| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,867,926 | (C)6→7 | coding (828/1140 nt) | nlpD ← | murein hydrolase activator NlpD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,867,920 | 1 | . | C | 99.3% | 1217.2 / ‑0.7 | 295 | coding (834/1140 nt) | nlpD | murein hydrolase activator NlpD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/0); new base C (136/157); total (138/157) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.18e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 351 total aligned reads displayed.
TACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑CCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTACTGCTGACAGT > NC_000913/2867820‑2868015 | aCCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑c < 2:5173875/101‑1 (MQ=255) ccGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑cc < 1:5173857/101‑1 (MQ=255) ccGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑cc > 1:5174280/1‑101 (MQ=255) cGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑ccc > 2:5174281/1‑101 (MQ=255) cGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑ccc < 2:5173672/101‑1 (MQ=255) gTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑cccc < 2:5173591/101‑1 (MQ=255) aGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑cccccc > 2:5174286/1‑101 (MQ=255) aGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑cccccc < 1:5173737/101‑1 (MQ=255) aGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑cccccc < 2:5173545/101‑1 (MQ=255) ccGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑ccccccct > 1:5174290/1‑99 (MQ=255) cgcgCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑ccccccctc < 2:5173743/101‑4 (MQ=255) gcgcAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑ccccccctca > 2:5174296/1‑97 (MQ=255) gcgcAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑ccccccctca < 1:5173835/101‑5 (MQ=255) cgcAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑ccccccctcag > 1:5174298/1‑96 (MQ=255) gcAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑ccccccctc > 2:5174302/1‑95 (MQ=255) aGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAg < 2:5173618/101‑1 (MQ=255) aGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAg < 2:5174222/101‑1 (MQ=255) cgcgTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAgcg > 1:5174308/1‑101 (MQ=255) gcgTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAgcgc > 2:5174310/1‑101 (MQ=255) gTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCa > 1:5174313/1‑101 (MQ=255) ttACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCaa < 1:5173965/101‑1 (MQ=255) ttACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCaa > 2:5174319/1‑101 (MQ=255) tACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCaaa < 1:5173632/101‑1 (MQ=255) tACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCaaa > 1:5174320/1‑101 (MQ=255) tACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCaaa < 1:5173949/101‑1 (MQ=255) ccAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAgg < 1:5173926/101‑1 (MQ=255) cAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGt < 2:5173848/101‑1 (MQ=255) aGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGtt < 2:5173963/101‑1 (MQ=255) aGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGtt > 2:5174325/1‑101 (MQ=255) aGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGtt > 1:5174326/1‑101 (MQ=255) gCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGttt < 2:5173984/101‑1 (MQ=255) cATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTc > 1:5174331/1‑101 (MQ=255) aaaCAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGAt < 2:5173883/101‑1 (MQ=255) aaaCAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGAt < 2:5173903/101‑1 (MQ=255) aaaCAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGAt > 2:5174335/1‑101 (MQ=255) aacaacGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATc > 2:5174339/1‑101 (MQ=255) caacGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCAc > 1:5174340/1‑101 (MQ=255) aacGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACt > 2:5174346/1‑101 (MQ=255) acGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACtt < 1:5173714/101‑1 (MQ=255) cgcgGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACttt < 1:5173840/101‑1 (MQ=255) cgcgGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACttt < 2:5173820/101‑1 (MQ=255) cgcgGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACttt > 1:5174350/1‑101 (MQ=255) gcgGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTg > 2:5174352/1‑101 (MQ=255) gcgGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTg < 2:5173787/101‑1 (MQ=255) cgGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGc < 1:5173801/101‑1 (MQ=255) ggCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGcc > 2:5174357/1‑101 (MQ=255) aTCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCa > 1:5174362/1‑101 (MQ=255) tCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAg < 1:5173727/101‑1 (MQ=255) tCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAg < 1:5174043/101‑1 (MQ=255) tGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTc < 2:5173755/101‑1 (MQ=255) cGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCgg > 2:5174365/1‑101 (MQ=255) cGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCgg < 1:5173468/101‑1 (MQ=255) gTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGcc > 1:5174368/1‑101 (MQ=255) tCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCa > 1:5174372/1‑101 (MQ=255) tCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCa < 2:5173703/101‑1 (MQ=255) gcgATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAgc < 1:5173770/101‑1 (MQ=255) cgATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAg > 1:5174377/1‑99 (MQ=255) gATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAgcgc > 1:5174381/1‑101 (MQ=255) aTAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGcc > 1:5174385/1‑101 (MQ=255) aTAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑cc > 2:5174386/1‑47 (MQ=255) tAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCa < 1:5173886/101‑1 (MQ=255) aaTTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAg < 1:5173988/101‑1 (MQ=255) ttGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGt > 2:5174390/1‑101 (MQ=255) ttGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGt > 1:5174392/1‑101 (MQ=255) gCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTgg < 2:5174030/101‑1 (MQ=255) cTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGgag < 1:5173920/101‑1 (MQ=255) cTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGgag > 2:5174398/1‑101 (MQ=255) tGTCCTTTGCTGTCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGgaga < 2:5173767/101‑1 (MQ=255) tGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGgaga < 1:5173943/101‑1 (MQ=255) ccTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAg > 1:5174401/1‑101 (MQ=255) ccTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAg < 2:5174086/101‑1 (MQ=255) ccTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAg < 1:5173894/101‑1 (MQ=255) tgctgcCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGt < 1:5173864/101‑1 (MQ=255) gctgcCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAg > 1:5174406/1‑96 (MQ=255) gctgcCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTa < 2:5173811/101‑1 (MQ=255) gctgcCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTa > 2:5174405/1‑101 (MQ=255) ctgcctgcGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTAc < 1:5174159/101‑1 (MQ=255) ctgcctgcGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTAc < 1:5174039/101‑1 (MQ=255) cctgcGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTgg < 1:5173678/101‑1 (MQ=255) ctgcGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGt > 1:5174413/1‑101 (MQ=255) tgcGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGt < 1:5173797/94‑1 (MQ=255) tgcGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGtt > 2:5174415/1‑101 (MQ=255) cGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGa < 2:5173978/101‑1 (MQ=255) gATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGAt > 1:5174421/1‑101 (MQ=255) gATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGAt > 2:5174420/1‑101 (MQ=255) atatCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATg < 2:5173941/101‑1 (MQ=255) atCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTa > 1:5174426/1‑101 (MQ=255) tCAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTAc > 2:5174431/1‑101 (MQ=255) cAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTAct < 2:5174071/101‑1 (MQ=255) cAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTAct < 2:5174131/101‑1 (MQ=255) cAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTAct > 1:5174433/1‑101 (MQ=255) cAATCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTAct < 2:5173720/101‑1 (MQ=255) tCCCCTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTActgct > 1:5174438/1‑101 (MQ=255) ccccTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTActgctg < 1:5173664/101‑1 (MQ=255) cccTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTActgc > 1:5174441/1‑98 (MQ=255) ccTTGTTGCCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTACTGCTGAc > 2:5174442/1‑101 (MQ=255) ttgttgcCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTACTGCTGACAg < 2:5173736/101‑1 (MQ=255) ttgttgcCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTACTGCTGACAg > 2:5174447/1‑101 (MQ=255) tgttgcCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTACTGCTGACAGt < 2:5173916/101‑1 (MQ=255) tgttgcCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTACTGCTGACAGt < 2:5173853/101‑1 (MQ=255) | TACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑CCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTACTGCTGACAGT > NC_000913/2867820‑2868015 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |