| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 28,122 | A→G | K277R (AAG→AGG) | rihC → | ribonucleoside hydrolase RihC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 28,122 | 0 | A | G | 99.6% | 1082.5 / NA | 263 | K277R (AAG→AGG) | rihC | ribonucleoside hydrolase RihC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (136/125); total (137/126) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
GGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGT > NC_000913/28024‑28219 | ggACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAggc > 1:49699/1‑101 (MQ=255)ggACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAggc > 2:49701/1‑101 (MQ=255) gACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAggcc > 1:49702/1‑101 (MQ=255) aCCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAggcca < 2:48862/101‑1 (MQ=255) ccTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAggccag < 1:49357/101‑1 (MQ=255) cTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAggccagc < 1:49314/101‑1 (MQ=255) cTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAggccagc < 2:49116/101‑1 (MQ=255) cTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAggccagc < 2:49239/101‑1 (MQ=255) gTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGgccagcca < 1:49183/101‑1 (MQ=255) ttCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCaa > 1:49709/1‑101 (MQ=255) cACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATg > 2:49710/1‑101 (MQ=255) ctctCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTCCCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTa < 2:49456/101‑1 (MQ=255) ctctCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTa > 1:49714/1‑101 (MQ=255) ctcAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACa < 1:49271/101‑1 (MQ=255) ctcAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACa > 2:49716/1‑101 (MQ=255) aaaCCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGt < 2:49341/101‑1 (MQ=255) aaaCCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGt > 1:49720/1‑101 (MQ=255) aaCCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTg > 2:49724/1‑101 (MQ=255) aaCCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTg > 1:49725/1‑101 (MQ=255) aCCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTgg < 1:49217/101‑1 (MQ=255) cccTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGc > 1:49728/1‑101 (MQ=255) ccTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCa < 2:49046/101‑1 (MQ=255) tGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCAtt > 2:49732/1‑101 (MQ=255) ttttGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTgg < 2:49234/101‑1 (MQ=255) ttttGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTgg > 1:49736/1‑101 (MQ=255) tttGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGa > 2:49737/1‑101 (MQ=255) ttGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGAt < 1:49332/101‑1 (MQ=255) ttGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGAt > 2:49741/1‑101 (MQ=255) tgtgGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCCCGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTgg > 2:49744/1‑98 (MQ=255) tgtgGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATc < 1:48998/101‑1 (MQ=255) tgtgGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATc < 2:49360/101‑1 (MQ=255) gtgGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCt < 1:49237/101‑1 (MQ=255) gtgGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCt < 1:49247/101‑1 (MQ=255) ggCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTgg < 2:49203/101‑1 (MQ=255) ggCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTgg > 2:49747/1‑101 (MQ=255) gCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGa < 2:49305/101‑1 (MQ=255) cAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGAt > 2:49750/1‑101 (MQ=255) cAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGAt < 2:49283/101‑1 (MQ=255) aGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGAtg < 1:49223/101‑1 (MQ=255) ggAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGa > 1:49753/1‑101 (MQ=255) gAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGaa > 2:49754/1‑101 (MQ=255) aaaCTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGaaa < 2:49487/101‑1 (MQ=255) aaCTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGATGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAg < 1:49337/101‑1 (MQ=255) aCTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAgg > 1:49759/1‑101 (MQ=255) aCTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAgg > 1:49757/1‑101 (MQ=255) aCTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAgg < 1:49370/101‑1 (MQ=255) cAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCtt > 2:49762/1‑101 (MQ=255) gAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCcagca > 1:49767/1‑101 (MQ=255) gAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCcagca > 2:49769/1‑101 (MQ=255) gAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCcagca > 1:49772/1‑101 (MQ=255) aaTTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCcagcag > 2:49774/1‑101 (MQ=255) tACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAgtggg < 2:49325/101‑1 (MQ=255) tACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAgtggg > 2:49780/1‑101 (MQ=255) tACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAgtggg < 1:49113/101‑1 (MQ=255) tACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAgtggg > 1:49779/1‑101 (MQ=255) aCCTCAGGCACGACGGGGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTg > 2:49782/1‑63 (MQ=255) ccTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCt > 1:49784/1‑73 (MQ=255) cTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAgtgggtgg > 1:49787/1‑101 (MQ=255) cTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAgtgggtgg < 1:49494/101‑1 (MQ=255) cAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCt < 2:49255/101‑1 (MQ=255) ggCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGa < 1:49403/101‑1 (MQ=255) ggCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGa > 1:49791/1‑101 (MQ=255) cACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAgg > 2:49794/1‑101 (MQ=255) cACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAgg > 2:49797/1‑101 (MQ=255) cgacgGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAgg > 2:49804/1‑99 (MQ=255) cgacgGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTg < 2:49172/101‑1 (MQ=255) cgacgGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTg > 1:49800/1‑101 (MQ=255) gacgGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGc < 1:49147/101‑1 (MQ=255) gacgGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGc > 1:49805/1‑101 (MQ=255) cgGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAgg < 1:49429/96‑1 (MQ=255) cgGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTg < 2:49434/101‑1 (MQ=255) cgGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTg > 2:49808/1‑101 (MQ=255) ggtggtTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTgg < 2:49222/101‑1 (MQ=255) gtggtTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGc > 2:49811/1‑101 (MQ=255) tggtTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGct > 1:49814/1‑101 (MQ=255) ggtTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGctc > 2:49816/1‑101 (MQ=255) gtTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCt < 1:49267/95‑1 (MQ=255) gtTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGctct < 1:49442/101‑1 (MQ=255) tGATATCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTgg > 2:49819/1‑101 (MQ=255) tatCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGcgt > 1:49823/1‑101 (MQ=255) tatCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGcgt < 2:49319/101‑1 (MQ=255) atCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGcgtc < 2:49614/101‑1 (MQ=255) atCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGcgtc < 2:49294/101‑1 (MQ=255) atCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGcgtc > 2:49827/1‑101 (MQ=255) atCGACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGcgtc > 1:49826/1‑101 (MQ=255) gACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTa < 1:49364/101‑1 (MQ=255) gACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTa > 2:49830/1‑101 (MQ=255) gACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTa < 1:49425/101‑1 (MQ=255) gACGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTa > 2:49833/1‑101 (MQ=255) cGGTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAAc < 2:49297/101‑1 (MQ=255) ggTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAAcc > 2:49837/1‑101 (MQ=255) gTTGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCt < 2:49500/101‑1 (MQ=255) ttGCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTg > 1:49838/1‑101 (MQ=255) gCCTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTc > 2:49841/1‑101 (MQ=255) ccTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAgtgggtgg < 2:49313/68‑1 (MQ=255) ccTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTca < 2:49420/101‑1 (MQ=255) ccTGGGCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTca < 2:49540/101‑1 (MQ=255) gggCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGcgtc < 2:49156/87‑1 (MQ=255) gggCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACAt > 1:49844/1‑101 (MQ=255) ggCAGGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAATGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGcgt < 2:49451/85‑1 (MQ=255) | GGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGT > NC_000913/28024‑28219 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |