| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,873,031 | IS1 (–) +9 bp | coding (991‑999/1491 nt) | dgcJ → | putative diguanylate cyclase DgcJ |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 291401 | NA (NA) | 355 (0.980) | 161/194 | 0.2 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1873031 = | 0 (0.000) | coding (991/1491 nt) | dgcJ | putative diguanylate cyclase DgcJ | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1873039 | 0 (0.000) | 397 (1.100) | 177/194 | 0.0 | 100% | coding (999/1491 nt) | dgcJ | putative diguanylate cyclase DgcJ |
| ? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 397 total aligned reads displayed.
GTTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1872940‑1873039‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > NC_000913/1978503‑1978602 GTTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACG < 2:3430205/101‑1 TTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGG < 2:3430064/101‑1 TTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGG < 1:3430155/101‑1 TATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGT < 1:3430128/101‑1 TATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGT > 2:3430439/1‑101 ATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTA < 1:3430196/101‑1 ATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTA > 1:3430442/1‑101 ATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTA > 2:1931509/1‑101 CATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATG < 1:3429959/101‑1 TGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACT > 1:1931327/1‑101 GATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTC > 1:3430447/1‑101 ATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAA < 1:3430349/94‑1 TATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCA < 1:3429910/101‑1 TATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCA < 2:3430251/101‑1 TATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCA < 1:3430109/101‑1 ATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAA > 2:3430453/1‑101 ATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAA < 2:3430172/101‑1 TTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAAC > 1:3430454/1‑101 TTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTA < 2:3430284/101‑1 TTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTA > 2:1931870/1‑101 TTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTAT > 1:3430458/1‑101 CTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGA > 1:3430463/1‑101 TTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGAT > 1:1931537/1‑101 TTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATT > 1:1931349/1‑98 TCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG < 1:3430262/101‑1 TCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG < 2:3430035/101‑1 CACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGT > 2:3430467/1‑101 ACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTT < 1:3430087/101‑1 ACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTT < 2:3430320/101‑1 CGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT < 2:3430114/101‑1 GTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT > 1:3430471/1‑101 TCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA < 1:3430267/101‑1 CTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT > 2:3430477/1‑101 TTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG < 1:3430237/101‑1 TTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG > 1:3430478/1‑101 TCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACT < 2:3429965/82‑1 GTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT > 2:1931348/1‑95 TGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCA > 1:1931410/1‑101 TGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCA < 1:3430173/101‑1 TGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 1:3430034/99‑1 GGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG > 1:3430485/1‑101 GGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG < 1:3429932/101‑1 GAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 2:3430226/101‑1 AAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT > 2:3430487/1‑101 AAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA > 1:1931431/1‑101 AAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA < 1:3429767/101‑1 AAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAA < 2:3429891/101‑1 GCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG > 1:1931393/1‑101 GCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG < 1:3430214/101‑1 GTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC > 1:3430495/1‑101 GTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC > 2:3430493/1‑101 TTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCC < 2:3430141/101‑1 TTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCC > 1:1931371/1‑101 CTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA < 2:1932074/101‑1 CTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA > 2:514892/1‑101 TGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAT < 1:1932070/101‑1 GTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG > 1:514888/1‑101 TTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA > 2:514886/1‑101 TTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA < 2:1932062/101‑1 TGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTT > 1:514883/1‑101 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ACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCA > 2:1931433/1‑101 CGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAG < 2:1932016/101‑1 CGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAG < 1:1932017/101‑1 GCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCT < 2:1932010/101‑1 GTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCC < 2:1932003/101‑1 TTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCA > 1:6654167/1‑101 TTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCA < 1:1931999/101‑1 TAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAC > 2:6653902/1‑101 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GTTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1872940‑1873039‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > NC_000913/1978503‑1978602 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |