Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,366,764 | (C)5→6 | pseudogene (10/175 nt) | yhcE → | putative uncharacterized protein YhcE |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,366,759 | 1 | . | C | 99.7% | 1253.3 / ‑3.5 | 303 | pseudogene (5/175 nt) | yhcE | putative uncharacterized protein YhcE |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base C (158/144); total (159/144) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
Only 100 of 339 total aligned reads displayed.
GGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTT‑CCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCACACTGACAATGGCTCCAGCT > NC_000913/3366659‑3366854 | ggCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACtt > 1:6133745/1‑101 (MQ=32) ggCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACtt > 2:6133749/1‑101 (MQ=32) cGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTT‑cc > 1:6133753/1‑101 (MQ=35) gAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTT‑ccc < 2:6133296/101‑1 (MQ=35) aGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTT‑ccccc > 1:6133757/1‑101 (MQ=38) gTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTT‑cccccca < 1:6133082/101‑3 (MQ=38) tAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTT‑ccccccaa > 2:6133761/1‑98 (MQ=255) tAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTT‑ccccccaa < 2:6133548/101‑4 (MQ=255) aaGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTT‑ccccccaat < 2:6133348/101‑5 (MQ=255) aaGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTT‑ccccccaat > 1:6133765/1‑97 (MQ=255) aGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTT‑ccccccaata < 2:6133069/101‑6 (MQ=255) gTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCaataa < 1:6133405/101‑1 (MQ=255) tgatgaCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAAtt < 1:6132908/101‑1 (MQ=255) atgaCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTgg < 2:6133142/101‑1 (MQ=255) atgaCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTgg > 1:6133772/1‑101 (MQ=255) atgaCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTgg < 2:6133216/101‑1 (MQ=255) atgaCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTgg > 2:6133771/1‑101 (MQ=255) tgaCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGc > 1:6133777/1‑101 (MQ=255) aCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTg < 2:6133149/101‑1 (MQ=255) aCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTg < 2:6133186/101‑1 (MQ=255) aCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTg > 2:6133781/1‑101 (MQ=255) cTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTgg < 1:6133034/101‑1 (MQ=255) atgatgAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGgtgt > 1:6133784/1‑101 (MQ=255) atgaACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTa > 2:6133787/1‑101 (MQ=255) atgaACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTa < 2:6133092/101‑1 (MQ=255) tgaACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTAt < 1:6133312/101‑1 (MQ=255) aCCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCa > 2:6133791/1‑101 (MQ=255) cccTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCaa > 1:6133794/1‑101 (MQ=255) ccTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCaaa < 1:6133328/101‑1 (MQ=255) cTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCaaaa > 2:6133798/1‑101 (MQ=255) tGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAAt < 2:6133247/101‑1 (MQ=255) tGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAAt > 1:6133799/1‑101 (MQ=255) gTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCa < 2:6133285/96‑1 (MQ=255) ttCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATgg < 2:6133490/101‑1 (MQ=255) tCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGt > 1:6133804/1‑101 (MQ=255) cTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTg > 2:6133807/1‑82 (MQ=255) tATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCa < 1:6133138/101‑1 (MQ=255) tATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCa < 2:6133107/101‑1 (MQ=255) aTGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCaa < 2:6133128/101‑1 (MQ=255) tGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCaag < 2:6133230/101‑1 (MQ=255) gCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCaagaa > 1:6133812/1‑101 (MQ=255) cTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCaagaag > 2:6133813/1‑101 (MQ=255) tCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGt > 2:6133816/1‑101 (MQ=255) tCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGt < 1:6133159/101‑1 (MQ=255) ccAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTg < 2:6133359/101‑1 (MQ=255) ccAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTg < 2:6133238/101‑1 (MQ=255) cAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTgg < 2:6133634/101‑1 (MQ=255) gATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTa > 2:6133824/1‑101 (MQ=255) aTGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTaa > 1:6133826/1‑101 (MQ=255) tGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAAt < 2:6133204/101‑1 (MQ=255) gACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAAtt > 2:6133829/1‑101 (MQ=255) gACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAAtt < 2:6133178/101‑1 (MQ=255) cAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGa < 2:6133221/101‑1 (MQ=255) cAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGa > 1:6133835/1‑101 (MQ=255) aaaCATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGAt < 1:6133353/101‑1 (MQ=255) aaCATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATa > 2:6133837/1‑101 (MQ=255) aCATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAg > 1:6133840/1‑101 (MQ=255) cATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGc > 1:6133845/1‑101 (MQ=255) aTGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCg > 1:6133849/1‑101 (MQ=255) aTGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCg > 2:6133847/1‑101 (MQ=255) gATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGt < 1:6133299/101‑1 (MQ=255) tctcATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTaa < 1:6133606/101‑1 (MQ=255) tctcATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTaa > 2:6133854/1‑101 (MQ=255) ctcATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTaaa > 1:6133856/1‑101 (MQ=255) tcATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTaaaa > 1:6133860/1‑101 (MQ=255) tcATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTaaaa < 2:6133427/101‑1 (MQ=255) cATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAg > 2:6133863/1‑101 (MQ=255) cATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAg < 2:6133262/101‑1 (MQ=255) cATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAg < 2:6133317/101‑1 (MQ=255) atatCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGc < 1:6133485/101‑1 (MQ=255) tatCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCg < 1:6133372/101‑1 (MQ=255) atCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGt > 2:6133866/1‑101 (MQ=255) cAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTa < 1:6133222/101‑1 (MQ=255) cAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTa < 1:6133170/101‑1 (MQ=255) cAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTa > 2:6133870/1‑101 (MQ=255) cAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTa < 2:6133330/101‑1 (MQ=255) gggACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGc > 2:6133875/1‑101 (MQ=255) ggACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGcc > 1:6133876/1‑101 (MQ=255) cTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTca > 2:6133881/1‑101 (MQ=255) ttGTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTcac > 1:6133885/1‑101 (MQ=255) gTTCGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCacac > 2:6133888/1‑101 (MQ=255) ttggCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCACACt > 1:6133892/4‑101 (MQ=255) cGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCACACTGa > 1:6133896/1‑101 (MQ=255) cGCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCACACTGa > 2:6133894/1‑101 (MQ=255) gCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCACACTGAc < 2:6133460/101‑1 (MQ=255) gCACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCACACTGAc > 2:6133901/1‑101 (MQ=255) cACCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCACACTGACa < 1:6133471/101‑1 (MQ=255) aCCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCACACTGACaa > 2:6133906/1‑101 (MQ=255) aCCTTCCTTAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGGGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCt > 1:6133907/1‑90 (MQ=255) ccttccttAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTaaaa < 2:6133378/79‑1 (MQ=255) cttccttAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCACACTGACAATg < 1:6133270/101‑1 (MQ=255) tccttAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCACACTGACAATGGc < 1:6133207/101‑1 (MQ=255) ccttAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCACACTGACAATGGCt > 1:6133912/1‑101 (MQ=255) ccttAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCACACTGACAATGGCt > 2:6133913/1‑101 (MQ=255) ttAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCACACTGACAATGGCTcc < 1:6133444/101‑1 (MQ=255) ttAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCACACTGACAATGGCTcc > 2:6133919/1‑101 (MQ=255) tAGTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCACACTGACAATGGCTCCa > 2:6133923/1‑101 (MQ=255) gTACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCACACTGACAATGGCTCCAGc < 1:6133820/101‑1 (MQ=255) tACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCACACTGACAATGGCTCCAGCt > 1:6133930/1‑101 (MQ=255) tACTTCCCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCACACTGACAATGGCTCCAGCt > 1:6133926/1‑101 (MQ=255) | GGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTACTT‑CCCCCAATAATTGGCTGGTGTTTATGCAAAATGGTCAAGAAGTGGTAATTGATAGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCACACTGACAATGGCTCCAGCT > NC_000913/3366659‑3366854 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |