| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,240,984 | (G)7→6 | coding (1041/1245 nt) | sstT → | serine/threonine:Na(+) symporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,240,978 | 0 | G | . | 92.5% | 936.5 / 70.7 | 212 | coding (1035/1245 nt) | sstT | serine/threonine:Na(+) symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (16/0); new base . (36/160); total (52/160) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.33e-11 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.19e-01 | |||||||||||
Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
TGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGC > NC_000913/3240878‑3241074 | ggctgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCgg > 2:5891678/1‑101 (MQ=255) gctgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCggg < 1:5891587/101‑1 (MQ=255) gctgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCggg < 2:5891220/101‑1 (MQ=255) gctgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCggg > 1:5891679/1‑101 (MQ=255) gctgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCggg < 2:5891047/101‑1 (MQ=255) ctgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCgggg > 1:5891684/1‑101 (MQ=255) tgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCggggg < 1:5891530/101‑1 (MQ=255) tgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCggggg > 1:5891686/1‑101 (MQ=255) ggTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCggggggtc < 2:5891326/101‑3 (MQ=255) ggTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCggggggtc < 1:5891170/101‑3 (MQ=255) gTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCggggggtct < 1:5891393/101‑4 (MQ=255) gTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCggggggtct < 1:5891083/101‑4 (MQ=255) gTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCgggggggct > 2:5891691/1‑99 (MQ=255) ttAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCggggggtctc < 2:5891369/101‑5 (MQ=255) tAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTctct > 1:5891695/1‑101 (MQ=255) tACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCg > 2:5891701/1‑88 (MQ=255) tACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTctgct < 1:5891375/101‑1 (MQ=255) cGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTctgctgc < 2:5891342/101‑1 (MQ=255) gCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTctgctgct < 1:5891242/101‑1 (MQ=255) gCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTctgctg < 2:5891364/99‑1 (MQ=255) cTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTctgctgctg < 2:5891184/101‑1 (MQ=255) tGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGa < 1:5891196/101‑1 (MQ=255) gggTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGAt < 2:5891061/101‑1 (MQ=255) ggTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATc < 1:5890979/101‑1 (MQ=255) ggTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATc < 2:5891125/101‑1 (MQ=255) ggTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATc < 2:5890974/101‑1 (MQ=255) gTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATcc > 2:5891708/1‑101 (MQ=255) ttCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGG‑CTCTGCTGCTGATCCCAc > 1:5891711/1‑101 (MQ=255) ttCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCAc < 1:5891268/101‑1 (MQ=255) ggTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCgg > 1:5891716/1‑74 (MQ=255) ggTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGG‑CTCTGCTGCTGATccc > 2:5891714/1‑95 (MQ=255) ggTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc < 1:5891019/101‑1 (MQ=255) tCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCt < 1:5891440/101‑1 (MQ=255) tCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCt < 2:5891310/101‑1 (MQ=255) cGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGG‑CTCTGCTGCTGATCCCACTGGcc > 2:5891718/1‑99 (MQ=255) cGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTg < 2:5891320/101‑1 (MQ=255) cGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTg < 1:5891288/101‑1 (MQ=255) gATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGG‑CTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGt > 2:5891721/1‑101 (MQ=255) aTCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTg > 1:5891727/1‑94 (MQ=255) aTCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTa < 1:5891323/101‑1 (MQ=255) aTCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTa < 2:5891205/101‑1 (MQ=255) tCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTaa > 1:5891730/1‑101 (MQ=255) tGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAata < 1:5891345/101‑1 (MQ=255) gCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCggggg < 2:5891106/68‑1 (MQ=255) gCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAatat < 1:5891500/101‑1 (MQ=255) gCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAatat < 2:5891169/101‑1 (MQ=255) ccACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGt < 2:5891540/101‑1 (MQ=255) cACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTc < 1:5891298/101‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTc > 2:5891739/1‑101 (MQ=255) ggCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCgg > 1:5891742/1‑101 (MQ=255) ggCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCgg < 1:5891176/101‑1 (MQ=255) cgcTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCgggggggct > 2:5891745/1‑62 (MQ=255) cgcTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTa < 2:5891279/101‑1 (MQ=255) gctgctGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTgg < 2:5891252/82‑1 (MQ=255) ctgctgTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTAtt < 2:5891386/101‑1 (MQ=255) ctgctgTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTAtt < 1:5891221/101‑1 (MQ=255) ctgctgTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTAtt < 1:5891232/101‑1 (MQ=255) gctgTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTc > 1:5891748/1‑101 (MQ=255) ctgTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGG‑CTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGt > 1:5891751/1‑83 (MQ=255) ctgTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCg < 1:5891366/101‑1 (MQ=255) ctgTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCg < 1:5891384/101‑1 (MQ=255) tgTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGa < 1:5891450/101‑1 (MQ=255) gTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGaa < 1:5891135/101‑1 (MQ=255) tGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACg > 1:5891755/1‑101 (MQ=255) gAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCgggggggc > 2:5891758/1‑52 (MQ=255) aGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGat < 1:5891107/101‑1 (MQ=255) gtggtgGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATc < 1:5891311/101‑1 (MQ=255) ggtggCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGc < 1:5891258/101‑1 (MQ=255) ggtggCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGc < 1:5891359/101‑1 (MQ=255) gtggCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGcc < 1:5891278/101‑1 (MQ=255) tggCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCa > 2:5891762/1‑101 (MQ=255) gCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATg > 1:5891764/1‑101 (MQ=255) cTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGc < 2:5891351/96‑1 (MQ=255) ttCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCa > 1:5891767/1‑101 (MQ=255) ctctGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCggggg > 2:5891771/1‑36 (MQ=255) ctctGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAgg < 2:5891733/101‑1 (MQ=255) ctGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAggtg > 1:5891772/1‑101 (MQ=255) ctGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAggtg < 2:5891495/101‑1 (MQ=255) gCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGG‑CTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGcc > 1:5891775/1‑101 (MQ=255) ccTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCg < 2:5891116/101‑1 (MQ=255) cTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGt < 2:5891233/101‑1 (MQ=255) cTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGt < 1:5891560/101‑1 (MQ=255) tgtgGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTc < 2:5891391/101‑1 (MQ=255) gcgcATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCt > 2:5891779/1‑101 (MQ=255) cgcATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCtt < 1:5891398/101‑1 (MQ=255) cgcATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCtt < 1:5891155/101‑1 (MQ=255) gcATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCttt < 2:5891556/101‑1 (MQ=255) gcATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCttt < 1:5891306/101‑1 (MQ=255) cATCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTa < 2:5891446/101‑1 (MQ=255) aTCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTat > 1:5891782/1‑101 (MQ=255) aTCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTat < 1:5891487/101‑1 (MQ=255) aTCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTat > 1:5891784/1‑101 (MQ=255) aTCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTat < 1:5891337/101‑1 (MQ=255) tCCGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTc < 1:5891293/92‑1 (MQ=255) ccGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTatca < 2:5891430/101‑1 (MQ=255) ccGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTatca < 1:5891461/101‑1 (MQ=255) ccGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTatca < 1:5891415/101‑1 (MQ=255) ccGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTatca < 2:5891192/101‑1 (MQ=255) cGGCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTatcat < 2:5891331/101‑1 (MQ=255) ggCGTGGC‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTatcatc < 2:5891416/101‑1 (MQ=255) | TGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGC > NC_000913/3240878‑3241074 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |