| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,131,622 | T→C | V62A (GTA→GCA) | flgC → | flagellar basal‑body rod protein FlgC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,131,622 | 0 | T | C | 83.0% | 778.6 / 139.3 | 283 | V62A (GTA→GCA) | flgC | flagellar basal‑body rod protein FlgC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (23/25); new base C (112/123); total (135/148) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
GAATGCTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGTAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGCTACGTAAAAATGCCGAAC > NC_000913/1131524‑1131722 | gAATGCTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCaa < 1:1845220/101‑1 (MQ=255) aaTGCTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCaaa < 1:1845091/101‑1 (MQ=255) aTGCTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGTAAAg > 2:1845787/1‑101 (MQ=255) aTGCTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAg < 2:1845453/101‑1 (MQ=255) aTGCTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAg < 1:1845323/101‑1 (MQ=255) gCTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGt < 2:1845182/101‑1 (MQ=255) cTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGTAAAGGtt > 2:1845791/1‑101 (MQ=255) gATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGc > 1:1845793/1‑101 (MQ=255) aGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGa < 2:1845435/101‑1 (MQ=255) aGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGa > 2:1845798/1‑101 (MQ=255) gCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGAt < 1:1845369/101‑1 (MQ=255) gTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGt > 1:1845800/1‑101 (MQ=255) tGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGtt < 2:1845393/101‑1 (MQ=255) tGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGtt < 2:1845343/101‑1 (MQ=255) ccGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTtata < 1:1845543/101‑1 (MQ=255) ccGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTtata < 2:1845542/101‑1 (MQ=255) cGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAg > 2:1845803/1‑101 (MQ=255) gTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGaa < 2:1845463/101‑1 (MQ=255) gTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGaa < 2:1845290/101‑1 (MQ=255) tCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGaaa > 2:1845806/1‑101 (MQ=255) cccGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGTAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAg < 2:1845104/101‑1 (MQ=255) ccGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGt > 1:1845807/1‑101 (MQ=255) cGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTc < 2:1845477/101‑1 (MQ=255) gATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGTAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCa > 2:1845811/1‑101 (MQ=255) gATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTtata < 1:1845350/93‑1 (MQ=255) gATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCa < 2:1845329/101‑1 (MQ=255) aTGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAg > 2:1845815/1‑101 (MQ=255) tGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAgg < 1:1845408/101‑1 (MQ=255) tGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAgg > 1:1845816/1‑101 (MQ=255) gACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGcc < 2:1845306/101‑1 (MQ=255) cAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGcccc < 1:1845515/101‑1 (MQ=255) cAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGcccc < 1:1845423/101‑1 (MQ=255) aGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCg < 1:1845294/101‑1 (MQ=255) gCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCgg < 1:1845706/101‑1 (MQ=255) gCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCgg < 2:1845427/101‑1 (MQ=255) ccATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGa > 1:1845821/1‑101 (MQ=255) cATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGAc > 2:1845822/1‑101 (MQ=255) atatCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACa > 1:1845825/1‑101 (MQ=255) tatCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACaa < 1:1845286/101‑1 (MQ=255) atCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGTAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACaaa < 2:1845362/101‑1 (MQ=255) cGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGTaaa < 2:1845248/62‑1 (MQ=255) cGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACt > 2:1845828/1‑101 (MQ=255) gggCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTg > 1:1845834/1‑101 (MQ=255) gggCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTg > 1:1845831/1‑101 (MQ=255) gCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGt < 1:1845268/101‑1 (MQ=255) gCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGt < 1:1845356/101‑1 (MQ=255) gCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGt < 1:1845602/101‑1 (MQ=255) cAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAAc > 1:1845838/1‑96 (MQ=255) aaaaCAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGttt > 2:1845839/1‑101 (MQ=255) aaaCAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGTAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTa > 1:1845845/1‑101 (MQ=255) aaaCAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTa > 2:1845842/1‑101 (MQ=255) aaCAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTAt > 1:1845848/1‑101 (MQ=255) aaCAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTAt < 2:1845404/101‑1 (MQ=255) aCAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATg < 2:1845503/101‑1 (MQ=255) cAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGtt < 1:1845534/96‑1 (MQ=255) cAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGa > 2:1845850/1‑101 (MQ=255) ggtggtATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAAc < 1:1845395/101‑1 (MQ=255) gtggtATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAAcc < 1:1845312/101‑1 (MQ=255) gtggtATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAAcc < 2:1845569/101‑1 (MQ=255) tggtATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCg > 1:1845855/1‑101 (MQ=255) gtATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCggg < 1:1845580/101‑1 (MQ=255) gtATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCggg < 1:1845445/101‑1 (MQ=255) tATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGTAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGt > 1:1845857/1‑101 (MQ=255) tATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGt > 1:1845861/1‑101 (MQ=255) tATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGt > 2:1845860/1‑101 (MQ=255) ccAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATc < 1:1845512/101‑1 (MQ=255) cAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATcc < 1:1845330/101‑1 (MQ=255) cAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATcc < 2:1845450/101‑1 (MQ=255) aGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGTAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCg > 1:1845866/1‑101 (MQ=255) aGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCg > 2:1845867/1‑101 (MQ=255) ggTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGc > 1:1845872/1‑101 (MQ=255) ttAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTg > 2:1845875/1‑101 (MQ=255) ttAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTg > 1:1845876/1‑101 (MQ=255) tAACGCTGCACCAGGTGCTGCGAGAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGtt < 1:1845202/49‑1 (MQ=255) aaCGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGTAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGt < 2:1845376/90‑1 (MQ=255) cGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGaa > 2:1845881/1‑52 (MQ=255) gCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGTAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGa > 1:1845882/1‑101 (MQ=255) gCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGa > 1:1845884/1‑101 (MQ=255) cTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGAt < 2:1845444/101‑1 (MQ=255) cTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGAt < 1:1845161/101‑1 (MQ=255) tGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATg < 2:1845415/101‑1 (MQ=255) tGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATg < 2:1845629/101‑1 (MQ=255) gCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGc > 2:1845888/1‑101 (MQ=255) cACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCa < 1:1845505/101‑1 (MQ=255) cACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCa < 1:1845371/101‑1 (MQ=255) aCCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCaa > 2:1845890/1‑101 (MQ=255) ccAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTtat > 1:1845894/1‑41 (MQ=255) cAGGTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAg > 2:1845896/1‑101 (MQ=255) gTGCTGCGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGc < 2:1845591/101‑1 (MQ=255) tgctgcGACAGGCGGCGTAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGCt > 1:1845899/1‑101 (MQ=255) tgcGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGCTACg > 2:1845903/1‑101 (MQ=255) tgcGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGCTACg > 1:1845904/1‑101 (MQ=255) tgcGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGCTACg < 1:1845045/101‑1 (MQ=255) gcGACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGCTACGt > 1:1845907/1‑101 (MQ=255) gACAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGCTACGTaa < 1:1845614/101‑1 (MQ=255) cAGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGCTACGTaaaa > 2:1845911/1‑101 (MQ=255) aGGCGGCGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGCTACGTaaaaa > 1:1845914/1‑101 (MQ=255) ggcggcGCAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGCTACGTAAAAAt > 2:1845916/1‑101 (MQ=255) gcgTAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGCTACGTAAAAATGCCg > 2:1845921/1‑101 (MQ=255) cgTAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGCTACGTAAAAATGCCGa < 1:1845471/101‑1 (MQ=255) | GAATGCTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGTAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGCTACGTAAAAATGCCGAAC > NC_000913/1131524‑1131722 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |