Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,083,355 | A→G | V823A (GTC→GCC) | fdoG ← | formate dehydrogenase O subunit alpha |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,083,355 | 0 | A | G | 83.7% | 727.8 / 120.9 | 264 | V823A (GTC→GCC) | fdoG | formate dehydrogenase O subunit alpha |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (24/19); new base G (116/105); total (140/124) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.40e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 265 total aligned reads displayed.
TTTCAAACGGCTCGTAGTGTTCCGGGAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGACGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTCAGCAACTGACGCTTCGGATCCCACGGGT > NC_000913/4083257‑4083454 | tttCAAACGGCTCGTAGTGTTCCGGGAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGcg > 1:6728735/1‑101 (MQ=255) tCAAACGGCTCGTAGTGTTCCGGGAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGcgcc > 1:6728739/1‑101 (MQ=255) tCAAACGGCTCGTAGTGTTCCGGGAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGcgcc > 2:6728738/1‑101 (MQ=255) aaaCGGCTCGTAGTGTTCCGGGAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGcgccgc > 1:6728742/1‑101 (MQ=255) aaCGGCTCGTAGTGTTCCGGGAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCt < 2:6727969/101‑1 (MQ=255) aCGGCTCGTAGTGTTCCGGGAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTa < 2:6728446/101‑1 (MQ=255) cGGCTCGTAGTGTTCCGGGAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCt < 1:6728512/99‑1 (MQ=255) cGGCTCGTAGTGTTCCGGGAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTAc > 2:6728746/1‑101 (MQ=255) tCGTAGTGTTCCGGGAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCgg > 1:6728750/1‑101 (MQ=255) gTAGTGTTCCGGGAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAg < 2:6728333/101‑1 (MQ=255) gTAGTGTTCCGGGAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAg > 1:6728753/1‑101 (MQ=255) gTAGTGTTCCGGGAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAg > 2:6728754/1‑101 (MQ=255) tAGTGTTCCGGGAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAgg < 2:6728383/101‑1 (MQ=255) tAGTGTTCCGGGAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGACGCCGCTACCCGGAgg < 2:6728418/101‑1 (MQ=255) aGTGTTCCGGGAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGgc < 2:6728425/101‑1 (MQ=255) ttCCGGGAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGgcgctg > 1:6728759/1‑101 (MQ=255) tCCGGGAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGgcgctgc > 2:6728761/1‑101 (MQ=255) tCCGGGAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGgcgctgc < 2:6728278/101‑1 (MQ=255) ccGGGAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGgcgctgcg > 1:6728765/1‑101 (MQ=255) ccGGGAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGgcgctgcg > 1:6728763/1‑101 (MQ=255) gAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGt > 2:6728769/1‑101 (MQ=255) aaCGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTa > 1:6728771/1‑101 (MQ=255) cGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGcgcc > 1:6728776/1‑75 (MQ=255) cGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGt < 2:6728372/101‑1 (MQ=255) cGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGt > 2:6728775/1‑101 (MQ=255) ggACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTc > 1:6728779/1‑101 (MQ=255) ggACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTc < 1:6728388/101‑1 (MQ=255) ggACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGACGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTc < 1:6728346/101‑1 (MQ=255) gACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGgcg > 2:6728781/1‑87 (MQ=255) aCCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCg < 1:6728422/101‑1 (MQ=255) aCCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCg > 1:6728783/1‑101 (MQ=255) ccTTCCGCCATCTTATTGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCgg < 1:6728129/101‑1 (MQ=255) cTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGa > 1:6728786/1‑101 (MQ=255) ttCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGaa > 2:6728789/1‑101 (MQ=255) ccGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAata < 1:6728459/101‑1 (MQ=255) cGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAatat < 2:6728498/101‑1 (MQ=255) cGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAatat > 1:6728793/1‑101 (MQ=255) gCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATc < 1:6727974/101‑1 (MQ=255) gCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATc < 2:6728223/101‑1 (MQ=255) gCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATc < 1:6728270/101‑1 (MQ=255) gCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATc < 1:6728107/101‑1 (MQ=255) ccATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATcc > 2:6728795/1‑101 (MQ=255) cATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGACGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATccc > 2:6728797/1‑101 (MQ=255) tCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAg < 2:6728310/101‑1 (MQ=255) tCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAg < 2:6728409/101‑1 (MQ=255) cTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGc < 2:6728259/101‑1 (MQ=255) ttATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGcc > 1:6728800/1‑101 (MQ=255) ttATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGACGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGcc < 1:6728453/101‑1 (MQ=255) tATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCg < 2:6728181/101‑1 (MQ=255) aTCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCgg > 2:6728804/1‑101 (MQ=255) aTCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCgg < 2:6728204/101‑1 (MQ=255) cGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTc < 2:6728436/101‑1 (MQ=255) gAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTcc > 1:6728807/1‑101 (MQ=255) gAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTcc < 2:6728405/101‑1 (MQ=255) aGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGACGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCa < 2:6728320/101‑1 (MQ=255) gggCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCAc > 1:6728809/1‑101 (MQ=255) gCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACtt < 1:6728339/101‑1 (MQ=255) gCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACtt > 2:6728810/1‑101 (MQ=255) cAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTa < 2:6728599/101‑1 (MQ=255) aaaCAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAg > 2:6728813/1‑101 (MQ=255) aaCAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGt > 2:6728817/1‑101 (MQ=255) aaCAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGACGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCg > 1:6728818/1‑76 (MQ=255) aCAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGACGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTg < 2:6728176/101‑1 (MQ=255) cAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGc < 1:6728221/101‑1 (MQ=255) gACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCg > 2:6728821/1‑101 (MQ=255) gACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCg < 1:6728356/101‑1 (MQ=255) aCGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGt > 2:6728824/1‑101 (MQ=255) cGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTc > 1:6728827/1‑101 (MQ=255) gCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTcc < 2:6728364/101‑1 (MQ=255) gCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTcc < 1:6728254/101‑1 (MQ=255) ccccATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTccc > 2:6728829/1‑101 (MQ=255) cccATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCa < 2:6728291/101‑1 (MQ=255) cATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGACGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCAtt > 1:6728831/1‑101 (MQ=255) aTGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCAttt < 1:6728307/101‑1 (MQ=255) aTGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCAttt > 1:6728834/1‑101 (MQ=255) aTGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCAttt < 2:6728575/101‑1 (MQ=255) tGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTc < 1:6728485/101‑1 (MQ=255) tGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTc > 1:6728836/1‑101 (MQ=255) gCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGACGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTCa > 1:6728839/1‑101 (MQ=255) gCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGACGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTCa < 2:6728083/101‑1 (MQ=255) ccTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGACGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTCAg > 2:6728842/1‑101 (MQ=255) ttCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGgcgc > 2:6728847/1‑45 (MQ=255) ttCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGACGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGc > 1:6728846/1‑71 (MQ=255) tCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTCAGCaa < 2:6728450/101‑1 (MQ=255) tCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTCAGCaa > 1:6728850/1‑101 (MQ=255) ctgctgCATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTCAGCAACt > 1:6728854/1‑101 (MQ=255) tgctgcATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTCAGCAACTg > 2:6728856/1‑101 (MQ=255) gctgcATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTCAGCAACTGa > 1:6728858/1‑101 (MQ=255) gctgcATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTCAGCAACTGa < 1:6728175/101‑1 (MQ=255) ctgcATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTCAGCAACTGAc > 1:6728860/1‑101 (MQ=255) ctgcATGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTCAGCAACTGAc < 1:6728401/101‑1 (MQ=255) aTGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTCAGCAACTGACGCtt < 1:6728502/101‑1 (MQ=255) tGATAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTCAGCAACTGACGCTTc < 1:6728243/101‑1 (MQ=255) aTAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTCAGCAACTGACGCTTCgg > 2:6728865/1‑101 (MQ=255) aTAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTCAGCAACTGACGCTTCgg < 1:6728300/101‑1 (MQ=255) tAAACGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTCAGCAACTGACGCTTCGGa > 2:6728867/1‑101 (MQ=255) aCGGCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTCAGCAACTGACGCTTCGGATcc > 1:6728868/1‑101 (MQ=255) ggCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTCAGCAACTGACGCTTCGGATCCCa > 1:6728872/1‑101 (MQ=255) gCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTCAGCAACTGACGCTTCGGATCCCAc < 1:6728381/101‑1 (MQ=255) gCCCGGCGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTCAGCAACTGACGCTTCGGATCCCAc > 2:6728874/1‑101 (MQ=255) | TTTCAAACGGCTCGTAGTGTTCCGGGAACGGACCTTCCGCCATCTTATCGAGGGCAAACAGACGCCCCATGCCTTCCTGCTGCATGATAAACGGCCCGACGCCGCTACCCGGAGGCGCTGCGCTGTAGTCCGGAATATCCCAGCCGGTCCACTTAGTGCCGTCCCATTTCAGCAACTGACGCTTCGGATCCCACGGGT > NC_000913/4083257‑4083454 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |