| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 286,526 | Δ1 bp | coding (1132/1383 nt) | yagG → | putative D‑xylonate transporter YagG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 286,523 | 0 | G | . | 99.6% | 1332.2 / ‑2.5 | 253 | coding (1129/1383 nt) | yagG | putative D‑xylonate transporter YagG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base . (105/147); total (106/147) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.19e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
TGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCT > NC_000913/286423‑286619 | tGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTggcg > 1:527519/1‑101 (MQ=255) gACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTggcgg > 2:527520/1‑101 (MQ=255) gACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTggcgg < 2:526817/101‑1 (MQ=255) cGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTggcgggg > 2:527523/1‑101 (MQ=255) cGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTggcgggc < 2:527087/101‑2 (MQ=255) cGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTggcgggc < 2:527021/101‑2 (MQ=255) cGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTggcgggc < 1:526834/101‑2 (MQ=255) ggtggACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTggcgggcggg > 2:527528/1‑97 (MQ=255) aCTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGtggtgg < 2:527298/101‑1 (MQ=255) cTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTggg < 1:526935/101‑1 (MQ=255) cTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTggg < 2:526877/101‑1 (MQ=255) tACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGc > 1:527532/1‑101 (MQ=255) aCGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTggcgggcgg > 2:527533/1‑89 (MQ=255) aCGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCt < 1:526841/101‑1 (MQ=255) aggagAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTggcgggcgg > 2:527541/1‑86 (MQ=255) aggagAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGa > 1:527539/1‑101 (MQ=255) ggagAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGAt < 1:527106/101‑1 (MQ=255) gagaGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATc < 1:527130/101‑1 (MQ=255) gagaGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATc < 1:527080/101‑1 (MQ=255) gagaGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATc > 1:527542/1‑101 (MQ=255) gagCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCt < 1:527051/101‑1 (MQ=255) agCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTg < 2:526910/101‑1 (MQ=255) cGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCggtgg > 2:527547/1‑84 (MQ=255) gCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGt < 1:527208/101‑1 (MQ=255) gCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGt < 2:527014/101‑1 (MQ=255) gCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACg < 1:527024/101‑1 (MQ=255) cGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGt > 2:527550/1‑101 (MQ=255) ggTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTc > 1:527551/1‑101 (MQ=255) gccgccTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTa < 1:526980/93‑1 (MQ=255) ccgccTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTa < 2:527031/101‑1 (MQ=255) cgccTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTAt < 2:527123/101‑1 (MQ=255) cgccTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTAt < 1:527040/101‑1 (MQ=255) gccTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTAtt > 2:527556/1‑101 (MQ=255) ccTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTggcgggggg > 2:527559/1‑65 (MQ=255) ccTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTc < 1:527244/101‑1 (MQ=255) ccTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTc < 2:526978/101‑1 (MQ=255) cTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTcc < 2:527179/101‑1 (MQ=255) tCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCg < 2:527107/101‑1 (MQ=255) tCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCg > 1:527561/1‑101 (MQ=255) gACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCggtgg > 2:527569/1‑66 (MQ=255) gACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGcc > 1:527568/1‑101 (MQ=255) gACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGcc > 1:527565/1‑101 (MQ=255) aCGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCca < 1:527525/101‑1 (MQ=255) cGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCcag > 1:527572/1‑101 (MQ=255) cGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCcag > 2:527573/1‑101 (MQ=255) ggCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCcagca < 1:526863/101‑1 (MQ=255) ggCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCcagca < 2:527263/101‑1 (MQ=255) gCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGACGTACGTCAACTATTCCGCcagcag < 1:527181/101‑1 (MQ=255) cTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCcagcag > 2:527579/1‑100 (MQ=255) ggTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCcagcagcag > 1:527582/1‑101 (MQ=255) ggTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCcagcagcag < 2:526936/101‑1 (MQ=255) gtgtTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCcagcagca > 2:527583/1‑99 (MQ=255) tgtTCTCCACCTACCTGTTTAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCg < 2:527243/101‑1 (MQ=255) tgtTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCcagcagc < 2:526948/97‑1 (MQ=255) gtTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGt < 1:527270/101‑1 (MQ=255) gtTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGt < 2:527155/101‑1 (MQ=255) tctcCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGc < 2:527387/101‑1 (MQ=255) ctcCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCa < 1:527151/101‑1 (MQ=255) ctcCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCa < 1:527175/101‑1 (MQ=255) ctcCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCa < 2:527131/101‑1 (MQ=255) tcCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAg > 1:527590/1‑101 (MQ=255) tcCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGGGGTGGGCTGGATCCTGGc > 2:527591/1‑67 (MQ=255) ccACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGc > 2:527593/1‑101 (MQ=255) cACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGcc < 2:527050/101‑1 (MQ=255) cACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGcc < 2:527074/101‑1 (MQ=255) acctacctGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCg > 2:527597/1‑101 (MQ=255) cctacctGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCt < 2:526858/53‑1 (MQ=255) cctacctGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCt > 2:527602/1‑53 (MQ=255) cctacctGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAg < 2:527062/97‑1 (MQ=255) cctacctGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCgg > 1:527601/1‑101 (MQ=255) ctacctGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGt < 2:526789/101‑1 (MQ=255) tacctGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGtt < 1:527140/101‑1 (MQ=255) cctGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCcagcagc > 2:527609/1‑84 (MQ=255) cctGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGa > 1:527607/1‑101 (MQ=255) tGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTc < 1:527005/72‑1 (MQ=255) tGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAgg < 1:527089/101‑1 (MQ=255) tGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAgg > 1:527612/1‑101 (MQ=255) gTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAgg > 2:527614/1‑100 (MQ=255) ttCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTg < 2:527003/101‑1 (MQ=255) ttCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTg > 2:527616/1‑101 (MQ=255) tCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGc < 1:527291/101‑1 (MQ=255) cAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCt < 1:527194/101‑1 (MQ=255) cAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCt < 1:527361/101‑1 (MQ=255) cAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCt > 1:527620/1‑101 (MQ=255) gCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGc > 2:527627/1‑40 (MQ=38) gCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTca > 1:527624/1‑101 (MQ=255) gCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTca < 1:527015/101‑1 (MQ=255) ccTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTcac > 1:527629/1‑101 (MQ=255) tGAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTcacca > 1:527634/1‑101 (MQ=255) gAAGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTcaccac < 1:526957/101‑1 (MQ=255) aaGATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGGGc > 2:527636/1‑93 (MQ=255) gATTGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCAt < 1:527071/101‑1 (MQ=255) tGGCCTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCaa < 2:527276/101‑1 (MQ=255) cTGGCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAAtt > 1:527639/1‑101 (MQ=255) ggCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAAttct < 1:527148/101‑1 (MQ=255) ggCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAAttct > 1:527643/1‑101 (MQ=255) gCGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAAttctg < 1:527115/101‑1 (MQ=255) cGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAAttctgt > 1:527647/1‑101 (MQ=255) cGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAAttctgt < 2:527227/101‑1 (MQ=255) cGATTGGC‑GGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAAttctgt > 2:527646/1‑101 (MQ=255) | TGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCT > NC_000913/286423‑286619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |