| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,479,687 | (G)6→7 | coding (550/1758 nt) | ynbC → | hydrolase/methyltransferase domain‑containing protein YnbC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,479,681 | 1 | . | G | 99.3% | 1213.3 / 0.1 | 290 | coding (544/1758 nt) | ynbC | hydrolase/methyltransferase domain‑containing protein YnbC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base G (152/136); total (153/137) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.04e-01 | |||||||||||
Only 100 of 329 total aligned reads displayed.
GCCGCTGGCACGTCCTGCGCTGGCGTTATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAAC‑GGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTACAAAACGTCTGAACGTATTATTAGA > NC_000913/1479581‑1479776 | gCCGCTGGCACGTCCTGCGCTGGCGTTATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAAc < 1:2845651/101‑1 (MQ=255)gCCGCTGGCACGTCCTGCGCTGGCGTTATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAAc < 2:2845638/101‑1 (MQ=255)gCCGCTGGCACGTCCTGCGCTGGCGTTATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCAACGATCGGCAAc < 1:2845687/101‑1 (MQ=255) ccGCTGGCACGTCCTGCGCTGGCGTTATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAAC‑g > 2:2845988/1‑101 (MQ=255) gCTGGCACGTCCTGCGCTGGCGTTATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAAC‑ggg > 1:2845993/1‑101 (MQ=255) tGGCACGTCCTGCGCTGGCGTTATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAAC‑ggggg < 1:2845413/101‑1 (MQ=255) tGGCACGTCCTGCGCTGGCGTTATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAAC‑ggggg > 2:2845996/1‑101 (MQ=255) cACGTCCTGCGCTGGCGTTATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAAC‑gggggggc > 2:2846000/1‑99 (MQ=255) cGTCCTGCGCTGGCGTTATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAAC‑gggggggcga > 2:2846005/1‑97 (MQ=255) gTCCTGCGCTGGCGTTATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAAC‑gggggggcgag < 2:2845578/101‑6 (MQ=255) gTCCTGCGCTGGCGTTATGGCATCGTCTGCGTGGCCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAAC‑ggg > 1:2846008/1‑93 (MQ=255) cTGCGCTGGCGTTATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGttt < 1:2845486/101‑1 (MQ=255) cTGCGCTGGCGTTATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGttt < 1:2845926/101‑1 (MQ=255) tGCGCTGGCGTTATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGCTTc > 1:2846012/1‑101 (MQ=255) tGGCGTTATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCaataa > 2:2846016/1‑101 (MQ=255) tGGCGTTATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCaataa > 1:2846015/1‑101 (MQ=255) tGGCGTTATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCaataa < 1:2845312/101‑1 (MQ=255) gTTATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGAt < 1:2844914/101‑1 (MQ=255) gTTATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGAt < 1:2845431/101‑1 (MQ=255) gTTATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGAt > 1:2846021/1‑101 (MQ=255) ttATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATc > 2:2846022/1‑101 (MQ=255) ttATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATc < 2:2845378/101‑1 (MQ=255) aTGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATc < 1:2845369/99‑1 (MQ=255) tGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCg < 1:2845855/100‑1 (MQ=255) tGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGc > 2:2846027/1‑101 (MQ=255) cATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGa > 1:2846031/1‑101 (MQ=255) aTCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGAt > 2:2846036/1‑101 (MQ=255) aTCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGAt < 2:2845615/101‑1 (MQ=255) tCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATc > 1:2846037/1‑101 (MQ=255) gTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATcac > 1:2846040/1‑101 (MQ=255) gTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATcac < 1:2845539/101‑1 (MQ=255) tCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATcaca < 1:2845460/101‑1 (MQ=255) tCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTAGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATcaca > 1:2846044/1‑101 (MQ=255) cTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCacac < 1:2845700/101‑1 (MQ=255) gCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACgg < 1:2845780/101‑1 (MQ=255) gCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACgg > 1:2846051/1‑101 (MQ=255) cGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACggg < 1:2845567/101‑1 (MQ=255) gTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGc < 2:2845544/101‑1 (MQ=255) gTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGc < 1:2845259/101‑1 (MQ=255) gTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGc > 2:2846054/1‑101 (MQ=255) tGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCg < 1:2845606/101‑1 (MQ=255) tGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCg > 2:2846058/1‑101 (MQ=255) 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2:2846075/1‑101 (MQ=255) tttATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTa > 1:2846076/1‑101 (MQ=255) ttattaATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTg > 2:2846080/1‑94 (MQ=255) tattaATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAat < 1:2845744/101‑1 (MQ=255) attaATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAata < 2:2845785/101‑1 (MQ=255) ttaATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAatat > 1:2846084/1‑101 (MQ=255) taATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATc > 2:2846089/1‑101 (MQ=255) taATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATc > 1:2846087/1‑101 (MQ=255) ttCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTg < 2:2845598/101‑1 (MQ=255) tCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGc > 1:2846094/1‑101 (MQ=255) cTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTc > 2:2846097/1‑101 (MQ=255) tATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCg < 2:2845440/101‑1 (MQ=255) aTGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGa > 1:2846101/1‑101 (MQ=255) tgtgAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGAt < 1:2845632/101‑1 (MQ=255) tgtgAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGAt > 2:2846104/1‑101 (MQ=255) tgAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGAtct > 2:2846108/1‑101 (MQ=255) tgAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGAtct > 1:2846109/1‑101 (MQ=255) gAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGAtctc > 1:2846115/1‑101 (MQ=255) gAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGAtctc < 2:2845505/101‑1 (MQ=255) aaaGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATctct > 2:2846118/1‑101 (MQ=255) aaaGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATctct < 2:2845584/101‑1 (MQ=255) aaGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTa > 2:2846125/1‑101 (MQ=255) aaGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTa > 1:2846122/1‑101 (MQ=255) ggACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTACa > 2:2846129/1‑101 (MQ=255) gACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTACaa > 1:2846130/1‑101 (MQ=255) gACGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTACaa < 2:2845711/101‑1 (MQ=255) aCGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTACaaa < 2:2845344/101‑1 (MQ=255) ctcTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTACa < 2:2845747/96‑1 (MQ=255) cGCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATc < 2:2845698/58‑1 (MQ=255) gCTATTTGACCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTACAAAAc > 1:2846135/1‑101 (MQ=255) 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1:2846154/1‑101 (MQ=255) gACCCACGAGCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTACAAAACGTCTGaa > 1:2846151/1‑101 (MQ=255) aCCCACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTACAAAACGTCTGAAc < 1:2845713/101‑1 (MQ=255) ccACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTACAAAACGTCTGAACGt < 1:2845551/101‑1 (MQ=255) cACGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTACAAAACGTCTGAACGta > 2:2846159/1‑101 (MQ=255) cGATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTACAAAACGTCTGAACGtatt < 2:2845657/101‑1 (MQ=255) gATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTACAAAACGTCTGAACGtatta > 2:2846162/1‑101 (MQ=255) gATCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTACAAAACGTCTGAACGtatta > 2:2846165/1‑101 (MQ=255) aTCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTACAAAACGTCTGAACGtattat < 1:2845479/101‑1 (MQ=255) tCGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTACAAAACGTCTGAACGTattatt < 1:2845534/101‑1 (MQ=255) cGGCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTACAAAACGTCTGAACGTAttatta < 1:2845399/101‑1 (MQ=255) cGGCAAC‑GGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTACAAAACGTc < 2:2845683/86‑1 (MQ=255) ggCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTACAAAACGTCTGAACGTATTATTag > 1:2846169/1‑101 (MQ=255) gCAACGGGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTACAAAACGTCTGAACGTATTATTaga < 2:2845480/101‑1 (MQ=255) | GCCGCTGGCACGTCCTGCGCTGGCGTTATGGCATCGTCTGCGTGGTCTGTTTTTTATTAATTCCTATGTGAAAGGACGCTATTTGACCCACGATCGGCAAC‑GGGGGGCGAGTTTCAATAATGATCCGCTGATCACACGGGCGATTGCCGTTAATATCTTGCTCGATCTCTACAAAACGTCTGAACGTATTATTAGA > NC_000913/1479581‑1479776 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |