| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,712,518 | (C)6→7 | intergenic (+360/‑251) | nth → / → dtpA | endonuclease III/dipeptide/tripeptide:H(+) symporter DtpA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,712,512 | 1 | . | C | 98.5% | 1374.2 / 9.9 | 333 | intergenic (+354/‑257) | nth/dtpA | endonuclease III/dipeptide/tripeptide:H(+) symporter DtpA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/5); new base C (169/159); total (169/164) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.81e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 381 total aligned reads displayed.
AATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCA > NC_000913/1712412‑1712608 | aaTATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑Ca < 2:3286688/101‑1 (MQ=255) atTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CA‑ccc > 2:3287297/1‑101 (MQ=255) ttGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CA‑cccc > 1:3287299/1‑101 (MQ=255) ttGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CA‑cccc < 2:3286519/101‑1 (MQ=255) tGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CA‑ccccc > 1:3287302/1‑101 (MQ=255) aCCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CA‑ccccccc < 2:3286712/101‑2 (MQ=255) aCCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CA‑ccccccc < 1:3286840/101‑2 (MQ=255) ccTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CA‑ccccccct > 2:3287309/1‑99 (MQ=255) cTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CA‑ccccccctc > 1:3287310/1‑98 (MQ=255) tACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CA‑ccccccct < 1:3286609/99‑3 (MQ=255) aCAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CA‑ccccccctctc > 1:3287315/1‑96 (MQ=255) cAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTca < 1:3286637/101‑1 (MQ=255) cAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CA‑CCCCCCcctctc < 1:3286660/101‑3 (MQ=255) aaacCATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTcag > 2:3287317/1‑101 (MQ=255) cATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCCC‑CCCCCCTCTcagtgca < 1:3286262/101‑1 (MQ=255) cATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTcagtgca > 2:3287326/1‑101 (MQ=255) cATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTcagtgca > 1:3287325/1‑101 (MQ=255) cATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTcagtgca < 2:3286800/101‑1 (MQ=255) ttACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTcagtgcagt < 2:3286612/101‑1 (MQ=255) acacTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGa > 2:3287332/1‑101 (MQ=255) acacTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGa < 1:3286579/101‑1 (MQ=255) acTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGaaa < 1:3286810/101‑1 (MQ=255) cTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGaaaa > 2:3287337/1‑101 (MQ=255) cTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGaaaa < 1:3286922/101‑1 (MQ=255) cTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGaaaa > 1:3287340/1‑101 (MQ=255) cTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGa < 1:3286504/98‑1 (MQ=255) tGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGaaaaa < 2:3286852/101‑1 (MQ=255) tGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGaaaaa > 2:3287343/1‑101 (MQ=255) tGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGaaaaa > 1:3287345/1‑101 (MQ=255) ggCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGaaaaaa < 1:3286683/101‑1 (MQ=255) cTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATc < 2:3286752/101‑1 (MQ=255) tATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCt < 2:3286934/101‑1 (MQ=255) tATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCt > 1:3287350/1‑101 (MQ=255) tATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCt < 2:3286880/101‑1 (MQ=255) tttttCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGc < 2:3286819/101‑1 (MQ=255) ttttCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGcc > 1:3287355/1‑101 (MQ=255) ttttCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGcc < 1:3286940/101‑1 (MQ=255) ttCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGt > 2:3287357/1‑101 (MQ=255) ttCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGt < 2:3286781/101‑1 (MQ=255) cAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTa < 2:3286998/101‑1 (MQ=255) cAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTa < 2:3286163/101‑1 (MQ=255) cAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTa > 2:3287363/1‑101 (MQ=255) cAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTa > 1:3287364/1‑101 (MQ=255) gAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACg < 2:3286654/101‑1 (MQ=255) aaaCTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGt > 2:3287372/1‑101 (MQ=255) aaaCTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGt > 1:3287371/1‑101 (MQ=255) aaCTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGtt < 2:3286702/101‑1 (MQ=255) aCTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGttt > 1:3287376/1‑101 (MQ=255) aCTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGttt < 1:3286755/101‑1 (MQ=255) cTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGtttt > 2:3287380/1‑101 (MQ=255) gACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTg > 2:3287386/1‑101 (MQ=255) gACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTg > 1:3287387/1‑101 (MQ=255) aCTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCCC‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGa < 1:3286908/101‑1 (MQ=255) cTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGaa < 1:3286853/101‑1 (MQ=255) tATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGaaa > 2:3287394/1‑101 (MQ=255) aTCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGaaaa > 1:3287395/1‑101 (MQ=255) tctcACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGaaaaa < 2:3286735/101‑1 (MQ=255) tctcACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGaaaaa < 2:3286974/101‑1 (MQ=255) ctcACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGaaa > 2:3287399/1‑98 (MQ=255) tcACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAAtt < 1:3286667/101‑1 (MQ=255) tcACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAAtt < 1:3286973/101‑1 (MQ=255) tcACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAAtt < 1:3286790/101‑1 (MQ=255) aCTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTa > 1:3287403/1‑101 (MQ=255) cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTaa > 2:3287405/1‑101 (MQ=255) cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTaa < 2:3286764/101‑1 (MQ=255) cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTaa < 1:3286720/101‑1 (MQ=255) tAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAAc < 2:3286894/101‑1 (MQ=255) gTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGc > 1:3287411/1‑101 (MQ=255) aaaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTgg > 1:3287415/1‑101 (MQ=255) aaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTACGCCAT‑CACCCCCCCTCTca > 2:3287417/1‑51 (MQ=38) aCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATa < 2:3287113/101‑1 (MQ=255) cGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATaa > 1:3287423/1‑101 (MQ=255) gCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAAc > 1:3287427/1‑101 (MQ=255) tAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACAt > 1:3287433/1‑101 (MQ=255) aaaTAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACAtt < 1:3286996/101‑1 (MQ=255) aaTAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACAttt > 2:3287438/1‑101 (MQ=255) aaTAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACAttt > 1:3287439/1‑101 (MQ=255) aGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTacc < 1:3286883/101‑1 (MQ=255) gCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTccc > 1:3287446/1‑100 (MQ=255) gCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCg > 2:3287444/1‑101 (MQ=255) gAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGaa > 1:3287452/1‑101 (MQ=255) aaCATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAAt < 2:3286920/101‑1 (MQ=255) cATATCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATgg < 1:3287157/101‑1 (MQ=255) atatCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGt > 2:3287455/1‑101 (MQ=255) atatCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGAAATGGt > 1:3287459/1‑101 (MQ=255) atCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTg > 2:3287462/1‑101 (MQ=255) tCGCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGa < 2:3286950/101‑1 (MQ=255) gCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAAt > 2:3287469/1‑101 (MQ=255) gCCGTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAAt > 1:3287467/1‑101 (MQ=255) gTTAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTcc < 1:3286780/101‑1 (MQ=255) tAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAAc < 2:3287426/76‑1 (MQ=255) tAAGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTcccc > 1:3287476/1‑101 (MQ=255) aaGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCg < 2:3286421/101‑1 (MQ=255) aGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGc < 2:3287037/101‑1 (MQ=255) aGCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGc < 1:3286861/101‑1 (MQ=255) gCCAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGcc > 2:3287480/1‑101 (MQ=255) ccAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt > 1:3287482/1‑101 (MQ=255) ccAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt < 1:3286826/101‑1 (MQ=255) cAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTc < 1:3287061/101‑1 (MQ=255) cAT‑CACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTc < 1:3287040/101‑1 (MQ=255) | AATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCAT‑CA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCA > NC_000913/1712412‑1712608 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |