| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 308,054 | (C)7→8 | coding (1279/2526 nt) | ecpC ← | putative fimbrial usher protein EcpC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 308,047 | 1 | . | C | 99.5% | 794.1 / ‑3.1 | 197 | coding (1286/2526 nt) | ecpC | putative fimbrial usher protein EcpC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base C (95/101); total (96/101) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.87e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.14e-01 | |||||||||||
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
CCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCG > NC_000913/307947‑308142 | ccACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCg < 1:524696/101‑1 (MQ=255) cacaGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑c > 1:525043/1‑101 (MQ=255) acaGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑cc > 2:525044/1‑101 (MQ=255) acaGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑cc < 2:524641/101‑1 (MQ=255) caGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑ccc > 1:525046/1‑101 (MQ=255) aGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑cccc > 1:525048/1‑101 (MQ=255) cGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑cccccc > 1:525052/1‑101 (MQ=255) cTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑ccccccccaa > 1:525055/1‑98 (MQ=255) cTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑ccccccccaa > 1:525057/1‑98 (MQ=255) cTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑ccccccccaa < 2:524207/101‑4 (MQ=255) aaaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑ccccccccaagc < 1:524653/101‑6 (MQ=255) aaaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑ccccccccaagc > 1:525061/1‑96 (MQ=255) aGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCgg > 1:525063/1‑101 (MQ=255) ccTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCa > 1:525065/1‑101 (MQ=255) cTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAg < 1:524646/101‑1 (MQ=255) cTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAg > 2:525067/1‑101 (MQ=255) tCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATCTTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑cc > 2:525069/1‑85 (MQ=255) cccGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑ccc < 2:524657/85‑1 (MQ=255) ccGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGt < 1:524709/101‑1 (MQ=255) ggTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCa > 2:525073/1‑101 (MQ=255) ggTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCa > 1:525072/1‑101 (MQ=255) ggTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCa < 1:524597/101‑1 (MQ=255) ggTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑ccccccccaag < 2:524601/90‑5 (MQ=255) gTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAg < 2:524963/101‑1 (MQ=255) tAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGa > 1:525077/1‑101 (MQ=255) tAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGa < 2:524776/101‑1 (MQ=255) agagTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGAc > 2:525080/1‑101 (MQ=255) agagTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGAc < 1:524609/101‑1 (MQ=255) gagTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACg > 1:525083/1‑101 (MQ=255) gTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACggg > 2:525084/1‑101 (MQ=255) gTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACggg < 2:524806/101‑1 (MQ=255) tGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGt > 1:525086/1‑101 (MQ=255) ggCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGtt < 2:524676/101‑1 (MQ=255) ggCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGtt < 1:524730/101‑1 (MQ=255) gcTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑c < 2:524478/69‑1 (MQ=255) cTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcac > 2:525090/1‑101 (MQ=255) cTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcac < 2:524840/101‑1 (MQ=255) tGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcacc < 2:524826/101‑1 (MQ=255) tGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcacc > 1:525091/1‑101 (MQ=255) aTGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcaccca > 1:525094/1‑101 (MQ=255) gctgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcacccacc > 2:525097/1‑101 (MQ=255) gctgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcacccacc < 2:524757/101‑1 (MQ=255) tgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGc < 1:524281/101‑1 (MQ=255) gcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGcc > 1:525098/1‑101 (MQ=255) ccGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCt < 1:524620/101‑1 (MQ=255) gATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGa > 1:525103/1‑101 (MQ=255) gATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGa > 2:525101/1‑101 (MQ=255) aTGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGAt < 1:524669/101‑1 (MQ=255) gctgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTa < 1:524443/101‑1 (MQ=255) gctgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTa < 2:524633/101‑1 (MQ=255) ctgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTAt < 1:524638/101‑1 (MQ=255) ctgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTAt > 2:525106/1‑101 (MQ=255) tgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATc < 1:524588/101‑1 (MQ=255) tgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATc < 2:524741/101‑1 (MQ=255) tCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTa > 1:525109/1‑101 (MQ=255) ccATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTAt > 2:525111/1‑101 (MQ=255) cATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATc < 1:524553/101‑1 (MQ=255) cATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATc > 1:525113/1‑101 (MQ=255) aTGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATcc < 1:524379/101‑1 (MQ=255) aGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGc > 2:525115/1‑60 (MQ=255) aGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCata < 1:524681/101‑1 (MQ=255) gCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCatat < 1:524732/101‑1 (MQ=255) cTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATc > 1:525116/1‑101 (MQ=255) tCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGAtt < 2:524717/84‑1 (MQ=255) tCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCg < 1:524720/101‑1 (MQ=255) cACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGt < 2:524595/101‑1 (MQ=255) aCTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGtt > 1:525120/1‑101 (MQ=255) cTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTg < 1:524866/101‑1 (MQ=255) ggCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgcc > 1:525122/1‑101 (MQ=255) gCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccg > 1:525125/1‑101 (MQ=255) gCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccg < 2:524688/101‑1 (MQ=255) cAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccgcc > 1:525130/1‑101 (MQ=255) cAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGCTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccgcc > 1:525128/1‑101 (MQ=255) aGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGccc > 2:525131/1‑101 (MQ=255) gCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCa < 1:524541/101‑1 (MQ=255) 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1:525138/1‑101 (MQ=255) ttGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGc < 1:525004/101‑1 (MQ=255) gCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACggg < 1:524835/46‑1 (MQ=39) cAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTa > 1:525142/1‑101 (MQ=255) aGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTAc < 1:524773/101‑1 (MQ=255) ttAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCa > 2:525146/1‑101 (MQ=255) ttAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCa < 1:524789/101‑1 (MQ=255) ttAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCa < 2:524722/101‑1 (MQ=255) ttAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCa > 1:525144/1‑101 (MQ=255) tAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCaa > 1:525148/1‑101 (MQ=255) tAACGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCaa < 2:524784/101‑1 (MQ=255) aaCGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAAt > 2:525151/1‑101 (MQ=255) cGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGa > 1:525153/1‑101 (MQ=255) cGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGa > 1:525155/1‑101 (MQ=255) cGTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGa < 2:524699/101‑1 (MQ=255) gTTGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAg < 1:524881/101‑1 (MQ=255) ttGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGc > 1:525158/1‑101 (MQ=255) tGATCGCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGcc < 1:524702/101‑1 (MQ=255) | CCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCG > NC_000913/307947‑308142 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |