 (MQ=255) tCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGAc > 1:44633/1‑98 (MQ=255) tCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACcgc > 2:44632/1‑101 (MQ=255) aTTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGttt > 1:44637/1‑80 (MQ=255) tttGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTa > 1:44640/1‑91 (MQ=255) tttGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTa < 1:44035/101‑1 (MQ=255) ttGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTAt < 2:44180/101‑1 (MQ=255) gATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCa < 2:44357/101‑1 (MQ=255) atatTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAg > 1:44646/1‑101 (MQ=255) atatTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAg > 2:44643/1‑101 (MQ=255) tatTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGc < 2:44256/101‑1 (MQ=255) ttGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCAt > 1:44649/1‑101 (MQ=255) tGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCAtt > 1:44652/1‑101 (MQ=255) aaGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCAttgt < 2:44398/101‑1 (MQ=255) aaGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCAttgt > 2:44655/1‑101 (MQ=255) aGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCAttgtt < 1:44267/101‑1 (MQ=255) tGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGa < 1:43943/101‑1 (MQ=255) gCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGaa > 2:44658/1‑101 (MQ=255) cTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGaaa < 1:44274/101‑1 (MQ=255) cTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGaaa < 2:44077/101‑1 (MQ=255) cTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGaaa > 1:44659/1‑101 (MQ=255) aaaTCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGCAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGaaa > 1:44663/1‑97 (MQ=255) aaTCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTTAAAAcgcg < 2:44312/101‑1 (MQ=255) aaTCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAAcgcg < 2:44364/101‑1 (MQ=255) tCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCt > 1:44666/1‑101 (MQ=255) cGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTg > 2:44668/1‑101 (MQ=255) cGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTg < 1:44464/101‑1 (MQ=255) gATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTgg > 2:44675/1‑101 (MQ=255) gATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTgg > 1:44673/1‑101 (MQ=255) aTCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGc > 1:44678/1‑101 (MQ=255) tCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGcc < 1:44175/101‑1 (MQ=255) ccGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCa > 2:44681/1‑101 (MQ=255) cGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCAt < 1:44079/101‑1 (MQ=255) cGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCAt < 1:44147/101‑1 (MQ=255) cACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTa > 1:44684/1‑101 (MQ=255) cACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTa < 1:44329/101‑1 (MQ=255) aCTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTAc > 1:44688/1‑101 (MQ=255) aCTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTAc > 2:44689/1‑101 (MQ=255) cTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGa < 1:44218/60‑1 (MQ=255) tGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACgg < 2:44126/101‑1 (MQ=255) tGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACgg < 1:44224/101‑1 (MQ=255) ggAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTg < 2:44324/89‑1 (MQ=255) ggAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGgc > 1:44694/1‑101 (MQ=255) ggAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGgc < 2:44159/101‑1 (MQ=255) gAGGCGTAACATGCAGATCCCGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGgcg > 2:44696/1‑101 (MQ=255) aGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGgcgc > 1:44698/1‑101 (MQ=255) aGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGgcgc < 1:44253/101‑1 (MQ=255) ggCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCa < 1:44367/101‑1 (MQ=255) ggCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCa > 2:44701/1‑101 (MQ=255) gCGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCAc < 2:44235/101‑1 (MQ=255) cGTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCAcc < 1:44309/101‑1 (MQ=255) gTAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCg > 2:44704/1‑101 (MQ=255) tAACATGCAGATCCTGTTGGTCATCCCGCGTGGttttt < 1:44193/38‑1 (MQ=38) tAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGa > 2:44708/1‑101 (MQ=255) tAACATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGa < 1:44323/101‑1 (MQ=255) aaCATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGat > 1:44710/1‑101 (MQ=255) aCATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGata < 2:43968/101‑1 (MQ=255) cATGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGatat < 1:43978/101‑1 (MQ=255) aTGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGatata > 2:44714/1‑101 (MQ=255) tGCAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGatatat > 2:44717/1‑101 (MQ=255) cAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGt < 1:44288/101‑1 (MQ=255) cAGATCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGt > 2:44720/1‑101 (MQ=255) aTCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTGCg < 2:44190/101‑1 (MQ=255) tCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGt < 2:44171/101‑1 (MQ=255) tCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGt > 1:44722/1‑101 (MQ=255) tCCTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGt < 1:44239/101‑1 (MQ=255) cTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCa < 2:44481/101‑1 (MQ=255) cTGTTGGTCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCa < 1:44121/101‑1 (MQ=255) | GATTTCAACCATCCGCTGGCCGGGCAGACCGTTCATTTTGATATTGAAGTGCTGGAAATCGATCCGGCACTGGAGGCGTAACATGCAGATCCTGTTGGCCAACCCGCGTGGTTTTTGTGCCGGGGTAGACCGCGCTATCAGCATTGTTGAAAACGCGCTGGCCATTTACGGCGCACCGATATATGTCCGTCAC > NC_000913/26195‑26387 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |