| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,873,031 | IS1 (–) +9 bp | coding (991‑999/1491 nt) | dgcJ → | putative diguanylate cyclase DgcJ |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 291401 | NA (NA) | 431 (1.140) | 166/196 | 0.1 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1873031 = | 0 (0.000) | coding (991/1491 nt) | dgcJ | putative diguanylate cyclase DgcJ | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1873039 | 0 (0.000) | 402 (1.060) | 176/196 | 0.0 | 100% | coding (999/1491 nt) | dgcJ | putative diguanylate cyclase DgcJ |
| ? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 402 total aligned reads displayed.
GTTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1872940‑1873039‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > NC_000913/1978503‑1978602 GTTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACG > 2:3588779/1‑101 TTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGG > 1:3588781/1‑101 TTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGG > 1:2031088/1‑101 TATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGT > 2:2030934/1‑101 ATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTA < 2:3588152/101‑1 CCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAAT < 2:3588556/101‑1 CCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAAT < 1:3588386/101‑1 ATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGA > 2:2031146/1‑101 TTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGAC > 1:3588786/1‑101 GATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTC < 1:3588423/101‑1 GATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTC > 2:2030953/1‑101 GATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTC > 2:3588789/1‑101 TATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCA < 2:3588360/101‑1 ATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAA > 1:3588792/1‑101 ATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAA < 1:3588494/101‑1 TCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACT < 2:3588614/101‑1 CTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTT > 2:2031031/1‑101 TTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTA < 2:3588587/101‑1 TTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTAT < 2:3588493/101‑1 ACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTG < 2:3588221/101‑1 ACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTG > 2:2030979/1‑101 CTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGA < 1:3588342/101‑1 CTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGA > 2:3588798/1‑101 TTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGAT > 1:3588800/1‑101 TTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATA > 1:2031157/1‑101 ATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT > 1:2030954/1‑101 ACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTT < 2:3588302/101‑1 GTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT < 2:3588462/101‑1 GTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT > 1:3588808/1‑101 GTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT > 2:3588806/1‑101 TCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA > 2:2031092/1‑101 CTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT < 1:3588212/101‑1 CTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCC < 2:3588448/80‑1 TTCGTGGAAAAGAGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG < 1:3588436/101‑1 CGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 1:3588617/101‑1 GTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTC > 1:2031114/1‑101 GTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG > 2:3588814/1‑98 GGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG > 1:2031024/1‑101 GGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG < 2:3588401/101‑1 AAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT < 1:3588532/101‑1 AAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT < 2:3588527/101‑1 AAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT < 2:3588579/101‑1 AAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA < 1:3588571/101‑1 AAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAA > 2:3588819/1‑101 AAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAA > 1:3588821/1‑101 AAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAA < 2:3588671/101‑1 AGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT < 1:3588457/101‑1 AGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT < 1:3588634/101‑1 GCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG < 2:3588517/101‑1 GTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC < 2:3588603/101‑1 GTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC > 1:2030972/1‑101 TTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCC > 1:3588827/1‑101 CTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA > 1:545053/1‑101 CTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA < 1:2031692/101‑1 TGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAT < 2:2031691/101‑1 GTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG > 2:545050/1‑101 TTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA < 1:2031679/101‑1 TCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC < 2:2031670/101‑1 CTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACT < 1:2031663/101‑1 CTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACT > 1:545044/1‑101 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GTTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1872940‑1873039‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > NC_000913/1978503‑1978602 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |