| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2515616 | NA (NA) | 220 (0.630) | 126/188 | 2.3 | 52.6% | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3067180 | 198 (0.570) | intergenic (‑7/+160) | ygfI/yggE | putative LysR‑type DNA‑binding transcriptional regulator YgfI/uncharacterized protein YggE | |||||
Only 100 of 622 total aligned reads displayed.
CCGTCATATGGATTTTTTCTGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATGGTTTTACAGAAAATTACAG > NC_000913/3067080‑3067280 | ccGTCATATGGATTTTTTCTGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCAtccccctc < 1:5556359/101‑1 (MQ=255)ccGTCATATGGATTTTTTCTGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCAtccccctc > 1:31957/1‑101 (MQ=255) agaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgAtccccctccc > 2:4531580‑M2/91‑101 (MQ=255) cATATGGATTTTTTCTGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCAtccccctccccc < 1:5556583/101‑1 (MQ=255) aattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgAtccccctccccc > 1:4531585‑M2/89‑101 (MQ=255) ttgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGc < 2:1142115‑M2/15‑1 (MQ=255) atGGATTTTTTCTGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataa > 2:5556329‑M2/1‑94 (MQ=255) gctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCAt < 1:1142116‑M2/17‑1 (MQ=255) gaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCt < 2:29735‑M2/20‑1 (MQ=255) aTTTTTTCTGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgc > 1:5556456‑M2/1‑90 (MQ=255) ttttttCTGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCtt < 2:5556264/101‑1 (MQ=255) ttttttCTGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCtt > 1:5556752/1‑101 (MQ=255) accagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCtt > 1:4531594‑M2/81‑101 (MQ=255) cagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGt > 2:4531596‑M2/79‑101 (MQ=255) cagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGt < 1:29738‑M2/23‑1 (MQ=255) atcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCt < 1:4531604‑M2/28‑1 (MQ=255) gccCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAAc > 2:5556759/1‑101 (MQ=255) gagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAAcc > 2:4531609‑M2/69‑101 (MQ=255) cccGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAAcc < 1:5556507/101‑1 (MQ=255) cGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGt > 1:5556761/1‑101 (MQ=255) gggCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaa < 2:31947‑M2/101‑28 (MQ=255) gggCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaa < 2:31570‑M2/101‑28 (MQ=255) agtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGtt < 1:29746‑M2/36‑1 (MQ=255) gCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTtc < 1:5556478/101‑1 (MQ=255) cAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaacca > 2:5556153‑M2/1‑71 (MQ=255) cAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTtca < 1:5556614/101‑1 (MQ=255) atatTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatc < 2:31605‑M2/101‑33 (MQ=255) atatTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatc > 2:5556466‑M2/1‑69 (MQ=255) ttattGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTtcagtcag < 1:5556101/101‑1 (MQ=255) tcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGc < 1:29754‑M2/45‑1 (MQ=255) tcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGc > 2:4531619‑M2/57‑101 (MQ=255) tattGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGc > 1:5556773/1‑101 (MQ=255) tattGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGc > 2:5556772/1‑101 (MQ=255) cggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGcc > 1:4531620‑M2/56‑101 (MQ=255) attGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaag < 1:31655‑M2/101‑38 (MQ=255) acgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATc < 2:29758‑M2/50‑1 (MQ=255) tttGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgc < 2:31733‑M2/101‑43 (MQ=255) cgcTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTtga > 1:5556783/1‑101 (MQ=255) gcTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgc > 2:5556427‑M2/1‑54 (MQ=255) gcTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgc < 1:31830‑M2/101‑48 (MQ=255) aataaAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctc > 2:5556391‑M2/1‑51 (MQ=255) atatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGaaa > 1:5556882‑M2/42‑101 (MQ=255) ataaAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcg < 1:32034‑M2/101‑52 (MQ=255) taaAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcgg < 2:31877‑M2/101‑53 (MQ=255) aaaaTGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAAcc < 2:5556603/101‑1 (MQ=255) aaaTGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtg > 1:32545‑M2/1‑47 (MQ=255) caggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACcgc > 2:5556877‑M2/38‑101 (MQ=255) aaTGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgc < 1:31702‑M2/101‑56 (MQ=255) aaTGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACcgc > 2:5556788/1‑101 (MQ=255) tGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGa > 1:5556792/1‑101 (MQ=255) gAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAg < 2:5556694/101‑1 (MQ=255) aaaTTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcg > 2:32533‑M2/1‑42 (MQ=255) aaTTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCa > 2:5556797/1‑101 (MQ=255) taataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCaa < 2:4532510‑M2/70‑1 (MQ=255) aTTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCaa < 2:5556571/101‑1 (MQ=255) aTTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCaa < 1:5556416/101‑1 (MQ=255) tGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAg < 2:5556543/101‑1 (MQ=255) ataccacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTtcag > 2:5556887‑M2/30‑69 (MQ=255) cgcATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGAt < 1:5556566/101‑1 (MQ=255) accacaacacttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGAt < 1:4532365‑M2/74‑1 (MQ=255) gcATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagac < 2:31411‑M2/101‑67 (MQ=255) gcATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCA‑CCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacg < 1:31549‑M2/101‑68 (MQ=255) cacaacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAg < 1:4532140‑M2/76‑1 (MQ=255) aTCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacga < 2:31814‑M2/101‑69 (MQ=255) tCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgat > 1:32507‑M2/1‑32 (MQ=255) caacccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAgg > 1:5556866‑M2/24‑100 (MQ=255) cTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatg < 1:31780‑M2/101‑71 (MQ=255) ttttCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGAt > 1:5556808/1‑101 (MQ=255) ccttaagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAgg > 2:5556865‑M2/20‑96 (MQ=255) ttCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctc > 1:32494‑M2/1‑27 (MQ=255) cGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgc > 2:32486‑M2/1‑25 (MQ=255) aagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGt > 2:5556854‑M2/16‑101 (MQ=255) aagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGt < 2:4532410‑M2/86‑1 (MQ=255) aagttagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGt < 2:4531993‑M2/86‑1 (MQ=255) aaaTAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTc > 2:5556814/1‑101 (MQ=255) aTAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCAt > 1:5556818/1‑101 (MQ=255) tagcgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATg > 2:5556848‑M2/12‑101 (MQ=255) tAAAAATGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttct < 1:4533784‑M2/101‑82 (MQ=255) cgcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATGGtt < 1:4532454‑M2/93‑1 (MQ=255) gcttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATGGttt > 1:5556841‑M2/8‑101 (MQ=255) aaTGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATGGttt < 2:5556514/101‑1 (MQ=255) cttatgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATGGtttt < 2:4532362‑M2/95‑1 (MQ=255) aTGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaat < 2:31670‑M2/101‑87 (MQ=255) aTGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaat > 1:32459‑M2/1‑15 (MQ=255) aTGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATGGtttt > 1:5556827/1‑101 (MQ=255) tGTCCATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaatt > 2:32455‑M2/1‑14 (MQ=255) gTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATGGTTttac > 2:5556829/1‑101 (MQ=255) tgATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATGGTTTTACAg > 2:5556838‑M2/3‑101 (MQ=255) cATCCCCCTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttc < 1:1143948‑M2/93‑84 (MQ=255) ccccctcccccGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTAc < 2:4532326/82‑1 (MQ=255) cccctcccccGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGaa < 1:4532230/56‑1 (MQ=255) cccctcccccGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATGGTTttacagaaaat < 2:4532234/101‑1 (MQ=255) cccctcccccGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATGGTTttacagaaaat > 1:5556895/1‑101 (MQ=255) cccctcccccGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATGGTTttacagaaaat > 2:5556897/1‑101 (MQ=255) cccTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgt > 2:32428‑M2/1‑5 (MQ=255) cTCcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtag < 2:1144005‑M2/101‑99 (MQ=255) cccccGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATGGTTttacagaaaattacag < 2:5556496/101‑1 (MQ=255) cccccGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATGGTTttacagaaaattacag < 1:5556673/101‑1 (MQ=255) ccccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggc < 2:4533886‑M2/101‑101 (MQ=255) ccccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggc > 1:32413‑M2/1‑1 (MQ=255) | CCGTCATATGGATTTTTTCTGCCGCCCGGGCAATATTATTGGTTTGCGCTAATAAAATGAAATTGCGCATCTTTTTCGAAATAAAAATGTCCATCCCCCTCCCCCGCATCCTTGTCCGCTTAACCGTTTCAGTCAGCCTATCCTTGATGAAACCGCGAGCAAAGATAGGTGATTACGTCATGGTTTTACAGAAAATTACAG > NC_000913/3067080‑3067280 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |