| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,941,260 | 0 | C | T | 56.6% | 183.2 / inf | 320 | A126T (GCC→ACC) | mepM | peptidoglycan DD‑endopeptidase MepM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (72/67); new base T (79/102); total (151/169) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.17e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
CGACGAGACACTTCCCAGGTGAGGCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGAAACAACATATTCATGCACGCCCGCT > NC_000913/1941160‑1941360 | cgacgaGACACTTCCCAGGTGAGGCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGc < 2:3548561/101‑1 (MQ=255) gacgaGACACTTCCCAGGTGAGGCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGcc < 1:3548702/101‑1 (MQ=255) acgaGACACTTCCCAGGTGAGGCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTgtcggtcg > 2:3549174/1‑101 (MQ=255) cacTTCCCAGGTGAGGCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCa < 1:3548840/101‑1 (MQ=255) cacTTCCCAGGTGAGGCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCa < 1:3548529/101‑1 (MQ=255) cacTTCCCAGGTGAGGCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCa < 2:3549021/101‑1 (MQ=255) acTTCCCAGGTGAGGCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAg > 2:3549181/1‑101 (MQ=255) acTTCCCAGGTGAGGCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAg < 1:3548581/101‑1 (MQ=255) cTTCCCAGGTGAGGCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGt > 1:3549185/1‑101 (MQ=255) ttCCCAGGTGAGGCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGtt > 2:3549188/1‑101 (MQ=255) cccAGGTGAGGCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTgg < 2:3548697/101‑1 (MQ=255) cccAGGTGAGGCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTgg > 1:3549191/1‑101 (MQ=255) ccAGGTGAGGCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGtt > 2:3549194/1‑98 (MQ=255) cAGGTGAGGCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGt < 1:3548466/101‑1 (MQ=255) ggTGAGGCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGa < 1:3548634/101‑1 (MQ=255) ggTGAGGCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGa < 1:3548848/101‑1 (MQ=255) ggTGAGGCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGa > 1:3549196/1‑101 (MQ=255) gAGGCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGatat < 1:3548673/101‑1 (MQ=255) gAGGCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGatat < 1:3548662/101‑1 (MQ=255) aGGCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATc < 1:3548602/101‑1 (MQ=255) ggCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGt < 2:3548617/89‑1 (MQ=255) gcgcTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCAc < 1:3548752/101‑1 (MQ=255) cgcTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTggg < 2:3548522/91‑1 (MQ=255) cgcTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGTTATCAcc > 2:3549201/1‑101 (MQ=255) gcTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCAccc > 1:3549202/1‑101 (MQ=255) tGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCat > 2:3549206/1‑101 (MQ=255) gCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCata < 1:3548543/101‑1 (MQ=255) cAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTg < 2:3548392/88‑1 (MQ=255) aGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATc > 2:3549209/1‑101 (MQ=255) ttCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCaa < 2:3548756/101‑1 (MQ=255) tCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAAt < 2:3548825/101‑1 (MQ=255) gCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCa < 2:3548728/92‑1 (MQ=255) gCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATAc > 2:3549216/1‑101 (MQ=255) gCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATAc > 1:3549217/1‑101 (MQ=255) ccGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATAcc < 1:3548678/101‑1 (MQ=255) gTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGc > 2:3549223/1‑63 (MQ=255) gTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCAt > 1:3549221/1‑101 (MQ=255) gTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCAt < 2:3548920/101‑1 (MQ=255) tCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATa < 1:3549058/101‑1 (MQ=255) cgcgGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACt > 1:3549228/1‑101 (MQ=255) gcgGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTg < 1:3548559/101‑1 (MQ=255) gcgGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTg > 2:3549230/1‑101 (MQ=255) ggTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGAt > 2:3549234/1‑101 (MQ=255) ggTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGAt < 2:3548838/101‑1 (MQ=255) gTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGAtt > 1:3549237/1‑101 (MQ=255) gTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGAtt < 1:3548817/101‑1 (MQ=255) ttAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTg < 1:3548866/101‑1 (MQ=255) aaTGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTgag < 1:3548609/101‑1 (MQ=255) aTGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCa > 2:3549245/1‑56 (MQ=255) aTGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTgaga > 1:3549242/1‑101 (MQ=255) gTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAAt > 2:3549248/1‑101 (MQ=255) gTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAAt < 2:3548976/101‑1 (MQ=255) tCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAAtg < 1:3548898/101‑1 (MQ=255) tCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAAtg > 1:3549249/1‑101 (MQ=255) ccAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAAtgc > 2:3549253/1‑101 (MQ=255) cAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAAtgct < 1:3548502/101‑1 (MQ=255) cAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAAtgct < 2:3549088/101‑1 (MQ=255) aGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAAtgctg < 1:3548639/101‑1 (MQ=255) agagTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCtt > 2:3549258/1‑101 (MQ=255) agagTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCtt < 2:3548873/101‑1 (MQ=255) gttgttGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGc > 1:3549260/1‑101 (MQ=255) ttgttgACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCg < 1:3548648/101‑1 (MQ=255) ttgttgACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCg < 1:3548343/101‑1 (MQ=255) tgttgACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGt > 2:3549266/1‑101 (MQ=255) tgttgACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGt > 1:3549265/1‑101 (MQ=255) ttgACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTAt > 2:3549269/1‑101 (MQ=255) tgACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATc < 1:3548744/101‑1 (MQ=255) gACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCg > 2:3549273/1‑101 (MQ=255) aCCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGc < 1:3548783/101‑1 (MQ=255) aCCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGc < 1:3548629/101‑1 (MQ=255) ccGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGcc < 1:3548691/101‑1 (MQ=255) cGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCa < 2:3548716/101‑1 (MQ=255) gATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAg > 2:3549278/1‑101 (MQ=255) aTTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGt > 1:3549280/1‑101 (MQ=255) aTTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGt > 2:3549282/1‑101 (MQ=255) ttttCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTg < 1:3548714/101‑1 (MQ=255) tttCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTgg < 2:3548766/101‑1 (MQ=255) tttCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTgg > 1:3549287/1‑101 (MQ=255) ttCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGa < 2:3548661/101‑1 (MQ=255) ttCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGa > 2:3549289/1‑101 (MQ=255) tCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGaa < 2:3548600/101‑1 (MQ=255) cAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGaaa > 1:3549294/1‑101 (MQ=255) aGGTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGAaac > 2:3549296/1‑101 (MQ=255) gTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGAaacaa < 2:3548643/101‑1 (MQ=255) gTTACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGAaacaa > 2:3549301/1‑101 (MQ=255) ttACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGAaacaac > 2:3549304/1‑101 (MQ=255) tACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGAAacaaca > 1:3549306/1‑101 (MQ=255) tACGCAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGAAacaaca < 2:3548742/101‑1 (MQ=255) gCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGAAACAACatat < 1:3548721/101‑1 (MQ=255) cAATTCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGAAACAACATAtt < 2:3548789/101‑1 (MQ=255) cAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAg > 2:3549309/1‑75 (MQ=255) aaTTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGAAACAACATATTc < 1:3548913/101‑1 (MQ=255) aTTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGAAACAACATATTCa > 1:3549313/1‑101 (MQ=255) tCTTTGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGAAACAACATATTCATg > 2:3549315/1‑101 (MQ=255) tttGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGAAACAACATATTCATGCa < 2:3548940/101‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGAAACAACATATTCATGCAc > 1:3549320/1‑101 (MQ=255) gTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGAAACAACATATTCATGCACGc > 2:3549324/1‑101 (MQ=255) gTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGAAACAACATATTCATGCACGc < 2:3548909/101‑1 (MQ=255) cGGTCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGAAACAACATATTCATGCACGccc > 1:3549327/1‑101 (MQ=255) gCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGAAACAACATATTCATGCACGCCCGc < 2:3548723/101‑1 (MQ=255) | CGACGAGACACTTCCCAGGTGAGGCGCTGCAGTTCGCCGTCCGCGGTTAATGTCCAGGAGAGTTGTTGACCGATTTTCAGGTTACGCAATTCTTTGTCGGCCGCAGCCAGTTGGGTGATATCACCCATATCAATACCATACTGATTGAGAATGCTGCTTAGCGTATCGCCAGTGGAAACAACATATTCATGCACGCCCGCT > NC_000913/1941160‑1941360 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |