| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,593,090 | T→C | A478A (GCT→GCC) | tsr → | methyl‑accepting chemotaxis protein Tsr |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,593,090 | 0 | T | C | 99.7% | 1268.3 / ‑5.4 | 307 | A478A (GCT→GCC) | tsr | methyl‑accepting chemotaxis protein Tsr |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (173/133); total (173/134) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.36e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 307 total aligned reads displayed.
GTCAGCGCCGTGACCCGCGTGACGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCTGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCAGGCCAGTCGCCTGACCGAAG > NC_000913/4592992‑4593187 | tCAGCGCCGTGACCCGCGTGACGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCgag < 1:8499535/101‑1 (MQ=255) cAGCGCCGTGACCCGCGTGACGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCgaga > 2:8499945/1‑101 (MQ=255) aGCGCCGTGACCCGCGTGACGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGAt > 1:8499948/1‑101 (MQ=255) gcCGTGACCCGCGTGACGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGa > 2:8499952/1‑101 (MQ=255) ccGTGACCCGCGTGACGGACATTATGGTCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGAc > 1:8499953/1‑101 (MQ=255) ccGTGACCCGCGTGACGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGAc > 1:8499956/1‑101 (MQ=255) gTGACCCGCGTGACGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCg > 1:8499961/1‑101 (MQ=255) gTGACCCGCGTGACGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCg > 2:8499962/1‑101 (MQ=255) tGACCCGCGTGACGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCgg < 2:8499547/101‑1 (MQ=255) cccGCGTGACGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCggg > 2:8499966/1‑99 (MQ=255) cccGCGTGACGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTa < 1:8499385/101‑1 (MQ=255) cccGCGTGACGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTa < 2:8499763/101‑1 (MQ=255) ccGCGTGACGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTaa > 1:8499968/1‑101 (MQ=255) cgcgTGACGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAAc > 1:8499974/1‑101 (MQ=255) cgcgTGACGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAAc > 2:8499973/1‑101 (MQ=255) cgTGACGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTc < 2:8499581/101‑1 (MQ=255) gTGACGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCa < 2:8499694/101‑1 (MQ=255) gTGACGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCa < 2:8499350/101‑1 (MQ=255) tGACGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCaa > 2:8499980/1‑101 (MQ=255) tGACGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCaa > 2:8499983/1‑101 (MQ=255) gACGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAAc < 1:8499495/101‑1 (MQ=255) aCGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACa > 2:8499988/1‑101 (MQ=255) cGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAg < 1:8499725/101‑1 (MQ=255) cGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAg > 1:8499989/1‑101 (MQ=255) ggACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGAt < 1:8499655/81‑1 (MQ=255) ggACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGa < 1:8499406/101‑1 (MQ=255) gACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGaa > 2:8499996/1‑101 (MQ=255) gACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGaa < 1:8499234/101‑1 (MQ=255) gACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGaa > 1:8499994/1‑101 (MQ=255) aCATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAAc < 2:8499291/101‑1 (MQ=255) aCATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAAc > 2:8499999/1‑101 (MQ=255) aCATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAAc < 1:8499331/101‑1 (MQ=255) aTTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAAtgc > 1:8500003/1‑101 (MQ=255) aTTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAAcgc < 2:8499643/101‑1 (MQ=255) tATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAAcgccg > 2:8500006/1‑101 (MQ=255) tGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCcgcg < 2:8499671/101‑1 (MQ=255) tGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCcgcg < 2:8499471/101‑1 (MQ=255) gggCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCgcgc > 2:8500010/1‑101 (MQ=255) gggCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCgcgc > 1:8500012/1‑101 (MQ=255) ggCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCt > 1:8500016/1‑101 (MQ=255) gCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCtg > 2:8500017/1‑101 (MQ=255) gAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCtggt > 2:8500022/1‑101 (MQ=255) aaTTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCtggtgg > 2:8500025/1‑101 (MQ=255) aTTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGa > 1:8500027/1‑101 (MQ=255) ttGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGaa < 2:8499409/101‑1 (MQ=255) tgcttctgcttcTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGaa < 2:8499275/84‑1 (MQ=255) tgcttctgcttcTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAag < 2:8499584/101‑1 (MQ=255) tgcttctgcttcTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAag > 1:8500030/1‑101 (MQ=255) gcttctgcttctGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAaga < 1:8499672/101‑1 (MQ=255) ttctgcttctgATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGt > 2:8500033/1‑101 (MQ=255) gcttctgATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTctgc > 1:8500037/1‑101 (MQ=255) gcttctgATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTctgc > 2:8500038/1‑101 (MQ=255) cttctgATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTctgcc > 2:8500041/1‑101 (MQ=255) ttctgATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTctgccg < 1:8499682/101‑1 (MQ=255) tctgATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTctgccgc > 2:8500046/1‑101 (MQ=255) tctgATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTctgccgc < 1:8499521/101‑1 (MQ=255) ctgATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTctgccgct > 1:8500049/1‑101 (MQ=255) tgaGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTctgccgctgccg > 1:8500053/1‑101 (MQ=255) tgaGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTctgccgctgc > 2:8500055/1‑99 (MQ=255) gaGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCtgccgctgccgc < 2:8499597/101‑1 (MQ=255) aGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCga < 2:8499514/43‑1 (MQ=255) aGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTgccgcc > 2:8500059/1‑101 (MQ=255) cAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTgccgccgc > 2:8500062/1‑101 (MQ=255) cAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTgccgccgc < 2:8499533/101‑1 (MQ=255) cAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTgccgccgc > 1:8500065/1‑101 (MQ=255) agagCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTgccgccgcc > 2:8500069/1‑101 (MQ=255) gagCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGccgccgccg < 2:8499718/101‑1 (MQ=255) agCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCtg > 1:8500072/1‑72 (MQ=255) gCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCcgcg > 2:8500074/1‑101 (MQ=255) ccGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCgcgc > 1:8500076/1‑101 (MQ=255) cGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCt > 2:8500079/1‑101 (MQ=255) ggTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGa < 2:8499569/101‑1 (MQ=255) tATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAag < 2:8499442/101‑1 (MQ=255) aTCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAaga < 1:8499772/101‑1 (MQ=255) aTCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAaga > 2:8500084/1‑101 (MQ=255) tCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAagag > 1:8500087/1‑101 (MQ=255) gATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCa > 2:8500088/1‑101 (MQ=255) gATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCa > 2:8500091/1‑101 (MQ=255) gATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCa < 1:8499451/101‑1 (MQ=255) aTCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTctgcc > 2:8500098/1‑74 (MQ=255) aTCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCAg > 2:8500095/1‑101 (MQ=255) aTCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCAg < 1:8499637/101‑1 (MQ=255) tCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCt < 1:8499508/90‑1 (MQ=255) tCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCAgg < 2:8499558/101‑1 (MQ=255) aGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCAGGcc < 1:8499457/101‑1 (MQ=255) aGGTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCAGGcc < 1:8499435/101‑1 (MQ=255) ggTTGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCAGGCCa > 1:8500100/1‑101 (MQ=255) ttGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCAGGCCAGt > 2:8500105/1‑101 (MQ=255) tGGCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCAGGCCAGTc < 1:8499550/101‑1 (MQ=255) gCTTAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTg > 1:8500108/1‑83 (MQ=255) tAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCAGGCCAGTCGCCTg > 2:8500110/1‑101 (MQ=255) tAGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCAGGCCAGTCGCCTg < 2:8499634/101‑1 (MQ=255) aGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCAGGCCAGTCGCCTGa < 2:8499605/101‑1 (MQ=255) aGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCAGGCCAGTCGCCTGa < 2:8499661/101‑1 (MQ=255) aGCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCAGGCCAGTCGCCTGa < 1:8499620/101‑1 (MQ=255) gCGGTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCAGGCCAGTCGCCTGAc < 2:8499432/101‑1 (MQ=255) ggTTGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCAGGCCAGTCGCCTGACCg > 2:8500114/1‑101 (MQ=255) ttGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCAGGCCAGTCGCCTGACCGaa > 1:8500118/1‑101 (MQ=255) ttGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCAGGCCAGTCGCCTGACCGaa < 1:8499602/101‑1 (MQ=255) ttGCCGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCAGGCCAGTCGCCTGACCGaa < 1:8499559/101‑1 (MQ=255) | GTCAGCGCCGTGACCCGCGTGACGGACATTATGGGCGAAATTGCTTCTGCTTCTGATGAGCAGAGCCGTGGTATCGATCAGGTTGGCTTAGCGGTTGCTGAGATGGACCGGGTAACTCAACAGAACGCCGCGCTGGTGGAAGAGTCTGCCGCTGCCGCCGCCGCGCTGGAAGAGCAGGCCAGTCGCCTGACCGAAG > NC_000913/4592992‑4593187 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |