Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,534,885 | C→T | intergenic (+16/+80) | nhoA → / ← yddE | arylamine N‑acetyltransferase/PF02567 family protein YddE |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,534,885 | 0 | C | T | 99.6% | 1084.6 / ‑5.3 | 255 | intergenic (+16/+80) | nhoA/yddE | arylamine N‑acetyltransferase/PF02567 family protein YddE |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (123/131); minor base A (1/0); total (124/131) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
ATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCA > NC_000913/1534787‑1534982 | tgatgCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGa > 1:2867270/1‑101 (MQ=255) gCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATg > 2:2867276/1‑99 (MQ=255) gAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATgcggc < 2:2866795/101‑1 (MQ=255) gAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATgcggc < 1:2866966/101‑1 (MQ=255) aaaCATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATgcggcg > 1:2867279/1‑101 (MQ=255) aaCATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATgcgg > 2:2867280/1‑98 (MQ=255) cATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTaa < 1:2866453/101‑1 (MQ=255) cATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTaa < 2:2866672/101‑1 (MQ=255) cATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTaa < 1:2866877/101‑1 (MQ=255) aTGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTaaa > 2:2867282/1‑101 (MQ=255) tGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAAc < 1:2866793/101‑1 (MQ=255) tGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAAc < 1:2867042/101‑1 (MQ=255) tGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAAc < 1:2866994/101‑1 (MQ=255) cTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGcc > 1:2867289/1‑101 (MQ=255) cTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGcc < 1:2866882/101‑1 (MQ=255) tttACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTaaa > 1:2867292/1‑96 (MQ=255) ttACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCtt < 1:2866760/101‑1 (MQ=255) ttACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCtt < 1:2866737/101‑1 (MQ=255) tACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCt > 2:2867296/1‑99 (MQ=255) tACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTa < 1:2866556/101‑1 (MQ=255) aCCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTAt > 2:2867298/1‑101 (MQ=255) aCCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTAt < 1:2866551/101‑1 (MQ=255) ccGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATc < 2:2867155/101‑1 (MQ=255) ccGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATc > 1:2867299/1‑101 (MQ=255) ccGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATc < 1:2866816/101‑1 (MQ=255) cGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGGAAATAATTTATGTCAGGTTGCTgg > 2:2867304/1‑79 (MQ=255) cGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATcc < 2:2866825/101‑1 (MQ=255) gTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGa > 1:2867306/1‑79 (MQ=255) ggATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGc > 2:2867307/1‑101 (MQ=255) gAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATAc < 1:2866859/101‑1 (MQ=255) ttAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACAtt < 2:2866610/101‑1 (MQ=255) ttAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACAtt < 2:2866751/101‑1 (MQ=255) ttAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACAtt < 2:2866779/101‑1 (MQ=255) tAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTa < 1:2866947/101‑1 (MQ=255) tAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTa > 1:2867313/1‑101 (MQ=255) tAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTa > 2:2867312/1‑101 (MQ=255) cgcTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGcc < 2:2866938/101‑1 (MQ=255) cTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCg > 2:2867317/1‑101 (MQ=255) cTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCg < 2:2867201/101‑1 (MQ=255) tGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCgg > 1:2867319/1‑101 (MQ=255) tGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCgg < 2:2866940/101‑1 (MQ=255) ggTGATGGGGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGt > 1:2867321/1‑101 (MQ=255) gATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGt < 1:2866862/101‑1 (MQ=255) gATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGt < 1:2866834/101‑1 (MQ=255) aTGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTa < 1:2866822/101‑1 (MQ=255) cggcgTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGAcc > 2:2867325/1‑101 (MQ=255) ggcgTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCt < 1:2866688/101‑1 (MQ=255) gcgTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTg < 2:2866846/101‑1 (MQ=255) cgTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGa > 2:2867329/1‑101 (MQ=255) cgTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGa > 1:2867328/1‑101 (MQ=255) ttGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAg < 1:2867187/101‑1 (MQ=255) tGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAgg > 2:2867332/1‑101 (MQ=255) aTACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCg > 1:2867334/1‑101 (MQ=255) tACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGa < 1:2867021/101‑1 (MQ=255) aCGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGaa < 1:2866753/101‑1 (MQ=255) cGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAg < 1:2867007/86‑1 (MQ=255) gCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAgc < 1:2866837/101‑1 (MQ=255) gCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAgc < 2:2866811/101‑1 (MQ=255) gCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAgc > 1:2867339/1‑101 (MQ=255) cACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGAt > 1:2867341/1‑41 (MQ=255) aCCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAgcgc > 2:2867342/1‑101 (MQ=255) ccGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCAt < 1:2867036/101‑1 (MQ=255) ccGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCAt < 1:2866769/101‑1 (MQ=255) cGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGTCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATc < 2:2866969/101‑1 (MQ=255) cGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGGAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAgg > 2:2867345/1‑90 (MQ=255) ggAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGAt > 2:2867348/1‑36 (MQ=255) ggAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCa < 1:2867164/101‑1 (MQ=255) gAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAg < 1:2866989/101‑1 (MQ=255) aGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGa > 2:2867350/1‑101 (MQ=255) gCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACa > 1:2867353/1‑101 (MQ=255) cGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCa > 2:2867355/1‑96 (MQ=255) ggAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCtt < 2:2866715/45‑1 (MQ=255) ggAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTTTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACg > 1:2867357/1‑101 (MQ=255) ggAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACg < 1:2866935/101‑1 (MQ=255) gAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACgg > 2:2867361/1‑101 (MQ=255) gAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACgg < 1:2866718/101‑1 (MQ=255) gAAAATAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACgg > 1:2867362/1‑101 (MQ=255) aaaaTAATTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGt > 1:2867364/1‑101 (MQ=255) aataatTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGttt > 1:2867369/1‑101 (MQ=255) ataatTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTc < 1:2867080/101‑1 (MQ=255) taatTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACa > 1:2867372/1‑92 (MQ=255) aatTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCag < 2:2866902/101‑1 (MQ=255) aatTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCag > 2:2867373/1‑101 (MQ=255) atTTATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCaga < 2:2867043/101‑1 (MQ=255) ttATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGt > 1:2867375/1‑101 (MQ=255) tATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGtt < 2:2866988/101‑1 (MQ=255) tATGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGtt > 1:2867378/1‑101 (MQ=255) aTGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTc > 2:2867380/1‑101 (MQ=255) aTGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTc < 1:2866499/101‑1 (MQ=255) aTGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTc > 1:2867383/1‑101 (MQ=255) aTGTCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTc < 1:2866960/101‑1 (MQ=255) tCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAAt < 1:2866906/101‑1 (MQ=255) tCAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAAt > 2:2867386/1‑101 (MQ=255) cAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGt > 1:2867390/1‑95 (MQ=255) cAGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAAtt > 1:2867388/1‑101 (MQ=255) aGGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTg > 1:2867393/1‑101 (MQ=255) ggTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGc > 1:2867395/1‑101 (MQ=255) ttGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCg > 1:2867399/1‑64 (MQ=255) ttGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGccc < 2:2866921/101‑1 (MQ=255) tGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCa < 2:2867004/101‑1 (MQ=255) | ATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCCA > NC_000913/1534787‑1534982 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |