Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,177,509 | (C)6→7 | coding (402/630 nt) | nudF ← | ADP‑sugar pyrophosphatase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,177,503 | 1 | . | C | 92.7% | 1069.4 / 69.7 | 273 | coding (408/630 nt) | nudF | ADP‑sugar pyrophosphatase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (10/10); new base C (162/91); total (172/101) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.34e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 305 total aligned reads displayed.
ATGAACGCGAATATCTTCGTTTTCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTG‑‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCAATCGCTTCGCGACGGGCAACATCTTCCAC > NC_000913/3177404‑3177598 | tGAACGCGAATATCTTCGTTTTCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTG‑‑cc > 2:5901579/1‑101 (MQ=255) tGAACGCGAATATCTTCGTTTTCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTG‑‑cc > 1:5901576/1‑101 (MQ=255) aaCGCGAATATCTTCGTTTTCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTG‑‑cccc > 2:5901583/1‑101 (MQ=255) aaCGCGAATATCTTCGTTTTCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTG‑‑cccc > 1:5901584/1‑101 (MQ=255) gcgAATATCTTCGTTTTCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTG‑‑ccccccc < 1:5900984/101‑2 (MQ=255) gcgAATATCTTCGTTTTCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTG‑‑ccccccc > 2:5901589/1‑100 (MQ=255) gcgAATATCTTCGTTTTCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTG‑‑ccccccc < 1:5901365/101‑2 (MQ=255) gAATATCTTCGTTTTCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTG‑‑CCCCCCcgg > 1:5901592/1‑101 (MQ=255) gAATATCTTCGTTTTCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTG‑‑CCCCCCcgg < 1:5901145/101‑1 (MQ=255) gAATATCTTCGTTTTCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTG‑‑CCCCCCcgg > 2:5901595/1‑101 (MQ=255) aaTATCTTCGTTTTCATCAGCCAGACCGTGAATCCCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTG‑‑cccc < 1:5901209/95‑1 (MQ=255) atatCTTCGTTTTCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTG‑‑cccccccg > 2:5901602/1‑96 (MQ=255) atatCTTCGTTTTCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTG‑‑CCCCCCcgggc > 1:5901600/1‑99 (MQ=255) cTTCGTTTTCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGc > 2:5901607/1‑101 (MQ=255) ttCGTTTTCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTG‑‑c < 1:5901126/86‑1 (MQ=255) tCGTTTTCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCa > 1:5901609/1‑101 (MQ=255) cGTTTTCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAg < 1:5901039/101‑1 (MQ=255) gTTTTCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAgg > 2:5901612/1‑101 (MQ=255) ttttCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGa > 2:5901616/1‑101 (MQ=255) ttttCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGa < 1:5901257/101‑1 (MQ=255) tttCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGaa > 1:5901617/1‑101 (MQ=255) ttCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAgg > 2:5901625/1‑98 (MQ=255) ttCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGaaa > 1:5901622/1‑101 (MQ=255) catcaGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACt > 1:5901628/1‑101 (MQ=255) catcaGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACt > 1:5901631/1‑101 (MQ=255) tcaGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTa > 2:5901635/1‑101 (MQ=255) aGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAac > 1:5901640/1‑101 (MQ=255) aGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAac > 2:5901641/1‑101 (MQ=255) ccAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAacac > 1:5901646/1‑101 (MQ=255) aGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCg > 1:5901650/1‑101 (MQ=255) aGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCg > 2:5901649/1‑101 (MQ=255) aCCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGt < 1:5901094/101‑1 (MQ=255) ccGTGAATCCCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGtt < 1:5901504/101‑1 (MQ=255) cGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGaaa > 2:5901656/1‑87 (MQ=255) cGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGttt > 1:5901655/1‑101 (MQ=255) tGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTgg > 1:5901661/1‑101 (MQ=255) gAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGt > 2:5901662/1‑101 (MQ=255) aTACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTcc > 2:5901665/1‑101 (MQ=255) aCCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGt > 1:5901669/1‑101 (MQ=255) cGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGttt > 2:5901672/1‑101 (MQ=255) gCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTg > 1:5901675/1‑101 (MQ=255) cTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGa > 1:5901678/1‑101 (MQ=255) ttGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTTACTGGTG‑‑CCCCCCcgg < 2:5901085/62‑1 (MQ=255) tGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGa > 2:5901682/1‑72 (MQ=255) gCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTa > 1:5901683/1‑101 (MQ=255) ggTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGCCCCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTAt < 1:5901322/101‑1 (MQ=255) ggTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTg > 1:5901689/1‑86 (MQ=255) ggTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATc > 2:5901688/1‑101 (MQ=255) gTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAg < 1:5900780/66‑1 (MQ=255) gTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCa < 1:5901235/101‑1 (MQ=255) gTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGa < 1:5901163/65‑1 (MQ=255) tGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTcc > 2:5901694/1‑101 (MQ=255) tGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTcc > 1:5901695/1‑101 (MQ=255) gTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGcc > 2:5901700/1‑101 (MQ=255) ccACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCctc > 2:5901703/1‑101 (MQ=255) cACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCctct > 1:5901704/1‑101 (MQ=255) aCTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCtt > 1:5901708/1‑101 (MQ=255) cGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCtt < 2:5901277/45‑1 (MQ=255) cGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCg < 1:5901070/74‑1 (MQ=255) gCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCAATc > 1:5901713/1‑101 (MQ=255) cccACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAgg < 2:5901218/49‑1 (MQ=255) cccACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGaaa < 2:5901321/52‑1 (MQ=255) cccACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTa < 2:5901031/56‑1 (MQ=255) cccACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCg < 2:5901309/62‑1 (MQ=255) cccACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTcc < 2:5901240/71‑1 (MQ=255) cccACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGtt < 2:5901226/74‑1 (MQ=255) cccACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGtt < 2:5901174/74‑1 (MQ=255) cccACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTg < 2:5901453/76‑1 (MQ=255) cccACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGa < 2:5901254/77‑1 (MQ=255) cccACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCa < 1:5901173/83‑1 (MQ=255) cccACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTccc < 2:5901378/88‑1 (MQ=255) cccACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTccc < 1:5901195/88‑1 (MQ=255) cccACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGc < 2:5900916/90‑1 (MQ=255) cccACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCct < 2:5901410/92‑1 (MQ=255) cccACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCa < 2:5901559/97‑1 (MQ=255) cccACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCAATCg > 1:5901717/1‑101 (MQ=255) cccACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCAATCg > 2:5901716/1‑101 (MQ=255) cccACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTG‑‑CCCCCCcgg < 2:5901072/39‑1 (MQ=255) cccACCATAATTGACGAACGCCCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGtt < 2:5900966/74‑1 (MQ=255) ccaccaTAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTg < 2:5901119/66‑1 (MQ=255) ccaccaTAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGAc < 2:5901165/77‑1 (MQ=255) caccaTAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGtt < 2:5901101/63‑1 (MQ=255) accaTAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCAATCGCtt > 2:5901721/1‑101 (MQ=255) aTAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCa > 1:5901725/1‑91 (MQ=255) tAATTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCAATCGCTTcgcg > 2:5901726/1‑101 (MQ=255) aaTTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCAATCGCTTCGCGa > 1:5901729/1‑101 (MQ=255) aTTGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCAATCGCTTCGCGAc > 2:5901732/1‑101 (MQ=255) tGACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCAATCGCTTCGCGACgg < 1:5901269/101‑1 (MQ=255) gACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCAATCGc > 1:5901739/1‑90 (MQ=255) gACGAACGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCAATCGCTTCGCGACggg > 2:5901737/1‑101 (MQ=255) aaCGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCAATCGCTTCGCGACGGGCAAc > 2:5901746/1‑101 (MQ=255) aaCGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCAATCGCTTCGCGACGGGCAAc > 1:5901743/1‑101 (MQ=255) aaCGCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCAATCGCTTCGCGACGGGCAAc > 1:5901748/1‑101 (MQ=255) gCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCAATCGCTTCGCGACGGGCAACATc > 1:5901753/1‑101 (MQ=255) gCTCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCAATCGCTTCGCGACGGGCAACATc > 2:5901751/1‑101 (MQ=255) tCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCAATCGCTTCGCGACGGGCAACATCtt < 1:5901216/101‑1 (MQ=255) tCACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCAATCGCTTCGCGACGGGCAACATCtt > 1:5901756/1‑101 (MQ=255) cACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCAATCGCTTCGCGACGGGCAACATCTTc > 2:5901762/1‑101 (MQ=255) cACTGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCAATCGCTTCGCGACGGGCAACATCTTc > 1:5901761/1‑101 (MQ=255) tGGTGC‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCAATCGCTTCGCGACGGGCAACATCTTCcac > 1:5901767/1‑101 (MQ=255) | ATGAACGCGAATATCTTCGTTTTCATCAGCCAGACCGTGAATACCGCTTGCGGTCGTGGCGTCCACTTCGCCCACCATAATTGACGAACGCTCACTGGTG‑‑CCCCCCGGGCTTGCCAGGAAACTTAACACCGGTTTGGTCCGTTTGACTATCAGTCCCGCCTCTTCAATCGCTTCGCGACGGGCAACATCTTCCAC > NC_000913/3177404‑3177598 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |