Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 2,304,858 T→C intergenic (+465/+250) eco → / ← mqo serine protease inhibitor ecotin/malate:quinone oxidoreductase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0009132,304,8580TC100.0% 345.0 / NA 125intergenic (+465/+250)eco/mqoserine protease inhibitor ecotin/malate:quinone oxidoreductase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (76/49);  total (76/49)

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                                 cAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgcc       >  1:4150415/1‑101 (MQ=17)
                                 cAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgcc       <  1:4149907/101‑1 (MQ=17)
                                  aaCGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccg      >  2:4150416/1‑101 (MQ=17)
                                   aCGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccgc     >  1:4150417/1‑101 (MQ=17)
                                     gTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCAt   >  1:4150419/1‑101 (MQ=14)
                                     gTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCAt   >  1:4150421/1‑101 (MQ=14)
                                      tCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATc  <  1:4149718/101‑1 (MQ=11)
                                      tCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATc  >  1:4150423/1‑101 (MQ=11)
                                                                                                  |                                        
GTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATC  >  NC_000913/2304760‑2304898

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑