| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,589,489 | A→G | G171G (GGT→GGC) | ydeT ← | fimbrial usher domain‑containing protein YdeT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,589,489 | 0 | A | G | 99.7% | 1402.5 / ‑4.7 | 339 | G171G (GGT→GGC) | ydeT | fimbrial usher domain‑containing protein YdeT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (162/176); total (163/176) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.81e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
Only 100 of 339 total aligned reads displayed.
CACCACTCATTCCGTAATAAATCTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAACCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCG > NC_000913/1589392‑1589586 | caccacTCATTCCGTAATAAATCTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCa < 2:2889727/101‑1 (MQ=255) accacTCATTCCGTAATAAATCTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCAc < 2:2889783/101‑1 (MQ=255) accacTCATTCCGTAATAAATCTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCAc > 2:2890220/1‑101 (MQ=255) cacTCATTCCGTAATAAATCTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTg > 2:2890225/1‑101 (MQ=255) tCATTCCGTAATAAATCTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTg > 2:2890229/1‑101 (MQ=255) aTTCCGTAATAAATCTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGcc > 1:2890233/1‑101 (MQ=255) tCCGTAATAAATCTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAg < 2:2889841/101‑1 (MQ=255) tCCGTAATAAATCTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAg > 2:2890236/1‑101 (MQ=255) tCCGTAATAAATCTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAg < 2:2889578/101‑1 (MQ=255) ccGTAATAAATCTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGa > 2:2890240/1‑101 (MQ=255) ccGTAATAAATCTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGa < 1:2889680/101‑1 (MQ=255) ccGTAATAAATCTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGa < 1:2889722/101‑1 (MQ=255) taataaATCTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGa > 1:2890245/1‑101 (MQ=255) aataaATCTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGAt < 1:2889743/101‑1 (MQ=255) aataaATCTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGAt < 2:2889658/101‑1 (MQ=255) taaATCTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGt < 1:2889668/101‑1 (MQ=255) aaaTCTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTa < 1:2889695/101‑1 (MQ=255) aaTGTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTAt > 2:2890248/1‑101 (MQ=255) aTCTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTAtt > 1:2890250/1‑101 (MQ=255) tCTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTa < 1:2889444/101‑1 (MQ=255) cTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTAc > 1:2890253/1‑101 (MQ=255) tGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTAcc > 1:2890259/1‑101 (MQ=255) ggCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCt > 1:2890262/1‑101 (MQ=255) ggCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCt < 1:2889894/101‑1 (MQ=255) ggCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCt < 1:2889623/101‑1 (MQ=255) tgctgTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCg > 1:2890267/1‑101 (MQ=255) tgctgTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCg > 2:2890268/1‑101 (MQ=255) ctgTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTg > 2:2890277/1‑101 (MQ=255) ctgTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTg < 1:2889883/101‑1 (MQ=255) ctgTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTg < 2:2890209/101‑1 (MQ=255) ctgTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTg > 1:2890274/1‑101 (MQ=255) tgTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTgg > 1:2890278/1‑101 (MQ=255) gTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTggg > 2:2890286/1‑101 (MQ=255) gTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTggg < 2:2889801/101‑1 (MQ=255) gTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTggg < 1:2889718/101‑1 (MQ=255) gTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTggg > 1:2890284/1‑101 (MQ=255) caccacTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCa < 2:2889830/77‑1 (MQ=255) accacTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGgtgt > 1:2890291/1‑101 (MQ=255) cacTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTa < 2:2889948/101‑1 (MQ=255) cacTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTa > 2:2890296/1‑101 (MQ=255) cacTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTa > 1:2890295/1‑101 (MQ=255) cacTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTa < 1:2889370/101‑1 (MQ=255) cTCCGGCTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTcc < 2:2889237/89‑1 (MQ=255) cTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTAcc > 1:2890301/1‑101 (MQ=255) tCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCg > 2:2890304/1‑101 (MQ=255) ccGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGa < 1:2889602/101‑1 (MQ=255) gACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGAcc < 1:2889806/101‑1 (MQ=255) aCTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCt > 1:2890309/1‑101 (MQ=255) aCTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCt < 2:2890087/101‑1 (MQ=255) cTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTg < 2:2889692/101‑1 (MQ=255) tGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGa < 1:2890020/101‑1 (MQ=255) tAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAAc > 2:2890313/1‑101 (MQ=255) aaCCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACg > 2:2890319/1‑101 (MQ=255) aaCCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACg > 1:2890316/1‑101 (MQ=255) aCCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGc > 1:2890322/1‑101 (MQ=255) ccGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGAc > 2:2890323/1‑63 (MQ=255) cGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCGCTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACg < 2:2889823/98‑1 (MQ=255) gACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCtat < 1:2889775/101‑1 (MQ=255) cATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATaa < 2:2889989/101‑1 (MQ=255) ttAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAAtt > 1:2890329/1‑101 (MQ=255) ttAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAAtt > 2:2890330/1‑101 (MQ=255) gTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAg < 1:2889858/101‑1 (MQ=255) tATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAgg > 1:2890335/1‑101 (MQ=255) ttACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGtt < 1:2889581/101‑1 (MQ=255) ttACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGtt > 2:2890338/1‑101 (MQ=255) aCCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGttat < 2:2889705/101‑1 (MQ=255) aCCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGttat < 1:2890237/101‑1 (MQ=255) ccATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGttatt < 2:2889535/101‑1 (MQ=255) cATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGttatta > 1:2890341/1‑101 (MQ=255) cATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGttatta < 2:2889876/101‑1 (MQ=255) aTAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTtattat < 1:2889851/101‑1 (MQ=255) aTAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTtattat > 1:2890345/1‑101 (MQ=255) aaGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATcc > 1:2890349/1‑101 (MQ=255) aaGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATcc < 1:2889925/101‑1 (MQ=255) aGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTAtt < 2:2889597/51‑1 (MQ=255) gCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCgg < 2:2889647/101‑1 (MQ=255) gCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCgg > 2:2890352/1‑101 (MQ=255) cTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGgc > 1:2890354/1‑101 (MQ=255) tCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATc > 2:2890360/1‑96 (MQ=255) tCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGgca < 2:2889742/101‑1 (MQ=255) tCCACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACAATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGgca < 2:2889813/101‑1 (MQ=255) ccACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGgcag > 1:2890361/1‑101 (MQ=255) ccACGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGgcag < 1:2889751/101‑1 (MQ=255) cGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGGcagcag < 1:2890089/101‑1 (MQ=255) cGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGGcagcag > 2:2890364/1‑101 (MQ=255) cGATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGGcagcag < 1:2889835/101‑1 (MQ=255) gATAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTa < 1:2889659/44‑1 (MQ=255) aTAATTAAGAGAACTGTAGCCACTGATGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGGCAGCagag > 1:2890370/1‑101 (MQ=255) aTTAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGGCAGCAGAGTGc > 2:2890372/1‑101 (MQ=255) tAAGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGGCAGCAGAGTGCCa < 1:2890217/101‑1 (MQ=255) aaGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGGCAGCAGAGTGCCAt > 2:2890376/1‑101 (MQ=255) aaGAGAACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGGCAGCAGAGTGCCAt < 2:2889624/101‑1 (MQ=255) gagaACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGGCAGCAGAGTGCCATaa < 1:2889760/101‑1 (MQ=255) gagaACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGGCAGCAGAGTGCCATaa < 1:2889498/101‑1 (MQ=255) agaACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGGCAGCAGAGTGCCATaaa < 1:2889943/101‑1 (MQ=255) gaACTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGGCAGCAGAGTGCCATAAAc < 2:2889764/101‑1 (MQ=255) aaCTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGGCAGCAGAGTGCCATAAAcc < 1:2889701/101‑1 (MQ=255) aCTGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGGCAGCAGAGTGCCATAAAccc < 1:2889797/101‑1 (MQ=255) tGTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGGCAGCAGAGTGCCATAAAccccc > 1:2890381/1‑101 (MQ=255) gTAGCCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTCACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCg < 2:2889671/101‑1 (MQ=255) | CACCACTCATTCCGTAATAAATCTGGCTGCTGTCACCACTCCGACTGTAACCGACATTAGTATTACCATAAGCTCCACGATAATTAAGAGAACTGTAACCACTGGTGCCAGACGATGTATTACCTCCGTGGGTGTTACCGACCTGAACGCTATAATTCAGGTTATTATCCGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCG > NC_000913/1589392‑1589586 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |