New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 24 (0.060) | 19/194 | 22.5 | 4.2% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | = 3623367 | 552 (1.460) | coding (4176/4236 nt) | rhsB | rhs element protein RhsB | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 554 total aligned reads displayed.
AGGTAAAGATGAGAAAATAGTTAAAAGTAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTT > NC_000913/3623268‑3623467 | aGGTAAAGATGAGAAAATAGTTAAAAGTAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGgga > 1:6807762/1‑101 (MQ=255) aaaGATGAGAAAATAGTTAAAAGTAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGggaagga < 1:6806767/101‑1 (MQ=255) aaaGATGAGAAAATAGTTAAAAGTAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGggaagga > 2:6807773/1‑101 (MQ=255) aaaGATGAGAAAATAGTTAAAAGTAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGggaagga > 1:6807770/1‑101 (MQ=255) aaGATGAGAAAATAGTTAAAAGTAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGggaaggaa < 2:6807161/101‑1 (MQ=255) aTGAGAAAATAGTTAAAAGTAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATa > 1:6807781/1‑101 (MQ=255) tGAGAAAATAGTTAAAAGTAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATaa < 2:6807226/101‑1 (MQ=255) gagaAAATAGTTAAAAGTAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATaac < 2:6806712/101‑1 (MQ=255) gagaAAATAGTTAAAAGTAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATaac > 2:6807784/1‑101 (MQ=255) gaAAATAGTTAAAAGTAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATaacaa > 1:6807795/1‑101 (MQ=255) aaaaTAGTTAAAAGTAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATaacaaa > 2:6807798/1‑101 (MQ=255) aaaTAGTTAAAAGTAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATaacaaac < 1:6806545/101‑1 (MQ=255) aaTAGTTAAAAGTAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATaacaaaca > 2:6807806/1‑101 (MQ=255) tAGTTAAAAGTAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGa < 1:6807006/101‑1 (MQ=255) tAGTTAAAAGTAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGa > 1:6807811/1‑101 (MQ=255) aGTTAAAAGTAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGaa > 2:6807815/1‑101 (MQ=255) ttAAAAGTAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGaaaa > 1:6807819/1‑101 (MQ=255) aaGTAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGAt < 2:6806477/101‑1 (MQ=255) aaGTAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGAt > 1:6807827/1‑101 (MQ=255) aGTAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGAtt > 2:6807829/1‑101 (MQ=255) tAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTAc < 1:6807240/101‑1 (MQ=255) tAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTAc < 1:6806935/101‑1 (MQ=255) aaaGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTAcc > 1:6807836/1‑101 (MQ=255) aaGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCt > 1:6807843/1‑101 (MQ=255) aaGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCt > 2:6807846/1‑101 (MQ=255) aTAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAAt > 1:6807855/1‑101 (MQ=255) aTAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAAt > 2:6807859/1‑101 (MQ=255) tAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATg > 1:6807863/1‑101 (MQ=255) aaCAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGt < 1:6806664/101‑1 (MQ=255) aCAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTc > 2:6807867/1‑101 (MQ=255) cAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCt < 1:6806964/101‑1 (MQ=255) atatCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGc > 1:6807878/1‑101 (MQ=255) atatCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGc < 1:6807082/101‑1 (MQ=255) atatCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGc > 2:6807880/1‑101 (MQ=255) atCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCag > 1:6807886/1‑101 (MQ=255) tCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCaga < 2:6806996/101‑1 (MQ=255) aaGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGt < 2:6806608/101‑1 (MQ=255) aaGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGt > 2:6807893/1‑101 (MQ=255) gTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTc < 2:6807110/101‑1 (MQ=255) tCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCa < 1:6806710/101‑1 (MQ=255) cATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCAt < 2:6806845/101‑1 (MQ=255) cATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCAt > 1:6807899/1‑101 (MQ=255) aTTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATg > 1:6807904/1‑101 (MQ=255) tttatttaGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGt > 1:6807910/1‑101 (MQ=255) tttatttaGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGt < 1:6807348/101‑1 (MQ=255) ttatttaGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTa > 2:6807914/1‑101 (MQ=255) tatttaGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTaa < 1:6807147/101‑1 (MQ=255) tatttaGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTaa < 2:6806918/101‑1 (MQ=255) atttaGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAat > 1:6807922/1‑101 (MQ=255) tttaGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAata < 1:6807481/101‑1 (MQ=255) tttaGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAata > 2:6807925/1‑101 (MQ=255) ggTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGTAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTa < 1:6806860/101‑1 (MQ=255) ggTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTa > 1:6807931/1‑101 (MQ=255) cGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTaaaaa > 2:6807939/1‑101 (MQ=255) gCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTaaaaaa < 2:6807347/101‑1 (MQ=255) gCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTaaaaaa > 1:6807941/1‑101 (MQ=255) gCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTaaaaaa < 1:6807312/101‑1 (MQ=255) gCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTaaaaaa > 2:6807946/1‑101 (MQ=255) cccAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTaaaaaaa < 1:6807183/101‑1 (MQ=255) ccAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAat < 2:6807465/101‑1 (MQ=255) cAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAata > 1:6807954/1‑101 (MQ=255) aGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTaaaaaaa < 2:6806760/98‑1 (MQ=255) gTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATAtt > 2:6807957/1‑101 (MQ=255) gTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATAtt < 1:6807291/101‑1 (MQ=255) gTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATAtt < 2:6807280/101‑1 (MQ=255) tGGTAAATTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTa < 1:6806889/90‑1 (MQ=255) ggTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGt < 2:6807047/101‑1 (MQ=255) gTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGtt < 1:6807038/101‑1 (MQ=255) gTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGtt < 2:6807309/101‑1 (MQ=255) gTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGtt < 2:6806956/101‑1 (MQ=255) gTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGtt < 2:6806804/101‑1 (MQ=255) tAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGttt > 1:6807965/1‑101 (MQ=255) tAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGttt < 1:6806799/101‑1 (MQ=255) aTTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGttt < 1:6807125/99‑1 (MQ=255) ttttAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAgg > 2:6807972/1‑101 (MQ=255) tttAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGa < 2:6807087/101‑1 (MQ=255) ttAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGaa < 1:6806986/101‑1 (MQ=255) ttAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGaa < 1:6807065/101‑1 (MQ=255) tAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGttt < 1:6807108/95‑1 (MQ=255) tAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAAc > 1:6807973/1‑101 (MQ=255) aaaGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACt < 2:6807712/101‑1 (MQ=255) aGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACtgt < 1:6806948/101‑1 (MQ=255) cAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAat < 2:6807014/83‑1 (MQ=255) aaTAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTc < 2:6807385/101‑1 (MQ=255) aaTAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTc < 2:6807576/101‑1 (MQ=255) tAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCAt > 1:6807983/1‑101 (MQ=255) aGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCAtt < 1:6807215/101‑1 (MQ=255) gATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTg < 2:6807523/101‑1 (MQ=255) aTAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGt > 1:6807989/1‑101 (MQ=255) aTAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGt < 2:6806887/101‑1 (MQ=255) aTAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGt > 2:6807990/1‑101 (MQ=255) tAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTa < 1:6807430/101‑1 (MQ=255) aCCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATc < 2:6807134/101‑1 (MQ=255) aCCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATc < 1:6807163/101‑1 (MQ=255) cACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCtt > 1:6808005/1‑101 (MQ=255) aCGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCttt < 1:42604/101‑1 (MQ=255) aCGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCttt < 1:6807642/101‑1 (MQ=255) aCGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCttt < 2:6807260/101‑1 (MQ=255) ggaaggaaATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCtttgtt < 1:6807200/101‑1 (MQ=255) gaaggaaATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCtttgttt > 1:6808012/1‑101 (MQ=255) | AGGTAAAGATGAGAAAATAGTTAAAAGTAAAGATAACAATATCAAGTCATTTTATTTAGGTACGCCCAGTGGTAATTTTAAAGCAATAGATAACCACGGGAAGGAAATAACAAACAGAAAAGGATTACCTAATGTCTGCAGAGTTCATGGTAATATGTAAAAAAATATTGTTTAGGAACTGTGTCATTGTATCTTTGTTT > NC_000913/3623268‑3623467 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |