Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,576,101 | G→A | R507C (CGT→TGT) | yddB ← | putative TonB‑dependent receptor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,576,101 | 0 | G | A | 100.0% | 1530.3 / NA | 353 | R507C (CGT→TGT) | yddB | putative TonB‑dependent receptor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (178/175); total (178/175) |
Only 100 of 353 total aligned reads displayed.
CTGATAACGCGTCAGAGTTTTATTACCTGATACCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACGGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCATAAAGCGCGGGGAGATATTGTGGTTTGACAGATAGTTGTCA > NC_000913/1576003‑1576198 | tGATAACGCGTCAGAGTTTTATTACCTGATACCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGtt > 1:2865646/1‑101 (MQ=255) tGATAACGCGTCAGAGTTTTATTACCTGATACCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGtt > 2:2865647/1‑101 (MQ=255) aTAACGCGTCAGAGTTTTATTACCTGATACCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTtat > 1:2865652/1‑101 (MQ=255) tAACGCGTCAGAGTTTTATTACCTGATACCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTtata > 2:2865658/1‑101 (MQ=255) tAACGCGTCAGAGTTTTATTACCTGATACCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTtata > 1:2865657/1‑101 (MQ=255) aaCGCGTCAGAGTTTTATTACCTGATACCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATaa > 2:2865662/1‑101 (MQ=255) aCGCGTCAGAGTTTTATTACCTGATACCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAAc > 2:2865666/1‑101 (MQ=255) gcgTCAGAGTTTTATTACCTGATACCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACct > 1:2865669/1‑101 (MQ=255) cgTCAGAGTTTTATTACCTGATACCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACctg < 1:2865180/101‑1 (MQ=255) cgTCAGAGTTTTATTACCTGATACCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACctg < 1:2865000/101‑1 (MQ=255) cgTCAGAGTTTTATTACCTGATACCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACctg > 1:2865674/1‑101 (MQ=255) cAGAGTTTTATTACCTGATACCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACctgctg > 2:2865677/1‑101 (MQ=255) cAGAGTTTTATTACCTGATACCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACctgctg > 1:2865678/1‑101 (MQ=255) agagTTTTATTACCTGATCCCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACctg < 1:2864768/97‑1 (MQ=255) agTTTTATTACCTGATACCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTaa > 1:2865683/1‑101 (MQ=255) ttttATTACCTGATACCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATc > 2:2865686/1‑101 (MQ=255) ttttATTACCTGATACCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATc < 1:2865265/101‑1 (MQ=255) ttattaCCTGATACCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCAt > 2:2865689/1‑101 (MQ=255) taCCTGATACCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAg > 1:2865695/1‑101 (MQ=255) tGATACCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGttt > 2:2865700/1‑101 (MQ=255) tGATACCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGttt > 1:2865699/1‑101 (MQ=255) aCCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGAtt > 2:2865706/1‑101 (MQ=255) cGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAg > 1:2865708/1‑101 (MQ=255) gATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAg > 2:2865713/1‑100 (MQ=255) ttCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGc < 1:2865293/99‑1 (MQ=255) ttCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCaa > 1:2865714/1‑101 (MQ=255) tCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAata > 1:2865721/1‑101 (MQ=255) tCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAata > 2:2865722/1‑101 (MQ=255) aGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATcc > 2:2865726/1‑101 (MQ=255) tATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCAt < 1:2865120/101‑1 (MQ=255) aTTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCAtt > 1:2865731/1‑101 (MQ=255) ttGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAg > 2:2865732/1‑75 (MQ=255) cGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGt > 2:2865738/1‑101 (MQ=255) ggATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTc > 1:2865742/1‑101 (MQ=255) ggATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTc > 2:2865743/1‑101 (MQ=255) atatCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCAt < 1:2865316/101‑1 (MQ=255) tatCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCATa > 2:2865747/1‑101 (MQ=255) aCGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCATAAAgc > 1:2865751/1‑101 (MQ=255) aCGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCATAAAgc > 1:2865755/1‑101 (MQ=255) aCGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCATAAAgc < 1:2865340/101‑1 (MQ=255) gTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCATAAAgcgc > 1:2865758/1‑101 (MQ=255) aaTCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCATAAAGCGCgg > 2:2865761/1‑101 (MQ=255) tCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCATAAAGCGCgggg > 1:2865767/1‑101 (MQ=255) tCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCATAAAGCGCgggg > 2:2865765/1‑101 (MQ=255) cccATATCAAAAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCAtt < 2:2864837/54‑1 (MQ=39) cATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCATAAAGCGCGGGgaga > 1:2865772/1‑101 (MQ=255) atCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAatat < 1:2865557/71‑1 (MQ=255) taaaGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCAt < 1:2864857/45‑1 (MQ=39) cAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCATAAAGCGCGGGGAGATATtg > 2:2865777/1‑101 (MQ=255) cAAGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCATAAAGCGCGGGGAGATATtg > 1:2865778/1‑101 (MQ=255) aaGAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCATAAAGCGCGGGgag < 1:2865129/94‑1 (MQ=255) gAATATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCATAAAGCGCGGGGAGATATTGTgg > 1:2865783/1‑101 (MQ=255) aaTATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGttt < 2:2865018/50‑1 (MQ=255) aaTATTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCATAAAGCGCGGGGAGATATTGTGGt > 2:2865784/1‑101 (MQ=255) aaTATCCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCAt < 2:2865116/70‑1 (MQ=255) atatTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCATAAAGCGCGGGGAGATATTGTGGtt < 1:2865258/101‑1 (MQ=255) tatTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCAt < 1:2865190/76‑1 (MQ=255) atTCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCATAAAGCGCGGGGAGATATTGTGGTTTg > 1:2865790/1‑101 (MQ=255) ttCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCa < 1:2865102/37‑1 (MQ=38) ttCCCGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCATAAAGCGCGGGGAGATATTGTGGTTTGa > 1:2865793/1‑101 (MQ=255) cccGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAg < 1:2865055/40‑1 (MQ=39) cccGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAg < 1:2865162/40‑1 (MQ=255) cccGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGttt < 2:2865177/44‑1 (MQ=255) cccGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTa < 2:2865137/49‑1 (MQ=255) cccGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTa < 2:2865386/49‑1 (MQ=255) cccGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCaaaa < 2:2865186/55‑1 (MQ=255) cccGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCaa < 2:2864987/53‑1 (MQ=255) cccGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATcc < 2:2865220/61‑1 (MQ=255) cccGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATc < 2:2865313/60‑1 (MQ=255) cccGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATc < 1:2865216/60‑1 (MQ=255) cccGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCa < 2:2865233/63‑1 (MQ=255) cccGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTc < 2:2865089/70‑1 (MQ=255) cccGCCATAGTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCAt < 2:2865197/72‑1 (MQ=255) 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gTAACAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCATAAAGCGCGGGGAGATATTGTGGTTTGACAGATAGTTgt < 1:2865037/101‑1 (MQ=255) aaCAGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCATAAAGCGCGGGGAGATATTGTGGTTTGACAGATAGTTgtca > 1:2865820/1‑101 (MQ=255) | CTGATAACGCGTCAGAGTTTTATTACCTGATACCGATTCCGTCCAGCTATTGCGGATATCACGTAATCCCATATCAAGAATATTCCCGCCATAGTAACGGTTATAACCTGCTGTAATCATTGAGGTTTGATTAGCAAAAATATCCCATTCCGTCATAAAGCGCGGGGAGATATTGTGGTTTGACAGATAGTTGTCA > NC_000913/1576003‑1576198 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |