| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,383,303 | T→C | intergenic (+36/+27) | degS → / ← mdh | serine endoprotease/malate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,383,303 | 0 | T | C | 99.7% | 1335.7 / ‑4.5 | 320 | intergenic (+36/+27) | degS/mdh | serine endoprotease/malate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (136/183); total (136/184) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.16e-01 | |||||||||||
Only 100 of 325 total aligned reads displayed.
ATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGT > NC_000913/3383205‑3383400 | aTGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGcccc > 1:5719965/1‑101 (MQ=255)aTGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGcccc < 2:5719377/101‑1 (MQ=255)aTGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGCCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGcccc < 2:5719637/101‑1 (MQ=255) gCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCgg < 2:5719809/101‑1 (MQ=255) gCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCgg < 1:5719518/101‑1 (MQ=255) cGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGt > 2:5719968/1‑101 (MQ=255) gTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGtt > 1:5719970/1‑101 (MQ=255) gTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGtt < 2:5719527/101‑1 (MQ=255) gatgatAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGtttt > 1:5719976/1‑101 (MQ=255) atgatAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGttttt < 2:5719562/101‑1 (MQ=255) atgatAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGttttt > 2:5719977/1‑101 (MQ=255) atAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTttat < 2:5719457/101‑1 (MQ=255) atAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTttat < 2:5719781/101‑1 (MQ=255) tAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTttatt < 1:5719677/101‑1 (MQ=255) aGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTtattat > 2:5719982/1‑101 (MQ=255) gCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATc < 1:5719648/101‑1 (MQ=255) cAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATcc < 2:5719627/101‑1 (MQ=255) cAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATcc > 2:5719986/1‑101 (MQ=255) aGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCg > 1:5719987/1‑101 (MQ=255) aGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCg < 2:5719651/101‑1 (MQ=255) gTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGc < 1:5719359/101‑1 (MQ=255) ttAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCt < 1:5719636/101‑1 (MQ=255) ttAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCt < 1:5719623/101‑1 (MQ=255) tAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTa < 1:5719762/101‑1 (MQ=255) aaCGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTaa > 1:5719994/1‑101 (MQ=255) aCGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAAt > 1:5719998/1‑101 (MQ=255) gCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCa < 2:5719195/101‑1 (MQ=255) gCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCa > 2:5720001/1‑101 (MQ=255) gCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCa < 2:5719616/101‑1 (MQ=255) tGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAAt > 1:5720007/1‑101 (MQ=255) tGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAAt < 1:5719334/101‑1 (MQ=255) tGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAAt < 1:5719386/101‑1 (MQ=255) cAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTa < 1:5719560/101‑1 (MQ=255) aGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGTGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTAc < 1:5719445/101‑1 (MQ=255) ggTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACt < 2:5719436/101‑1 (MQ=255) ggTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACt < 1:5719568/101‑1 (MQ=255) gTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGTCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACtt > 2:5720009/1‑101 (MQ=255) gTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACtt < 1:5719662/101‑1 (MQ=255) aCCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACttatt > 1:5720012/1‑101 (MQ=255) ccATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACttatta < 2:5719555/101‑1 (MQ=255) aTTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACttatta < 1:5719706/99‑1 (MQ=255) aTTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAAc > 1:5720018/1‑101 (MQ=255) tCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGa > 1:5720021/1‑101 (MQ=255) tCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGa < 2:5719513/101‑1 (MQ=255) aGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGaa < 2:5719692/100‑1 (MQ=255) ggAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAAct < 2:5719772/101‑1 (MQ=255) ggAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAAct < 2:5719296/101‑1 (MQ=255) gAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAActc < 1:5719824/101‑1 (MQ=255) aaTATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAActct > 2:5720025/1‑101 (MQ=255) atatCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCtt < 1:5719174/101‑1 (MQ=255) tatCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTc > 1:5720027/1‑101 (MQ=255) atCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCg < 2:5719756/101‑1 (MQ=255) tCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGc > 1:5720032/1‑101 (MQ=255) tCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGc < 2:5719761/101‑1 (MQ=255) tCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGc < 2:5719319/101‑1 (MQ=255) ccGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGcc > 2:5720035/1‑101 (MQ=255) ccGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGcc > 1:5720037/1‑101 (MQ=255) ggCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCa < 2:5719827/101‑1 (MQ=255) gCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAg > 1:5720040/1‑101 (MQ=255) cAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAgg < 2:5719724/101‑1 (MQ=255) cAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAgg < 2:5719576/101‑1 (MQ=255) aCCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCtt > 2:5720046/1‑91 (MQ=255) aCCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGc < 2:5719586/101‑1 (MQ=255) cAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGa > 1:5720048/1‑101 (MQ=255) aaTTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGat > 2:5720052/1‑101 (MQ=255) aTTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGata > 1:5720053/1‑101 (MQ=255) aGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATAtctt > 1:5720057/1‑101 (MQ=255) aGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATAtctt < 1:5719508/101‑1 (MQ=255) gTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCg < 2:5719534/84‑1 (MQ=255) gTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATAtcttt > 2:5720059/1‑101 (MQ=255) tCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATAtctttc < 2:5719680/101‑1 (MQ=255) cGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATAtctttct < 1:5719702/101‑1 (MQ=255) cGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTCCGCCCAGGGCGATAtctttgt < 2:5719853/101‑3 (MQ=255) gTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATAtctttctt > 1:5720064/1‑101 (MQ=255) tGCTCTCAAAACAAAAAACCGTAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTttcttc > 2:5720066/1‑101 (MQ=255) gcgcTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCa > 1:5720069/1‑101 (MQ=255) gcTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGc > 1:5720073/1‑101 (MQ=255) tCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGt > 1:5720077/1‑101 (MQ=255) caaaacaaaaAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTa < 2:5719658/101‑1 (MQ=255) caaaacaaaaAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTa < 1:5719722/101‑1 (MQ=255) aaacaaaaAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATc < 2:5719494/101‑1 (MQ=255) aaacaaaaAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATc < 1:5719472/101‑1 (MQ=255) aacaaaaAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATcc > 1:5720081/1‑101 (MQ=255) caaaaAACCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAg < 2:5719951/101‑1 (MQ=255) aaaaaaCCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGc > 2:5720084/1‑101 (MQ=255) aaaaaCCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCa > 1:5720086/1‑101 (MQ=255) aaaaCCAGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCAt < 1:5719596/101‑1 (MQ=255) aaaCCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATa > 2:5720090/1‑101 (MQ=255) aaaCCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATa > 1:5720092/1‑101 (MQ=255) aaCCGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATAc < 1:5719771/101‑1 (MQ=255) ccGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCt < 2:5719715/101‑1 (MQ=255) ccGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCt < 1:5719733/101‑1 (MQ=255) cGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCtt < 1:5719867/101‑1 (MQ=255) cGGAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCtt < 1:5719691/101‑1 (MQ=255) ggAGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTc < 1:5719403/101‑1 (MQ=255) aGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCa > 2:5720097/1‑101 (MQ=255) aGTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCa > 1:5720099/1‑101 (MQ=255) gTCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAg < 2:5719645/101‑1 (MQ=255) tCTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAgc > 1:5720102/1‑101 (MQ=255) cTGTGCCCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAgcg > 2:5720104/1‑101 (MQ=255) | ATGCGTGATGATAAGCAGTTAACGCTGCAGGTCACCATTCAGGAATATCCGGCAACCAATTAAGTCGTGCGCTCAAAACAAAAAACCGGAGTCTGTGCTCCGGTTTTTTATTATCCGCTAATCAATTACTTATTAACGAACTCTTCGCCCAGGGCGATATCTTTCTTCAGCGTATCCAGCATACCTTCCAGCGCGT > NC_000913/3383205‑3383400 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |