Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 778,306 | T→C | G189G (GGT→GGC) | tolB → | Tol‑Pal system periplasmic protein TolB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 778,306 | 0 | T | C | 99.7% | 1342.2 / ‑4.4 | 328 | G189G (GGT→GGC) | tolB | Tol‑Pal system periplasmic protein TolB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (179/147); total (180/148) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.53e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.57e-01 |
Only 100 of 328 total aligned reads displayed.
ACCGGCATTAAAGGTGCGTTCCGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGTTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTATGTGACCTTCGAAAGCG > NC_000913/778208‑778403 | aCCGGCATTAAAGGTGCGTTCCGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTa > 1:1455954/1‑101 (MQ=255) cGGCATTAAAGGTGCGTTCCGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACa > 1:1455958/1‑101 (MQ=255) ggCATTAAAGGTGCGTTCCGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACaa < 2:1455432/101‑1 (MQ=255) gCATTAAAGGTGCGTTCCGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAAc < 2:1455381/101‑1 (MQ=255) gCATTAAAGGTGCGTTCCGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAAc > 2:1455963/1‑101 (MQ=255) aTTAAAGGTGCGTTCCGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCa > 2:1455968/1‑101 (MQ=255) ttAAAGGTGCGTTCCGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAg < 1:1455506/101‑1 (MQ=255) ttAAAGGTGCGTTCCGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAg > 2:1455972/1‑101 (MQ=255) tAAAGGTGCGTTCCGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGAGCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGt > 1:1455973/1‑101 (MQ=255) aaaGGTGCGTTCCGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGtt > 2:1455980/1‑101 (MQ=255) aaaGGTGCGTTCCGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGtt > 1:1455979/1‑101 (MQ=255) aaGGTGCGTTCCGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGttt < 1:1455644/101‑1 (MQ=255) aaGGTGCGTTCCGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGttt < 1:1455337/101‑1 (MQ=255) aGGTGCGTTCCGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTg < 1:1455540/101‑1 (MQ=255) aGGTGCGTTCCGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTg > 1:1455983/1‑101 (MQ=255) gTGCGTTCCGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTc < 1:1455632/101‑1 (MQ=255) cGTTCCGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTcgtt > 2:1455988/1‑101 (MQ=255) cGTTCCGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTcgtt < 2:1455577/101‑1 (MQ=255) gTTCCGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTa > 1:1455992/1‑84 (MQ=255) tCCGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTcgttcac > 2:1455993/1‑101 (MQ=255) cGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTcgttcaccg > 2:1455998/1‑101 (MQ=255) gTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGTTACAACCAGTTTGTcgttcaccgt < 1:1455902/101‑1 (MQ=255) gTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTcgttcaccgt > 1:1455999/1‑101 (MQ=255) aCTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTcgttcaccgttc < 2:1455487/101‑1 (MQ=255) aCTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTcgttcaccgttc > 2:1456004/1‑101 (MQ=255) aCTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTcgttcaccgttc > 1:1456006/1‑101 (MQ=255) cTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTcgttcaccgttca < 2:1455520/101‑1 (MQ=255) cGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCgttcaccgttcacc < 2:1455482/101‑1 (MQ=255) gTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGttcaccgttcaccg > 1:1456009/1‑101 (MQ=255) tATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGc > 2:1456016/1‑101 (MQ=255) tATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGc > 1:1456014/1‑101 (MQ=255) tATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGc > 1:1456018/1‑101 (MQ=255) aTTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCCTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCa < 2:1455639/101‑1 (MQ=255) ttGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAg > 2:1456022/1‑101 (MQ=255) gCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGcc > 1:1456027/1‑101 (MQ=255) gCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGcc > 2:1456028/1‑101 (MQ=255) tACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCt < 2:1455757/101‑1 (MQ=255) tACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCt > 1:1456031/1‑101 (MQ=255) tACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCt < 1:1455649/101‑1 (MQ=255) cGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGa < 1:1455486/101‑1 (MQ=255) cGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGa < 2:1455401/101‑1 (MQ=255) ttgttCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATg < 2:1455508/101‑1 (MQ=255) tgttCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGt < 1:1455406/101‑1 (MQ=255) tgttCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGt > 2:1456038/1‑101 (MQ=255) gttCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGcc > 1:1456040/1‑92 (MQ=255) tCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGtctc < 1:1455128/101‑1 (MQ=255) tCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGtctc < 2:1455606/101‑1 (MQ=255) tCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGtctc > 1:1456044/1‑101 (MQ=255) aGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCg < 2:1455596/101‑1 (MQ=255) aGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCg > 1:1456047/1‑101 (MQ=255) gACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCgg > 1:1456051/1‑101 (MQ=255) cAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGttt > 2:1456054/1‑61 (MQ=255) aaCGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTg > 1:1456055/1‑101 (MQ=255) aCGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTgg < 2:1455417/101‑1 (MQ=255) aCGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTgg < 2:1455285/101‑1 (MQ=255) ggcggTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTcgttca < 1:1455771/65‑1 (MQ=255) ggcggTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTc > 2:1456058/1‑101 (MQ=255) cggTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCAc > 2:1456063/1‑101 (MQ=255) tCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAg > 1:1456068/1‑101 (MQ=255) tCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAg > 2:1456067/1‑101 (MQ=255) tCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAg < 2:1455464/101‑1 (MQ=255) aGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGAc < 2:1455661/101‑1 (MQ=255) tCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGt > 2:1456072/1‑101 (MQ=255) cccGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGtt > 2:1456075/1‑101 (MQ=255) cGTATGAACTGAGCGTATCTGACTATGACGGATACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGAt > 2:1456079/1‑73 (MQ=255) gTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGc > 1:1456083/1‑81 (MQ=255) tATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCt > 2:1456084/1‑99 (MQ=255) aTGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTaaa < 1:1455459/101‑1 (MQ=255) aTGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTaaa > 1:1456089/1‑101 (MQ=255) aaCTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTg > 2:1456094/1‑101 (MQ=255) aaCTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTg < 1:1455605/101‑1 (MQ=255) aaCTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTg > 1:1456093/1‑101 (MQ=255) aCTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGAc > 1:1456098/1‑88 (MQ=255) aCTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTgg < 2:1455446/101‑1 (MQ=255) cTGCGCGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGc < 2:1455919/101‑1 (MQ=255) gcgcGTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCtt > 1:1456103/1‑101 (MQ=255) cgcgTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCgg > 2:1456105/1‑70 (MQ=255) cgTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTAtg < 2:1455686/101‑1 (MQ=255) gTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTAtgt > 2:1456110/1‑101 (MQ=255) gTATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTAtgt < 1:1455663/101‑1 (MQ=255) tATCTGACTATGACGGCTACCACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTg > 2:1456113/1‑92 (MQ=255) tATCTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTAtgtg < 2:1455725/101‑1 (MQ=255) cTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTATGTGAcc < 2:1455535/101‑1 (MQ=255) cTGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTATGTGAcc > 2:1456116/1‑101 (MQ=255) tGACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTATGTGACCt < 1:1455722/101‑1 (MQ=255) gACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTATGTGACCtt > 1:1456118/1‑101 (MQ=255) gACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTATGTGACCtt < 1:1455691/101‑1 (MQ=255) gACTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTATGTGACCtt < 1:1455528/101‑1 (MQ=255) aCTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTATGTGACCTTc > 2:1456121/1‑101 (MQ=255) cTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTATGTGACCTTc < 2:1455500/100‑1 (MQ=255) cTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTATGTGACCTTCg < 1:1455215/101‑1 (MQ=255) cTATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTATGTGACCTTCg < 2:1455799/101‑1 (MQ=255) tATGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTATGTGACCTTCGa < 1:1455423/101‑1 (MQ=255) aTGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTATGTGACCTTCGaa > 2:1456126/1‑101 (MQ=255) tGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTATGTGACCTTCGaaa < 2:1455556/101‑1 (MQ=255) tGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTATGTGACCTTCGaaa > 1:1456128/1‑101 (MQ=255) tGACGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTATGTGACCTTCGaaa > 2:1456130/1‑101 (MQ=255) aCGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTATGTGACCTTCGAAAGc < 2:1455620/101‑1 (MQ=255) aCGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTATGTGACCTTCGAAAGc < 1:1455281/101‑1 (MQ=255) cGGCTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTATGTGACCTTCGAAAGCg > 1:1456135/1‑101 (MQ=255) | ACCGGCATTAAAGGTGCGTTCCGTACTCGTATTGCCTACGTTGTTCAGACCAACGGCGGTCAGTTCCCGTATGAACTGCGCGTATCTGACTATGACGGTTACAACCAGTTTGTCGTTCACCGTTCACCGCAGCCGCTGATGTCTCCGGCGTGGTCACCAGACGGTTCTAAACTGGCTTATGTGACCTTCGAAAGCG > NC_000913/778208‑778403 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |