| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 308,054 | (C)7→8 | coding (1279/2526 nt) | ecpC ← | putative fimbrial usher protein EcpC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 308,047 | 1 | . | C | 98.3% | 974.0 / 6.7 | 233 | coding (1286/2526 nt) | ecpC | putative fimbrial usher protein EcpC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/2); new base C (123/106); total (125/108) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
CCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCG > NC_000913/307947‑308142 | ccACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCg > 2:567775/1‑101 (MQ=255) acaGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑cc > 2:567780/1‑101 (MQ=255) acaGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACATTGATCG‑‑cc < 1:567180/101‑1 (MQ=255) caGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑ccc < 2:567529/101‑1 (MQ=255) caGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑ccc < 1:567387/101‑1 (MQ=255) aGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑cccc < 1:567020/101‑1 (MQ=255) cGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑cccccc > 1:567783/1‑101 (MQ=255) gAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTACCGTTGATCG‑‑ccccccc < 2:567196/101‑1 (MQ=255) aaCTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑cccccccc < 1:567047/101‑2 (MQ=255) aaCTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑cccccccc > 2:567787/1‑100 (MQ=255) aaCTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑cccccccc > 2:567785/1‑100 (MQ=255) tAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑ccccccccaag > 2:567792/1‑97 (MQ=255) tAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑ccccccccaag > 1:567791/1‑97 (MQ=255) aaaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑ccccccccaagc > 2:567798/1‑96 (MQ=255) aaaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑ccccccccaagc < 1:567432/101‑6 (MQ=255) aaaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑ccccccccaagc < 2:567293/101‑6 (MQ=255) aaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCg < 2:567385/101‑1 (MQ=255) gCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGc < 1:567339/101‑1 (MQ=255) gCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGc > 1:567800/1‑101 (MQ=255) cTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAg > 2:567803/1‑101 (MQ=255) tCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCCAAGCGGCAg < 2:567417/101‑1 (MQ=255) tCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGc < 2:567070/101‑1 (MQ=255) tCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGc > 1:567805/1‑101 (MQ=255) cccGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCg < 1:567369/101‑1 (MQ=255) ccGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCg > 2:567808/1‑100 (MQ=255) ggTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCa > 1:567810/1‑101 (MQ=255) gTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAg > 1:567814/1‑101 (MQ=255) tAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGa > 2:567816/1‑101 (MQ=255) agagTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGAc < 2:567078/101‑1 (MQ=255) agTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACgg > 1:567822/1‑101 (MQ=255) gTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACggg < 1:567519/101‑1 (MQ=255) ggCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGtt > 1:567824/1‑101 (MQ=255) ggCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGtt < 2:567286/101‑1 (MQ=255) ggCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGtt < 1:567153/101‑1 (MQ=255) cgcTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTc < 1:567729/101‑1 (MQ=255) cgcTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTc > 2:567826/1‑101 (MQ=255) cTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcac > 1:567829/1‑101 (MQ=255) gATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcaccc > 1:567832/1‑101 (MQ=255) gctgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcacccacc < 1:567227/101‑1 (MQ=255) gctgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcacccacc < 1:567412/101‑1 (MQ=255) tgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCGCTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGc > 1:567836/1‑101 (MQ=255) ccGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCt > 2:567838/1‑101 (MQ=255) cGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTg < 1:567631/101‑1 (MQ=255) ctgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTAt < 2:567563/101‑1 (MQ=255) tgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATc > 1:567841/1‑101 (MQ=255) ctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGt > 1:567845/1‑101 (MQ=255) ctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGt > 2:567844/1‑101 (MQ=255) ccATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTAt > 2:567848/1‑101 (MQ=255) aTGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATcc > 2:567852/1‑101 (MQ=255) gAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCat > 1:567853/1‑101 (MQ=255) gCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCatat > 1:567856/1‑101 (MQ=255) cTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATc < 1:567624/101‑1 (MQ=255) tGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATcc < 2:567487/101‑1 (MQ=255) gTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATccc > 2:567861/1‑101 (MQ=255) gTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATccc < 2:567258/101‑1 (MQ=255) gTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATccc < 1:567317/101‑1 (MQ=255) tCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCg < 1:567573/101‑1 (MQ=255) tCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCg < 2:567344/101‑1 (MQ=255) tCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCg > 1:567863/1‑101 (MQ=255) aCTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGtt > 1:567865/1‑101 (MQ=255) cTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGtt < 2:567444/101‑1 (MQ=255) cTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTg < 2:567006/101‑1 (MQ=255) cTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTg < 2:567604/101‑1 (MQ=255) tGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGcc > 2:567870/1‑75 (MQ=255) tGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑CCCCCCCAAGCGGCAg > 1:567872/1‑49 (MQ=255) ggCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgcc > 2:567874/1‑101 (MQ=255) gCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccg > 1:567876/1‑101 (MQ=255) aGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccgcc > 1:567883/1‑101 (MQ=255) aGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGccc > 2:567881/1‑101 (MQ=255) gCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCa < 2:567392/101‑1 (MQ=255) cATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAg > 2:567886/1‑101 (MQ=255) atatTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCata < 2:567362/85‑1 (MQ=255) atatTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAg < 2:567517/101‑1 (MQ=255) atatTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGc < 2:567161/101‑1 (MQ=255) atatTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGc > 1:567888/1‑101 (MQ=255) tatTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCa < 2:567381/98‑1 (MQ=255) tatTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCt < 1:567499/101‑1 (MQ=255) atTTTGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTa > 1:567892/1‑101 (MQ=255) ttttGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTaa > 2:567894/1‑101 (MQ=255) tttGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAg < 1:567469/101‑1 (MQ=255) ttGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGc > 2:567898/1‑101 (MQ=255) ttGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGc < 1:567448/101‑1 (MQ=255) ttGCAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGc < 1:567256/101‑1 (MQ=255) cAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTa > 1:567900/1‑101 (MQ=255) cAGGTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTa > 2:567902/1‑101 (MQ=255) ggTTAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCAAAGCGTAca < 2:567552/101‑2 (MQ=255) ttAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCa > 2:567906/1‑101 (MQ=255) tAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCaa > 1:567908/1‑101 (MQ=255) tAACGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCaa < 1:567539/101‑1 (MQ=255) aaCGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAGGCGTACTCAAt < 1:567597/101‑1 (MQ=255) aaCGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAAt > 1:567912/1‑101 (MQ=255) aCGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATg > 2:567915/1‑101 (MQ=255) aCGTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATg > 1:567916/1‑101 (MQ=255) gTTGATCGCCCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGa > 2:567921/1‑101 (MQ=255) gTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAg > 1:567918/1‑101 (MQ=255) gTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAg < 1:567484/101‑1 (MQ=255) gTTGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAg < 1:567296/101‑1 (MQ=255) ttGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGc < 1:567456/101‑1 (MQ=255) tGATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgcc > 1:567925/1‑75 (MQ=255) gATCGC‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCg < 2:567464/101‑1 (MQ=255) | CCACAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑‑CCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCG > NC_000913/307947‑308142 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |