| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,138,732 | T→C | H277H (CAT→CAC) | yegH → | inner membrane protein YegH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,138,732 | 0 | T | C | 90.6% | 1112.9 / 85.0 | 330 | H277H (CAT→CAC) | yegH | inner membrane protein YegH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (15/16); new base C (123/176); total (138/192) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.50e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.78e-01 | |||||||||||
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
CTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACGTCGCGCC > NC_000913/2138634‑2138829 | cTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACgg < 2:3851449/101‑1 (MQ=255)cTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACgg > 1:3851686/1‑101 (MQ=255) tGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGt < 2:3850996/101‑1 (MQ=255) tGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGt > 2:3851687/1‑101 (MQ=255) gcgcCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTa < 2:3851206/101‑1 (MQ=255) cAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACca > 2:3851691/1‑101 (MQ=255) cAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACca < 2:3851161/101‑1 (MQ=255) aGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACcag < 2:3851307/101‑1 (MQ=255) gCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACcagc < 2:3851078/101‑1 (MQ=255) ggACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAACCCGCGTCCATGCTGGTGGATCACgg < 1:3851160/91‑1 (MQ=255) gACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGa > 1:3851697/1‑101 (MQ=255) aCTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGAt > 2:3851699/1‑101 (MQ=255) cTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAGGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATc < 1:3851173/101‑1 (MQ=255) cTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACcagc < 2:3851184/96‑1 (MQ=255) tACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCt > 1:3851702/1‑101 (MQ=255) cGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTa < 1:3850755/101‑1 (MQ=255) cGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTa > 2:3851707/1‑101 (MQ=255) gAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTaa < 1:3851119/101‑1 (MQ=255) gAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTaa > 1:3851708/1‑101 (MQ=255) aGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATc > 1:3851712/1‑101 (MQ=255) cGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCg < 2:3851038/101‑1 (MQ=255) cGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCg < 1:3851346/101‑1 (MQ=255) cGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCg > 2:3851715/1‑101 (MQ=255) ggTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCg < 1:3851330/100‑1 (MQ=255) tAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGAt > 2:3851720/1‑88 (MQ=255) aaTGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAgg > 1:3851721/1‑101 (MQ=255) aTGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGa > 2:3851725/1‑101 (MQ=255) aTGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGa < 1:3851137/101‑1 (MQ=255) cgcCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAAcg < 2:3850864/101‑1 (MQ=255) cgcCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAAcg > 2:3851730/1‑101 (MQ=255) gcCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAAcgg > 2:3851733/1‑101 (MQ=255) ccTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAAcggc < 2:3851312/101‑1 (MQ=255) ccTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAAcggc > 1:3851735/1‑101 (MQ=255) tGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAAcggcgg > 2:3851739/1‑101 (MQ=255) cTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGgat < 2:3851113/101‑1 (MQ=255) cTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGgat > 1:3851743/1‑101 (MQ=255) tAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGgatga < 2:3851285/101‑1 (MQ=255) gCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGAtt < 2:3851129/101‑1 (MQ=255) gggCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGa < 2:3851067/101‑1 (MQ=255) gggCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGa < 1:3851143/101‑1 (MQ=255) gCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGc > 1:3851748/1‑101 (MQ=255) gCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGc > 2:3851749/1‑101 (MQ=255) cAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAAc > 1:3851753/1‑85 (MQ=255) cAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCg < 2:3851481/101‑1 (MQ=255) cAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCg < 2:3851267/101‑1 (MQ=255) aaaaaGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGAtt < 1:3851262/95‑1 (MQ=255) aaaaaGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCgg > 1:3851756/1‑101 (MQ=255) aaaaGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCggg < 1:3851084/101‑1 (MQ=255) aaaaGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCggg < 1:3851202/101‑1 (MQ=255) aaaaGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCggg < 2:3851099/101‑1 (MQ=255) aaaGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCggg > 2:3851759/1‑100 (MQ=255) aaaGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGt < 2:3851217/101‑1 (MQ=255) aaaGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGt < 1:3851232/101‑1 (MQ=255) agaagaTGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTAc < 2:3851194/101‑1 (MQ=255) gaagaTGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACt < 2:3851245/101‑1 (MQ=255) aagaTGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACtt > 2:3851766/1‑101 (MQ=255) aagaTGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACtt > 1:3851765/1‑101 (MQ=255) agaTGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTa < 1:3851094/101‑1 (MQ=255) agaTGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTa < 2:3851235/101‑1 (MQ=255) gaTGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTaa < 1:3851320/101‑1 (MQ=255) aTGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAAt > 2:3851772/1‑101 (MQ=255) aTGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAAt < 1:3851246/101‑1 (MQ=255) aTGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAAt > 1:3851771/1‑101 (MQ=255) tGCGGAACTGGACGCCTAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAAcggcg < 2:3851331/78‑1 (MQ=255) tGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATc < 1:3851008/101‑1 (MQ=255) cGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCtt < 2:3851300/101‑1 (MQ=255) ggAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTa > 1:3851776/1‑101 (MQ=255) gAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTaa > 2:3851778/1‑101 (MQ=255) aCTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAAcc < 1:3850960/101‑1 (MQ=255) aCTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAAcc > 2:3851781/1‑101 (MQ=255) cTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCa < 2:3851251/101‑1 (MQ=255) cTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCa < 2:3851417/101‑1 (MQ=255) tGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAg < 1:3851178/101‑1 (MQ=255) ggACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGc < 1:3851389/101‑1 (MQ=255) ggACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGc < 1:3851375/101‑1 (MQ=255) ggACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGc < 2:3851361/101‑1 (MQ=255) ggACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGc > 2:3851785/1‑101 (MQ=255) aCGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGt < 1:3851216/101‑1 (MQ=255) gCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTAc > 2:3851789/1‑101 (MQ=255) ccGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTAcc > 2:3851793/1‑101 (MQ=255) cGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCg < 1:3851236/101‑1 (MQ=255) gAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGt > 1:3851796/1‑101 (MQ=255) aaaCCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTc < 1:3851277/101‑1 (MQ=255) aaCCGCGTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTca > 2:3851800/1‑101 (MQ=255) gcgTCCATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAg > 2:3851803/1‑87 (MQ=255) ccATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCAtt < 1:3851306/101‑1 (MQ=255) ccATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCAtt < 1:3851515/101‑1 (MQ=255) ccATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCAtt > 1:3851806/1‑101 (MQ=255) cATGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTa < 1:3851457/101‑1 (MQ=255) aTGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTAt > 1:3851810/1‑101 (MQ=255) tGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATg < 1:3850914/101‑1 (MQ=255) tGCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATg < 1:3851052/101‑1 (MQ=255) gCTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGGACTTa > 2:3851812/1‑68 (MQ=255) cTGGTGGATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGAc < 2:3851547/101‑1 (MQ=255) tggtggATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCACGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACg > 1:3851814/1‑101 (MQ=255) ggtggATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACGt < 2:3851368/101‑1 (MQ=255) gtggATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACGTc < 1:3851401/101‑1 (MQ=255) gATCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACGTcgcg < 2:3851391/101‑1 (MQ=255) aTCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACGTCgcgc > 1:3851820/1‑101 (MQ=255) tCACGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACGTCGCGcc > 1:3851824/1‑101 (MQ=255) | CTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACGTCGCGCC > NC_000913/2138634‑2138829 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |