| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 461,311 | (T)7→8 | intergenic (+69/‑140) | lon → / → hupB | Lon protease/DNA‑binding protein HU‑beta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 461,304 | 1 | . | T | 99.6% | 1096.9 / ‑3.7 | 252 | intergenic (+62/‑147) | lon/hupB | Lon protease/DNA‑binding protein HU‑beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base T (129/122); total (129/123) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.88e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 294 total aligned reads displayed.
AATGAACCGTCTGGTATGCAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCC‑TTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAGGGGATGGCTGGCCTGATATAACTGCTGCGCGT > NC_000913/461204‑461398 | aTGAACCGTCTGGTATGCAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCC‑t < 2:787433/101‑1 (MQ=255) aTGAACCGTCTGGTATGCAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCC‑t > 2:787829/1‑101 (MQ=255) gAACCGTCTGGTATGCAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCC‑ttt > 1:787832/1‑101 (MQ=255) aCCGTCTGGTATGCAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCC‑ttttt < 2:787489/101‑1 (MQ=255) cGTCTGGTATGCAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCC‑ttttttt > 2:787835/1‑101 (MQ=255) gTCTGGTATGCAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCC‑tttttttt > 1:787837/1‑100 (MQ=255) tCTGGTATGCAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCC‑ttttttttg < 2:787396/101‑3 (MQ=255) tCTGGTATGCAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCC‑ttttttttg > 1:787840/1‑99 (MQ=255) cTGGTATGCAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCC‑ttttttttgt < 2:787333/101‑4 (MQ=255) cTGGTATGCAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCC‑ttttttttgt > 2:787845/1‑98 (MQ=255) cTGGTATGCAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCC‑ttttttttgt > 2:787842/1‑98 (MQ=255) ggTATGCAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCC‑ttttttttgtct < 2:787324/101‑6 (MQ=255) ggTATGCAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCC‑ttttttttgtct > 1:787848/1‑96 (MQ=255) ggTATGCAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCC‑ttttttttgtct < 1:787393/101‑6 (MQ=255) aTGCAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGtctc > 2:787853/1‑99 (MQ=255) aTGCAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGc > 1:787851/1‑101 (MQ=255) tGCAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCt < 1:787677/101‑1 (MQ=255) gCAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTa < 2:787257/101‑1 (MQ=255) gCAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTa < 2:787304/101‑1 (MQ=255) cAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTaa > 2:787856/1‑101 (MQ=255) cAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTaa < 2:787270/101‑1 (MQ=255) aGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAg < 2:787610/101‑1 (MQ=255) gTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGtt > 1:787858/1‑101 (MQ=255) gtgACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGa > 1:787862/1‑101 (MQ=255) tgACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGAt > 2:787864/1‑101 (MQ=255) tgACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGAt < 2:787264/101‑1 (MQ=255) aCTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATgg > 2:787867/1‑101 (MQ=255) tGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCg > 1:787871/1‑101 (MQ=255) tGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCg < 2:787445/101‑1 (MQ=255) gCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCgg < 2:787348/101‑1 (MQ=255) gCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCgg > 2:787873/1‑101 (MQ=255) aaaaTAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGAt > 1:787876/1‑101 (MQ=255) aaaTAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATc < 2:787474/101‑1 (MQ=255) aaTAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCg < 1:787028/101‑1 (MQ=255) aaTAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCg < 1:787467/101‑1 (MQ=255) aaTAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCg < 1:787359/101‑1 (MQ=255) aTAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCgg < 1:787381/101‑1 (MQ=255) aTAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCgg < 1:787077/101‑1 (MQ=255) aGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGc > 1:787883/1‑101 (MQ=255) aGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGc > 2:787881/1‑101 (MQ=255) aGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGc > 2:787884/1‑101 (MQ=255) gTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCt > 2:787887/1‑101 (MQ=255) gACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGc > 1:787895/1‑89 (MQ=255) gACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTg > 1:787893/1‑101 (MQ=255) gACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTg > 2:787892/1‑101 (MQ=255) ccTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCgg < 2:787154/89‑1 (MQ=255) cTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGccc > 1:787899/1‑101 (MQ=255) tCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCt < 1:787403/101‑1 (MQ=255) cgcgCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCtt < 2:787048/101‑1 (MQ=255) cgcAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGa > 2:787901/1‑85 (MQ=255) cgcAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCttat < 1:787793/101‑1 (MQ=255) gcAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCttatt < 1:787365/101‑1 (MQ=255) gcAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCttatt < 1:787565/101‑1 (MQ=255) aaaaTGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTaa > 2:787905/1‑101 (MQ=255) aaaTGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAg > 2:787909/1‑101 (MQ=255) aaaTGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAg > 1:787910/1‑101 (MQ=255) aaTGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCC‑ttttttttg > 2:787914/1‑56 (MQ=255) aTGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAggg < 1:787282/101‑1 (MQ=255) tGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAgggg > 1:787917/1‑101 (MQ=255) gCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGgt < 2:787224/101‑1 (MQ=255) cACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAgggg > 2:787921/1‑99 (MQ=255) aCTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCg > 2:787925/1‑78 (MQ=255) aCTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGgtgt > 1:787923/1‑101 (MQ=255) taataaAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGtgttg > 1:787929/1‑101 (MQ=255) aataaAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAgggg > 2:787933/1‑95 (MQ=255) aataaAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGtgttgt < 1:787223/101‑1 (MQ=255) aaaaaCAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAg < 2:787462/101‑1 (MQ=255) aaaaCAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAgg > 2:787936/1‑101 (MQ=255) aaaCAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAggg > 1:787939/1‑101 (MQ=255) aaCAGGGTTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAgggg < 2:787290/101‑1 (MQ=255) aCAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAggg > 1:787944/1‑99 (MQ=255) aCAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAGGGGa > 2:787941/1‑101 (MQ=255) cAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAGGGGAt < 2:787526/101‑1 (MQ=255) aGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAGGGGAtg < 1:787446/101‑1 (MQ=255) gggCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGgtg > 2:787948/1‑87 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1:787961/1‑101 (MQ=255) aGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAGGGGATGGCTGGCCTg < 1:787413/101‑1 (MQ=255) aGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAGGGGATGGCTGGCCTg > 2:787957/1‑101 (MQ=255) aGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAGGGGATGGCTGGCCTg > 1:787958/1‑101 (MQ=255) gCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAGGGGATGGCTGGCCTGat < 2:787405/101‑1 (MQ=255) gCTAATTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAGGGGATGGCTGGCCTGat > 1:787964/1‑101 (MQ=255) aTTCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAGGGGATGGCTGGCCTGATATaa > 1:787968/1‑101 (MQ=255) ttCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCtt < 2:787364/55‑1 (MQ=255) tCGGGCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAGGGGATGGCTGGCCTGATATAAct < 1:787205/101‑1 (MQ=255) gggCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAGGGGATGGCTGGCCTGATATAActgc < 2:787420/101‑1 (MQ=255) gggCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAGGGGATGGCTGGCCTGATATAActgc > 2:787970/1‑101 (MQ=255) ggCTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAGGGGATGGCTGGCCTGATATAActgct < 1:787186/101‑1 (MQ=255) cTTGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAGGGGATGGCTGGCCTGATATAACtgctgc > 1:787975/1‑101 (MQ=255) tGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAGGGGATGGCTGGCCTGATATAACTGCTgcgc < 1:787330/101‑1 (MQ=255) tGCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAGGGGATGGCTGGCCTGATATAACTGCTgcgc < 2:787571/101‑1 (MQ=255) gCCAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAGGGGATGGCTGGCCTGATATAACTGCTGcgcg < 2:787162/101‑1 (MQ=255) ccAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAGGGGAtg > 1:787978/1‑75 (MQ=255) ccAGCCTTTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAGGGGATGGCTGGCCTGATATAACTGCTGCGCGt < 2:787659/101‑1 (MQ=255) | AATGAACCGTCTGGTATGCAGGTTGTGACTGCAAAATAGTGACCTCGCGCAAAATGCACTAATAAAAACAGGGCTGGCAGGCTAATTCGGGCTTGCCAGCC‑TTTTTTTGTCTCGCTAAGTTAGATGGCGGATCGGGCTTGCCCTTATTAAGGGGTGTTGTAAGGGGATGGCTGGCCTGATATAACTGCTGCGCGT > NC_000913/461204‑461398 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |